New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 5943657 = | 101 (1.380) | 5 (0.080) | 5/204 | NT | 6.3% | intergenic (+9/+76) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein |
? | NC_002947 | 5943722 = | 67 (1.120) | intergenic (+74/+11) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGCCCCTTGGCACTGGCCAG > NC_002947/5943574‑5943870 | gCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCGGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGa > 1:1845798/1‑150 (MQ=255) cAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGaa < 2:1830124/150‑1 (MQ=255) aGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAAc > 1:455551/1‑150 (MQ=255) 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gggTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑Ct < 2:1032782/150‑1 (MQ=255) ggTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTc > 2:1369349/1‑150 (MQ=255) tATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACt‑t > 2:1018905/1‑150 (MQ=255) tATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAAACTCTGCCGTTCATCGTTTACCCACGAGGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACt‑t > 2:1021226/1‑150 (MQ=255) tATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACt‑t > 1:1362282/1‑150 (MQ=255) gatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑Tc > 1:1941605‑M1/66‑150 (MQ=255) gagaAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACa > 1:239250/1‑132 (MQ=255) gagaAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑Tcgcg > 1:1638001/1‑150 (MQ=255) gCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCACGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGAt > 1:1100933/1‑150 (MQ=255) gggCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATtgtg < 2:1139059/150‑1 (MQ=255) 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ggtggtGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGt > 2:1658510/1‑150 (MQ=255) ggtggtGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGt < 2:1845798/150‑1 (MQ=255) gtggtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTGCCGATTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACACGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGtt < 1:593992/150‑1 (MQ=255) gtggtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGACGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGtt > 2:1669700/1‑150 (MQ=255) gtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAgg > 2:1626663/1‑95 (MQ=255) gtgCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑GTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCg > 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aGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTccc > 2:1459872/1‑150 (MQ=255) cGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCcgcg > 2:249499/1‑150 (MQ=255) aCCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACt > 2:1553597/1‑110 (MQ=255) aCCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACt < 1:1553597/110‑1 (MQ=255) aCCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAg < 1:1567702/126‑1 (MQ=255) aCCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAg > 2:1567702/1‑126 (MQ=255) cGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCgtggt > 2:1558721/1‑150 (MQ=255) gTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCgtggtg < 1:877582/150‑1 (MQ=255) gtttacccgcgaagaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAAc < 2:1565609‑M2/130‑1 (MQ=255) gtttacccgcgaagaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAAc < 2:1276603‑M2/130‑1 (MQ=255) gtttacccgcgaagaggacgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAAc < 1:1590989‑M2/130‑1 (MQ=255) ttacccgcgaagaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGc < 2:1638001‑M2/132‑1 (MQ=255) ttacccgcgaagaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGc < 1:929480‑M2/132‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCa > 1:642244‑M2/15‑99 (MQ=255) ccgcgaagaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCa < 2:642244‑M2/85‑1 (MQ=255) ccgcgaagaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGCCCCt > 2:641102‑M2/15‑150 (MQ=255) cgcgaagaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGCCCCtt < 1:131487‑M2/137‑1 (MQ=255) gcgaagaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGCCCCTTg < 1:1636427‑M2/138‑1 (MQ=255) gcgaagaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGCCCCTTg < 1:855707‑M2/138‑1 (MQ=255) gcgaagaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGCCCCTTg > 2:516694‑M2/13‑150 (MQ=255) cgaagaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGCCCCTTgg < 2:227795‑M2/139‑1 (MQ=255) gaggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGCCCCTTGGCACt < 1:560504‑M2/143‑1 (MQ=255) aggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGCCCCTTGGCACTg < 1:988872‑M2/144‑1 (MQ=255) ggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACa > 1:1368236‑M2/6‑113 (MQ=255) ggccgGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACa < 2:1368236‑M2/108‑1 (MQ=255) gGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGCCCCTTGGCACTGGCCAg < 2:258361‑M2/149‑1 (MQ=255) gGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGCCCCTTGGCACTGGCCAg > 1:1109970‑M2/2‑150 (MQ=255) | GCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTG‑CTCACACT‑TCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCGACATACTCCCGCGTGGTGCCATAACGCCCCTTGGCACTGGCCAG > NC_002947/5943574‑5943870 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |