New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 6062575 = | 74 (1.010) | 4 (0.060) | 4/240 | NT | 5.1% | coding (185/1149 nt) | alkT | rubredoxin‑NAD(+) reductase |
? | NC_002947 | 6062610 = | 78 (1.100) | coding (150/1149 nt) | alkT | rubredoxin‑NAD(+) reductase |
CTGCGCCCCCCAGGCCAGCACCAGGTCGCGGTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTGGAGTACGAACGACCATCGTCGGCGGTGATCAGCAACAGCGGCGTCTGCGCATCGAGCTTGCGAAATTCACGGGCCAGGTTGTAGCCC > NC_002947/6062430‑6062721 | cTGCGCCCCCCAGGCCAGCACCAGGTCGCGGTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCAt < 2:1082161/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCAGCACCAGGTCGCGGTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGcc < 2:1726102/150‑1 (MQ=255) gCCAGCACCAGGTCGCGGTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCg > 2:452775/1‑150 (MQ=255) tcatcggtaccggccttgcgggctacaacctggcccgtgaatttcgcaagctcgatgcgcagacgccgctgttgctgatcaccgccgacgatggtcgttcgtactccaagccgatgctttccatgggctttGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCgg < 2:17296‑M1/19‑1 (MQ=255) cAGCACCAGGTCGCGGTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGc < 1:1139959/150‑1 (MQ=255) aGCACCAGGTCGCGGTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTGCGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCg > 1:19494/1‑150 (MQ=255) gTCGCGGTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTg > 2:972602/1‑150 (MQ=255) gcgGTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCtt > 2:1816381/1‑150 (MQ=255) gcgGTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCtt > 2:1122057/1‑150 (MQ=255) cgGTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTg > 1:457624/1‑150 (MQ=255) ggTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGCTACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTgg < 1:131852/150‑1 (MQ=255) ggTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTgg > 2:1129349/1‑150 (MQ=255) ggTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTgg > 1:55020/1‑150 (MQ=255) gTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGc > 1:814913/1‑150 (MQ=255) gggctacaacctggcccgtgaatttcgcaagctcgatgcgcagacgccgctgttgctgatcaccgccgacgatggtcgttcgtactccaagccgatgctttccatgggctttGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCaaa > 1:17296‑M1/113‑150 (MQ=255) ccACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGc > 1:8172/1‑150 (MQ=255) aCGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGccc < 2:55020/150‑1 (MQ=255) ggCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCACATCAGAGAGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCAt < 2:1507950/150‑1 (MQ=255) 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1:1000848‑M1/34‑1 (MQ=255) cctggcccgtgaatttcgcaagctcgatgcgcagacgccgctgttgctgatcaccgccgacgatggtcgttcgtactccaagccgatgctttccatgggctttGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTgg > 2:1000848‑M1/104‑137 (MQ=255) tctTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGaa < 2:814913/150‑1 (MQ=255) ccgcGCCGAACAACAGGCGCTTGTGGCCTGCGTCGCTGCCGCTGCTACGGGTATGGGTGCGGATGGCGGCGTTCAATTGCTCGGCCAGGCCGGGCGCCTCGGGCATGCA‑CC‑GGCCGCCGGGCTCCTCTGGCTTGGCATAGCCCATGGaaa < 2:106519/147‑1 (MQ=255) ccGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGAAGCAAAGCGCTTTTGGACGTATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGc < 2:542595/149‑1 (MQ=255) ccGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATc < 2:1614955/150‑1 (MQ=255) aTCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGc < 1:1914592/150‑1 (MQ=255) ccACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCtt < 1:41386/150‑1 (MQ=255) ccACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCtt < 2:457624/150‑1 (MQ=255) cacaGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTg < 1:1129349/150‑1 (MQ=255) cacaGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTg < 1:123711/150‑1 (MQ=255) acaGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTgg > 1:1170189/1‑150 (MQ=255) acaGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTgg > 2:437854/1‑150 (MQ=255) acaGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCACCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTgg > 2:1355692/1‑150 (MQ=255) catccGCTTGTGGCCCGGGTCGAGGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTGGa < 1:792512/147‑1 (MQ=255) aGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGAACTCGGCCCCACATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTGGAg > 2:958328/1‑150 (MQ=255) ccGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTgg < 1:216088/119‑1 (MQ=255) ccGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTgg > 2:216088/1‑119 (MQ=255) ccGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTACTCCTTCCTGGCAAAGCTCATGGAAAGCTGCGGCTgggcggg > 2:1385218/1‑146 (MQ=255) cTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCgg < 1:407156/83‑1 (MQ=255) cTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCgg > 2:407156/1‑83 (MQ=255) tgtgGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTGGAGTacgaac < 1:945605/150‑1 (MQ=255) 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ttGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTGGAGTACGAACGACCATCGTCGGCGGTGATCAGCAACAGCGGCGTCTGCGCATCGAGCTTGCGaaa > 1:1409855/1‑150 (MQ=255) gCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTGGAGTACGAACGACCATCGTCGGCGGTGATCAGCAACAGCGGCGTCTGCGCATCGAGCTTGCGAAAtt < 2:1491158/150‑1 (MQ=255) tCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTGGAGTACGAACGACCATCGTCGGCGGTGATCAGCAACAGCGGCGTCTGCGCATCGAGCTTGCGAAATTCa > 2:142442/1‑150 (MQ=255) tCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCACATGGAAAGCATCGGCTTGGAGTACGAACGACCATCGTCGGCGGTGATCAGCAACAGCGGCGTCTGCGCATCGAGCTTGCGAAATTCa > 1:1721137/1‑150 (MQ=255) cGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTGGAGTACGAACGACCATCGTCGGCGGTGATCAGCAACAGCGGCGTCTGCGCATCGAGCTTGCGAAATTCAc < 2:287713/150‑1 (MQ=255) 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CTGCGCCCCCCAGGCCAGCACCAGGTCGCGGTATTCCACGGCCTCTTCGCCGATCCACAGCCGCTTGTGGCCCGGGTCGATGCCGCTGATACGGGTATGGGTACGGATCTCGGCGTTCAATTGCTCGGCCATGGCGCCCGCCTCGGCCATGCA‑CA‑GGCCGTCGGCGTCCTTCTGCTTGGCAAAGCCCATGGAAAGCATCGGCTTGGAGTACGAACGACCATCGTCGGCGGTGATCAGCAACAGCGGCGTCTGCGCATCGAGCTTGCGAAATTCACGGGCCAGGTTGTAGCCC > NC_002947/6062430‑6062721 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |