New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 562730 | 45 (0.620) | 5 (0.070) | 5/232 | NT | 9.9% | coding (453/621 nt) | rpsD | 30S ribosomal protein S4 |
? | NC_002947 | = 562763 | 49 (0.720) | coding (486/621 nt) | rpsD | 30S ribosomal protein S4 |
AGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAG > NC_002947/562615‑562912 | aGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCg > 2:723834‑M2/1‑149 (MQ=255) gTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCgcccagc > 2:183509‑M2/1‑143 (MQ=255) aGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTg > 2:1926582/1‑150 (MQ=255) cTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCGATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTGGTAGATCCCGAGAAATCTCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGc > 1:442353/1‑150 (MQ=255) cTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGc > 1:1567261/1‑150 (MQ=255) gCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGa > 2:659027/1‑150 (MQ=255) cacaAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAg < 1:1337952/150‑1 (MQ=255) aaaGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTgg < 2:819510/150‑1 (MQ=255) aaGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTggg < 2:1881522/150‑1 (MQ=255) aGCGATCAGCGTCGAAGGTGCGACTGTTCAGGCTCGACCTGACCATGTGCTGCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGt < 2:211043/150‑1 (MQ=255) aGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTTGGCTCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGt < 1:544150/150‑1 (MQ=255) gATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGCACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGa < 2:692044/150‑1 (MQ=255) cAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGCTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGt < 1:816867/150‑1 (MQ=255) aGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTg < 2:1127696/150‑1 (MQ=255) ggcAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCGGGGTGACGTGGTCGCAGTACGCGAGAAATCGCTGGGCCGGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTTCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAt > 2:132836/3‑150 (MQ=255) ggTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATgctgct > 2:263202/1‑150 (MQ=255) ttCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGttt > 1:1660205/1‑150 (MQ=255) aTCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgct < 2:664929/127‑1 (MQ=255) aTCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgct > 1:664929/1‑127 (MQ=255) tACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCg < 2:1643682/135‑1 (MQ=255) tACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCg > 1:1643682/1‑135 (MQ=255) cAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGt > 2:1002682/1‑113 (MQ=255) cAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGt < 1:1002682/113‑1 (MQ=255) cAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGtt > 2:962623/1‑150 (MQ=255) cAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGtt > 2:925679/1‑150 (MQ=255) gTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgct < 1:131570/113‑1 (MQ=255) gTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgct > 2:131570/1‑113 (MQ=255) tCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgctgc < 1:107002/114‑1 (MQ=255) tCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgctgc > 2:107002/1‑114 (MQ=255) gggTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAg < 2:442353/150‑1 (MQ=255) cccGTGGTTGCGGTCCTCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCGTTTCAACTGTTCGCCCAGCGGGGGCGCGTTGAATGGGTTGACGTGCATGCTGATAAAAAGTCGGGCGTGTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGAc < 2:200923/148‑1 (MQ=255) gTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgctgc < 1:890861/104‑1 (MQ=255) gTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgctgc > 2:890861/1‑104 (MQ=255) tGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGt < 2:1220860/150‑1 (MQ=255) cGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGc < 1:263202/150‑1 (MQ=255) gcgAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCa < 1:1926582/150‑1 (MQ=255) cgAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCgcaactggcccagcgatttctcgcggactgcgaccacgtcacccggacgaacttggtaggatg < 2:814572‑M2/112‑64 (MQ=255) cgAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCgcaactggcccagcgatttctcgcggactgcgaccacgtcacccggacgaacttggtaggatg > 1:814572‑M2/1‑49 (MQ=255) gaAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCgcccagcgatttctcgcggactgcgaccacgtcacccggacgaacttggtaggatggaatgtttacagtcttaccgttgacgctgatcgctttgtgcgaaacca < 2:562517‑M2/150‑105 (MQ=255) tCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCgcccagcgatttctcgcggactgcgaccacgtcacccggacgaacttggtaggatggaatgtttacagtcttaccgttgacgctgatcgctttgtgcgaaaccagctg < 1:1607147‑M2/150‑109 (MQ=255) gCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTg > 1:85993/1‑150 (MQ=255) ccAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGt > 2:956725/1‑150 (MQ=255) cAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTc < 2:1660205/150‑1 (MQ=255) aGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCgcccagcgatttctcgcggactgcgaccacgtcacccggacgaacttggtaggatggaatgtttacagtcttaccgttgacgctgatcgctttgtgcgaaaccagctgacgggactcg > 2:1607147‑M2/1‑32 (MQ=255) aTTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgctg > 2:227314/1‑64 (MQ=255) aTTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGAtgctg < 1:227314/64‑1 (MQ=255) aTTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACa > 2:536308/1‑121 (MQ=255) aTTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACa < 1:536308/121‑1 (MQ=255) ttCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCa > 1:346044/1‑150 (MQ=255) ttCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCa > 1:397409/1‑150 (MQ=255) ttCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCa > 2:1487507/1‑150 (MQ=255) tCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCaa < 1:659027/150‑1 (MQ=255) tCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCaa < 1:470970/150‑1 (MQ=255) aaGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCaa > 2:1310300/1‑148 (MQ=255) aaGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCaa < 1:1310300/148‑1 (MQ=255) aaGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGt > 2:207138/1‑150 (MQ=255) cccTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAg < 1:207138/150‑1 (MQ=255) cTTGAACTGTGCGGCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAggg < 2:1567261/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTATACTCCAAGTAAGGGCTAGaa > 1:32900/1‑150 (MQ=255) tgCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAAt < 1:962623/150‑1 (MQ=255) tgCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAAt > 2:110673/1‑150 (MQ=255) gcgcCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGct > 2:133146/1‑124 (MQ=255) gcgcCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGct < 1:133146/124‑1 (MQ=255) gcgcCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATa < 1:956725/150‑1 (MQ=255) cgcCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAg < 2:397409/150‑1 (MQ=255) | AGTCCCGTCAGCTGGTTTCGCACAAAGCGATCAGCGTCAACGGTAAGACTGTAAACATTCCATCCTACCAAGTTCGTCCGGGTGACGTGGTCGCAGTCCGCGAGAAATCGCTGGGCCAGTTGCGCATTGTTCAAGCCCTTGAACTGTGCGCCCAGCGTGGCCGCGTTGAGTGGGTTGACGTGGATGCTGCTAAAAAGTCGGGCGTTTTCAAGAACGTTCCTGCTCGCAGCGACCTGTCTGCCGACATCAACGAAAACCTGATTGTCGAGCTCTACTCCAAGTAAGGGCTAGAAAATAG > NC_002947/562615‑562912 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |