| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 669469 = | 77 (1.050) | 6 (0.090) | 6/238 | NT | 7.5% | coding (908/2355 nt) | pbpC | peptidoglycan glycosyltransferase |
| ? | NC_002947 | 669496 = | 75 (1.070) | coding (935/2355 nt) | pbpC | peptidoglycan glycosyltransferase | |||||
GCCCGGCGCCTGAACAGCGCTGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGTTTCTTTACGGCATGGCGCTGGACGATGGCC > NC_002947/669351‑669642 | gCCCGGCGCCTGAACAGCGCTGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑ag > 1:874581/1‑150 (MQ=255)gCCCGGCGCCTGAACAGCGCTGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCAGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑ag > 1:809425/1‑150 (MQ=255) ttgagggtggagccgggcgaacgtaacgagcgcaccatgtcgacatggccaaagcggcgctcatcagacaaatctatcgagcccaggtacgcgcgcacggctgccggagcgtaCCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCAt < 1:1842538‑M1/37‑1 (MQ=255) cTGAACAGCGCTGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCg < 2:131807/150‑1 (MQ=255) cTGAACAGCGCTGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCg < 1:1823654/150‑1 (MQ=255) tGAACAGCGCTGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCTCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCgg > 2:369873/1‑150 (MQ=255) tGAACAGCGCTGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTAGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCgg > 1:1845576/1‑150 (MQ=255) gAACAGCGCTGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGt < 2:950218/150‑1 (MQ=255) agccgggcgaacgtaacgagcgcaccatgtcgacatggccaaagcggcgctcatcagacaaatctatcgagcccaggtacgcgcgcacggctgccggagcgtaCCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTgcgc > 2:1842538‑M1/104‑150 (MQ=255) cgcTGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTgcgcgc > 1:171091/1‑150 (MQ=255) tGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTg > 1:778074/1‑142 (MQ=255) tGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTg < 2:778074/142‑1 (MQ=255) tGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCCGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTa > 2:206823/1‑150 (MQ=255) aGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTg > 1:1494470/1‑150 (MQ=255) tCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTggg > 1:1061205/1‑150 (MQ=255) tCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTggg < 1:1750631/150‑1 (MQ=255) cgcTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCAGGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCTGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGa < 1:295991/150‑1 (MQ=255) gcTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGCCTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCACgtt > 1:328640/1‑148 (MQ=255) 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tcgaccaccagaatggcggccgaggCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTc < 1:1444315‑M2/71‑1 (MQ=255) tcgaccaccagaatggcggccgaggCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTc > 2:1444315‑M2/26‑96 (MQ=255) TCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGTTTCTTTAc < 2:34123‑M1/150‑1 (MQ=255) TCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGTTTCTTTAc > 2:538445‑M1/1‑150 (MQ=255) TCGGCCGCAATTTGGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCCCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGTTTCTTTAc > 2:602080‑M1/1‑150 (MQ=255) gccATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGtt < 1:1442101/137‑1 (MQ=255) gccATTCTGGTGGGCTAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCCCGTACCTGGGGTCGTTAGATTTGTCTGAGGAGCGCCGCTTTGGCCAGGTCGACATGTAGCGCTCGTTGCGTGCGCCCGGCTCCGCCCTCAAGCCGTTTCTTTACGGCATg < 2:307413/150‑1 (MQ=255) gccATTCTGGTAGTAGCGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGtt > 2:1442101/1‑137 (MQ=255) ccATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCCAGGTGGCCATGTCGACATGGTGAGCTGCTTATGTCCGTCCGGCTCCACCCTCAAGCCGTTTCTTTACGGCAttg > 1:917394/1‑148 (MQ=255) aTTCTGTTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCACGCGTACCTGTGCTCTACAGATTTGTCTGAGGAGCGCAGCTTTGGCCATGTCGACATGGTTCGCTCCTTACGTTCGCGCGGCTCCACCCTAAAGGCGTGTCTTTCCGCCATggtg > 2:227895/1‑148 (MQ=255) tCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGAttt < 1:1568644/57‑1 (MQ=255) tCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGAttt > 2:1568644/1‑57 (MQ=255) tCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGtt > 2:259061/1‑107 (MQ=255) tCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGtt < 1:259061/107‑1 (MQ=255) cTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGTTTCTTTACGGCATGGCGCTg < 2:467968/150‑1 (MQ=255) gtggtCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGTTTCTTTACGGCATGGCGCTGGAc > 2:469380/1‑150 (MQ=255) tCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGTTTCTTTACGGCATGGCGCTGGACGATg < 1:206823/150‑1 (MQ=255) tCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGTTTCTTTACGGCATGGCGCTGGACGATg < 1:369873/150‑1 (MQ=255) tCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCAAAAAGGAGCCGTTTCTTTACGGCATGGCGCTGGACGATg < 1:1423912/150‑1 (MQ=255) gaggCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGTTTCTTTACGGCATGGCGCTGGACGATGGc > 2:828398‑M2/5‑150 (MQ=255) aggCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGTTTCTTTACGGCATGGCGCTGGACGATGGcc < 2:1257429‑M2/147‑1 (MQ=255) | GCCCGGCGCCTGAACAGCGCTGACAGTCCGCCGCTGATCCGTACCACGCTTGACGCTGCGCTTCAGCGGCGCCTCGAAGACTTGCTGCTGGGCTGGCGCGCACGGCTGCCGGAGCGTACCTCGGCCGCCATTCTGGTGGTCGAGGCGC‑AGAGCATGGCGGTGCGCGCGTACCTGGGCTCGATAGATTTGTCTGATGAGCGCCGCTTTGGCCATGTCGACATGGTGCGCTCGTTACGTTCGCCCGGCTCCACCCTCAAGCCGTTTCTTTACGGCATGGCGCTGGACGATGGCC > NC_002947/669351‑669642 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |