| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 675399 | 95 (1.300) | 7 (0.100) | 5/242 | NT | 7.2% | coding (303/696 nt) | PP_0577 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 675451 | 88 (1.240) | coding (251/696 nt) | PP_0577 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
AGCGTTTTTCCAGGCGCATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGGTTGCTGCCCTGGCAGCCAGCCA > NC_002947/675302‑675598 | aGCGTTTTTCCAGGCGCATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGt < 1:1319511/150‑1 (MQ=255) gttttCCAGGCGCATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTgcg > 2:1333418/2‑150 (MQ=255) tcgcATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGccagctcca > 2:1197283/2‑150 (MQ=255) atatCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTg > 2:1657478/1‑150 (MQ=255) ggcgtcgcgCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACAGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCg < 2:346910/145‑1 (MQ=255) cGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGt < 1:1509968/150‑1 (MQ=255) cTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGc < 1:340509/150‑1 (MQ=255) cTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGACAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGc < 1:154444/150‑1 (MQ=255) aaCCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGccc < 2:307935/149‑1 (MQ=255) aCCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAATGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCa > 2:858216/1‑150 (MQ=255) ccAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCAt > 2:1122477/1‑150 (MQ=255) aGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATaa < 1:1279888/150‑1 (MQ=255) aaGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCa > 1:351397/1‑150 (MQ=255) aaGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCa < 1:1663184/150‑1 (MQ=255) gTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACg > 1:1682705/1‑150 (MQ=255) caaggCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGccagctcca > 1:1939971/4‑121 (MQ=255) cAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGccagctcca < 2:1939971/121‑1 (MQ=255) cAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGccagc > 2:113876/1‑117 (MQ=255) cAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGccagc < 1:113876/117‑1 (MQ=255) 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tGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAgg > 1:880810/1‑150 (MQ=255) tGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAgg > 1:1003630/1‑150 (MQ=255) cgcgAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGt < 1:986952/150‑1 (MQ=255) gcgAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATc < 2:1012611/132‑1 (MQ=255) gcgAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATc > 1:1012611/1‑132 (MQ=255) cgggagGGGCGCAGGCCAGGCGGGTCGGGCGCACCGCTGACGACCTCAGACAGATGGACCGGAACGCCATCCAGTGTGGCGTTGTTCAACTAGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCAGAATCCCGAGCGGGCGCAGGGTag < 2:1188551/147‑2 (MQ=255) gagaGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAg < 2:1228755/150‑1 (MQ=255) gggCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTACGCACTg < 2:309687/150‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCAGGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGc > 2:878383/1‑150 (MQ=255) gcgcAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGc < 2:880810/150‑1 (MQ=255) 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tGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGGTtgc > 2:1311311/1‑150 (MQ=255) cGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAgg < 1:1727326/87‑1 (MQ=255) cGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAgg > 2:1727326/1‑87 (MQ=255) tGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGGTTGCTGCCCt < 2:1843093/150‑1 (MQ=255) gggCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGGTTGCTGCCCTg < 2:1003630/150‑1 (MQ=255) gggCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGGTTGCTGCCCTg > 1:1739528/1‑150 (MQ=255) gCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGGTTGCTGCCCTGGc < 1:1657478/150‑1 (MQ=255) cAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGGTTGCTGCCCTGGca < 2:1739528/150‑1 (MQ=255) gCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGGGCGGGCGCGGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTGCCGGGCGGCTGCTGGCCAAAGACGGGTTGCTGCCCTGGcagccggc > 2:161241/1‑150 (MQ=255) gCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGCTGGCTGCCAGGGcagcaacc < 2:623919/150‑5 (MQ=255) ccGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGCTGGCTGCCAGGGcagcaaccc < 1:133383/150‑6 (MQ=255) cGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCGGGCCACATACGTGTTGCTGCCCTGGCAgccagcca < 1:858216/150‑1 (MQ=255) gTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCgg < 1:684191/96‑1 (MQ=255) gTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCgg > 2:684191/1‑96 (MQ=255) | AGCGTTTTTCCAGGCGCATATCGGCGCTCACCAGCAAGTCGCCAGGGCCTGCGCGAGAGGGGCGCAGGCCATGCTGGTCGAGCGCACCGCTGACGGCATCGGCCAGTTGCGCCGGGTCGGCATCGACAGTGCCGCTGGGCAACTGGCCGTTGCGCCAGCTCCAGCTGCGGTAGTGCCCATAATCACGAGCGGGCGCAGGGTAAGCACTGGCGTCGAAGGTGGTGGCCGCCTGGGCGGGGGCCGGTGGTAACGGGCGGCTGCTGGCCACATACGGGTTGCTGCCCTGGCAGCCAGCCA > NC_002947/675302‑675598 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |