New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1752267 = | 75 (1.030) | 7 (0.100) | 6/236 | NT | 9.0% | coding (632/705 nt) | PP_1552 | replication protein |
? | NC_002947 | 1752290 = | 70 (1.010) | coding (655/705 nt) | PP_1552 | replication protein |
CGAGTTCGAGCTGACCACCCTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCAACGGCAACCCCGAAACCACGGTCCTC > NC_002947/1752142‑1752438 | cgagTTCGAGCTGACCACCCTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGgtgt < 1:474420/150‑1 (MQ=255) cgagTTCGAGCTGACCACCCTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGgtgt > 2:474420/1‑150 (MQ=255) gagTTCGAGCTGACCACCCTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGtgtg < 2:1747357/150‑1 (MQ=255) tgcacacacccgggatgcgcacctggcactcccggccgcgcgcggccttggtcagcttggtttgccgcatggtcagaactcctccttgccacggtgagactcccactcgaagggcaccaccacACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTgtgg > 2:1162859‑M1/124‑150 (MQ=255) gTTCGAGCTGACCACCCTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTgtggt > 1:772073/1‑150 (MQ=255) ttCGAGCTGACCACCCTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTgtggtg > 1:1201992/1‑150 (MQ=255) gAGCTGACCACCCTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGtgtg < 1:347726/144‑1 (MQ=255) gAGCTGACCACCCTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGtgtg > 2:347726/1‑144 (MQ=255) acacccgggatgcgcacctggcactcccggccgcgcgcggccttggtcagcttggtttgccgcatggtcagaactcctccttgccacggtgagactcccactcgaagggcaccaccacACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTgtgg > 1:619671‑M1/119‑145 (MQ=255) acacccgggatgcgcacctggcactcccggccgcgcgcggccttggtcagcttggtttgccgcatggtcagaactcctccttgccacggtgagactcccactcgaagggcaccaccacACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTgtgg < 2:619671‑M1/27‑1 (MQ=255) aGCTGACCACCCTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGc < 1:1558951/150‑1 (MQ=255) aGCTGACCACCCTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGc < 1:1230152/150‑1 (MQ=255) caccCTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGa > 2:920214/1‑150 (MQ=255) caccCTGGTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGTCGAGCGGTGATATGACCGCCGGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGa > 2:1070532/1‑150 (MQ=255) ccTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTg < 1:1192488/150‑1 (MQ=255) ccTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTg < 1:1330985/150‑1 (MQ=255) cTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTgg < 1:142585/150‑1 (MQ=255) cTGTTCTCGAACAACAACGCGCGCTAAGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTCACCCCCTGAGAGCCAGACAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGCCCGCCCGCGCGAGGGC‑GGGGGTGTGGTGGTCCCCTTCGAGTga < 2:1201992/150‑2 (MQ=255) 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gATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCa > 1:112850/1‑150 (MQ=255) atcatcAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGAGTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCAc > 2:1405153/1‑150 (MQ=255) atcaACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGCTTTCAACACTGGGATCAAGCCAACTGCGCCATGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGt > 1:36648/1‑150 (MQ=255) tcaACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTg < 2:1718095/150‑1 (MQ=255) tcaACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTg < 2:1487114/150‑1 (MQ=255) caACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTgg < 2:552274/150‑1 (MQ=255) ccggccgcgcgcggccttggtcagcttggtttgccgcatggtcagaactcctccttgccacggtgagactcccactcgaagggcaccaccacaccgcctgcgcgagggcggcggtGTGGTGGTGCCCTTCGAGTg > 1:1129536‑M2/116‑135 (MQ=255) ccggccgcgcgcggccttggtcagcttggtttgccgcatggtcagaactcctccttgccacggtgagactcccactcgaagggcaccaccacaccgcctgcgcgagggcggcggtGTGGTGGTGCCCTTCGAGTg < 2:1129536‑M2/20‑1 (MQ=255) aCGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCa > 1:1567577/1‑150 (MQ=255) cgcTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAaggag < 2:839366/150‑1 (MQ=255) 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tgATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCt > 1:1259137/1‑150 (MQ=255) gcttCCAACCTCCAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGGCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGa < 2:772073/148‑1 (MQ=255) tttCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCAGGACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCACACAAAGCTGAc > 1:1022594/1‑150 (MQ=255) cAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGa < 1:10273/124‑1 (MQ=255) cAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGa > 2:10273/1‑124 (MQ=255) aaCCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGCCCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAgg < 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ttATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGTGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGc > 1:1120763/1‑150 (MQ=255) ccacaccgccgccctcgcgcaggcggtGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGgtgt > 1:619671‑M2/28‑145 (MQ=255) ccacaccgccgccctcgcgcaggcggtGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGgtgt < 2:619671‑M2/118‑1 (MQ=255) ccacaccgccgccctcgcgcaggcggtGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCa > 2:1162859‑M2/28‑150 (MQ=255) aTGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCaa > 2:260330/1‑150 (MQ=255) tGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCgg > 2:1067155/1‑117 (MQ=255) tGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCgg < 1:1067155/117‑1 (MQ=255) cacaccgccgccctcgcgcaggcggtGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCaa > 1:533550‑M2/27‑64 (MQ=255) cacaccgccgccctcgcgcaggcggtGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCaa < 2:533550‑M2/38‑1 (MQ=255) gACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCAACg < 1:1405153/150‑1 (MQ=255) ACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCAACgg < 1:1668597‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCgg > 1:1033486‑M1/1‑81 (MQ=255) CCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCgg < 2:1033486‑M1/81‑1 (MQ=255) CCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCAACGGc < 2:146774‑M1/150‑1 (MQ=255) CGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCAACGGCa < 1:522365‑M1/150‑1 (MQ=255) gcgAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGCGTCTAACCGTGGCAAGGCGGAGGTCTGCCCATGCGGCAAACCGAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCAACGGCAACCCCGa > 2:105786/1‑150 (MQ=37) gAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCgg < 1:1349623/126‑1 (MQ=255) gAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCgg > 2:1349623/1‑126 (MQ=255) gAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCAACGGCAACCCCGaaa < 2:522365/150‑1 (MQ=255) aGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCAACGGCAACCCCGAAAc < 2:36648/150‑1 (MQ=255) ggcggtGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCAACGGCAACCCCGAAACCACgg < 2:1162797‑M2/144‑1 (MQ=255) tGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCAACGGCAACCCCGAAACCACGGTCCTc < 1:62409‑M2/149‑1 (MQ=255) | CGAGTTCGAGCTGACCACCCTGTTTTCGATCATCAACGGGCGCTACGAGCAAATGCGCCCCACGGTGGTGATTTCCAACCTGGAAGCCAGCCAACTGCGCCACGCCATGGGCGAGCGGTGTTATGACCGCCTGCGCGAGGGC‑GGCGGTGTGGTGGTGCCCTTCGAGTGGGAGTCTCACCGTGGCAAGGAGGAGTTCTGACCATGCGGCAAACCAAGCTGACCAAGGCCGCGCGCGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGCATCCCGGGTGTGTGCAACGGCAACCCCGAAACCACGGTCCTC > NC_002947/1752142‑1752438 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |