| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1778342 = | 49 (0.670) | 4 (0.060) | 4/236 | NT | 7.8% | intergenic (‑156/‑41) | PP_1586/PP_1587 | killer protein/NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter |
| ? | NC_002947 | 1778369 = | 48 (0.690) | intergenic (‑183/‑14) | PP_1586/PP_1587 | killer protein/NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter | |||||
TTATACGACGGGATCGCTGTAGTTCAAGTCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCCTGCTGACGCTGGTCAGCCTGTCGAAGCTGGTCGGCCGTGTGATC > NC_002947/1778221‑1778508 | ttATACGACGGGATCGCTGTAGTTCAAGTCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTaa > 2:1552226/1‑150 (MQ=255) gacgGGATCGCTGTAGTTCAAGTCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATAtt > 2:1377540/1‑150 (MQ=255) gacgGGATCGCTGTAGTTCAAGTCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATAtt > 1:185456/1‑150 (MQ=255) gacgGGATCGCTGTAGTTCAAGTCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATAtt > 1:1347362/1‑150 (MQ=255) ggATCGCTGTAGTTCAAGTCATCAATAACGGGGACTCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTCAGATTATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTc < 1:821199/150‑1 (MQ=255) cTGTAGTTCAAGTCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATgg < 2:1347362/150‑1 (MQ=255) cTGTAGTTCAAGTCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATgg > 1:346544/1‑150 (MQ=255) tGTAGTTCAAGTCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCATGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGc > 1:1159706/1‑150 (MQ=255) ttCAAGTCTTCAATAACGGGCACGCGCCTCGCAAGCGCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTGACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGt > 1:155172/1‑150 (MQ=255) ttCAAGTCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGaaac < 2:1005031/150‑4 (MQ=255) gTCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGc > 2:843908/1‑150 (MQ=255) tCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGtt > 1:1171244/1‑131 (MQ=255) tCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGtt < 2:1171244/131‑1 (MQ=255) ttCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCtt < 1:843908/150‑1 (MQ=255) aTAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCaa < 2:824326/129‑1 (MQ=255) aTAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCaa > 1:824326/1‑129 (MQ=255) ggCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGttt > 2:1604448/1‑150 (MQ=255) aCGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTg < 1:1377540/150‑1 (MQ=255) cgcgACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTgg < 1:1552226/150‑1 (MQ=255) gACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTc < 1:1870335/150‑1 (MQ=255) tCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTcaca > 2:1904176/1‑150 (MQ=255) cGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACaa > 2:609538/1‑150 (MQ=255) aGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCATCTGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGa < 1:1891581/150‑1 (MQ=255) gCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGaa > 1:454740/1‑150 (MQ=255) ttcctttgtgaaccagaaacgatagcaaggcgaaacgtcgccattggaacaatatgttAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTaa > 1:867115‑M1/59‑87 (MQ=255) ttcctttgtgaaccagaaacgatagcaaggcgaaacgtcgccattggaacaatatgttAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTaa < 2:867115‑M1/29‑1 (MQ=255) acaTCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCg > 1:1805587/1‑150 (MQ=255) gctgGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCa < 1:609538/150‑1 (MQ=255) gggTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTTCTATCTTTTCTTGGTCACAAAGGAGTCTTTCCCGGATGCAGTc > 2:100210/1‑150 (MQ=255) tATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGc < 2:185456/150‑1 (MQ=255) catGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGTCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTacac < 1:755726/150‑1 (MQ=255) catGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTacac < 1:1604448/150‑1 (MQ=255) catGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGCATCATGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTacac < 1:100210/150‑1 (MQ=255) tACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATAGTCTCGTCGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTtc < 2:155172/150‑1 (MQ=255) aCATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCGATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTtct > 1:134731/1‑150 (MQ=255) atTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGTCTACACCGTTCTCATc < 2:346544/150‑1 (MQ=255) atTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATc < 2:373361/150‑1 (MQ=255) atTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATc < 2:925839/150‑1 (MQ=255) tCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCAGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCct > 2:1407777/1‑150 (MQ=255) ccccGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGt < 2:624859/98‑1 (MQ=255) ccccGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGt > 1:624859/1‑98 (MQ=255) ccccGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCctgc > 2:1825225/1‑150 (MQ=255) aCCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTtctc > 2:619073/1‑136 (MQ=255) aCCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTtctc < 1:619073/136‑1 (MQ=255) aCCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCCTGCTGACGCt < 1:616441/150‑1 (MQ=255) gACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCCTGCTGACGCTGGTCAg > 2:1562661/1‑150 (MQ=255) tATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCCTGCTGACGCTGGTCAGCCt < 1:1562661/150‑1 (MQ=255) ttagcggcgaccggcggttcggggccgctAACATATTGTTCCAATGGCGACGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGaa > 1:867115‑M2/30‑87 (MQ=255) ttagcggcgaccggcggttcggggccgctAACATATTGTTCCAATGGCGACGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGaa < 2:867115‑M2/58‑1 (MQ=255) cAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCCTGCTGACGCTGGTCAGCCTGTCGAAg < 2:1159706/150‑1 (MQ=255) gcggcgaccggcggttcggggccgctAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAg < 1:783617‑M2/59‑1 (MQ=255) gcggcgaccggcggttcggggccgctAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAg > 2:783617‑M2/27‑85 (MQ=255) GCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCCTGCTGACGCTGGTCAGCCTGTCGAAGCt < 2:568450‑M1/150‑1 (MQ=255) GCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCCTGCTGACGCTGGTCAGCCTGTCGAAGCt < 2:865220‑M1/150‑1 (MQ=255) ccGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCCTGCTGACGCTGGTCAGCCTGTCGAAGCTGGTCgg > 2:147855/1‑150 (MQ=255) gAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCCTGCTGACGCTGGTCAGCCTGTCGAAGCTGGTCGGcc < 1:147855/150‑1 (MQ=255) gAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCCTGCTGACGCTGGTCAGCCTGTCGAAGCTGGTCGGcc > 2:1231656/1‑150 (MQ=255) ggTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCCTGCTGACGCTGGTCAGCCTGTCGAAGCTGGTCGGCCGTGTGATc < 2:454740/150‑1 (MQ=255) ccgctAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTacac < 1:1769068‑M2/85‑1 (MQ=255) ccgctAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTacac > 2:1769068‑M2/6‑90 (MQ=255) ctAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGtt < 2:1028088‑M2/89‑1 (MQ=255) ctAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGtt > 1:1028088‑M2/3‑91 (MQ=255) | TTATACGACGGGATCGCTGTAGTTCAAGTCTTCAATAACGGGCACGCGACTCGCAAGCTCCGGTCACATCTGCTGGGTATCATCATGTTACATATTCCCCCGTCACCTGCGACTATCGTGCAGCGGCCCCGAACCGCCGGTCGCCGCTAACATATTGTTCCAATGGCGATGTTTCGCCTTGCTATCGTTTCTGGTTCACAAAGGAAGCTTTCCCGGATGCAGTCCGCCTACACCGTTCTCATCCTGCTGACGCTGGTCAGCCTGTCGAAGCTGGTCGGCCGTGTGATC > NC_002947/1778221‑1778508 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |