New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 2396139 = | 84 (1.190) | coding (3561/3636 nt) | PP_2100 | two‑component system sensor protein |
TTGCGCAGACGACGGGAGCGGTTTGTGGCCATGAAACAATCCTCTTAGGTAATAACGCCGCGCAGTCTACCAGTTAACACGTGTGGTTGCCTGCCTGAGTATCCGTGCTTGTGGCCAATTCCTTGGCCAGGGCACGTTCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAAT > NC_002947/2395991‑2396282 | tgacctgatggcggcctgtgaagccctcgaggccagcgacttgcccactgcccaggtgcgcctgcggcgccaggcactggcacggcatatgTGCCTGAGTATCCGTGCTTGTGGCCAATTCCTTGGCCAGGGCACGTTCCACTCGGcaca > 2:1515085‑M1/92‑150 (MQ=255) cgGGAGCGGTTTGTGGCCATGAAACAATCCTCTTAGGTAATAACGCCGCGCAGTCTACCAGTTAACACGTGTGGTTGCCTGCCTGAGTATCCGTGCTTGTGGCCAATTCCTTGGCCAGGGCACGTTCCACTCGGCACATATGCCGTGCCa > 1:688261/1‑150 (MQ=255) gCGGTTTGTGGCCATGAAACAATCCTCTTAGGTAATAACGCCGCGCAGTCTACCAGTTAACACGTGTGGTTGCCTGCCTGAGTATCCGTGCTTGTGGCCAATTCCTTGGCCAGGGCACGTTCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGcc > 2:816726/1‑150 (MQ=255) 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cAGGGCACGTTCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTtgtg > 1:359469/1‑150 (MQ=255) aGGGCACGTTCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTgg > 1:741611/1‑150 (MQ=255) ggCACGTTCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCTGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGc > 2:1574157/1‑150 (MQ=255) ggCACGTTCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGc < 2:138775/150‑1 (MQ=255) ggCACGTTCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGc < 1:464034/150‑1 (MQ=255) ggCACGTTCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGc < 1:88125/150‑1 (MQ=255) ggCACGCTCCACTCGGCAAATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCCCCGCAGGTGAACTTGGACAGTGGGAAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGAACCTTGTGGGc < 2:839919/150‑1 (MQ=255) cACGTTCCACTCGGCACATATGCCGTGGTGAAGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCt > 1:1506816/1‑150 (MQ=255) cGTTCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGc < 1:84590/150‑1 (MQ=255) gTTCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCt > 2:1348464/1‑150 (MQ=255) ttCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTc > 2:922492/1‑150 (MQ=255) ttCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTc > 2:1910668/1‑150 (MQ=255) ttCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTc < 2:1040860/150‑1 (MQ=255) tCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCg > 2:609835/1‑150 (MQ=255) ccACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCgg < 1:1724129/150‑1 (MQ=255) cACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGc < 2:1296459/150‑1 (MQ=255) aCTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGATGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGCTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCa > 2:91953/1‑150 (MQ=255) tCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAAt > 2:1481551/1‑150 (MQ=255) gcaCATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTgg < 2:1742739‑M2/130‑1 (MQ=255) gcaCATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTgg > 1:1742739‑M2/4‑133 (MQ=255) | TTGCGCAGACGACGGGAGCGGTTTGTGGCCATGAAACAATCCTCTTAGGTAATAACGCCGCGCAGTCTACCAGTTAACACGTGTGGTTGCCTGCCTGAGTATCCGTGCTTGTGGCCAATTCCTTGGCCAGGGCACGTTCCACTCGGCACATATGCCGTGCCAGTGCCTGGCGCCGCAGGCGCACCTGGGCAGTGGGCAAGTCGCTGGCCTCGAGGGCTTCACAGGCCGCCATCAGGTCAGGGGCTTCCAGCATGCGCGCGGCGCTGAGCACCTTGTGGGCCTGCTCGGCAAT > NC_002947/2395991‑2396282 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |