| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 3359306 | 63 (0.860) | 4 (0.060) | 4/226 | NT | 5.8% | coding (420/912 nt) | PP_2955 | CorA family magnesium/cobalt transporter |
| ? | NC_002947 | = 3359316 | 73 (1.100) | coding (410/912 nt) | PP_2955 | CorA family magnesium/cobalt transporter | |||||
GGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTACAAC > NC_002947/3359174‑3359464 | ggCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCgcaggtg > 1:605275‑M2/1‑143 (MQ=255)ggCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCgcaggtg < 1:491424‑M2/150‑8 (MQ=255) gCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCgcaggtgg < 1:1569475‑M2/150‑9 (MQ=255) cTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCgcaggtggc > 2:1569475‑M2/1‑141 (MQ=255) cACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAg < 1:86377/150‑1 (MQ=255) cATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGAt < 2:491424/150‑1 (MQ=255) tGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCa < 1:843006/150‑1 (MQ=255) tttGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGc > 1:167918/1‑150 (MQ=255) tttGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGc > 2:1179424/1‑150 (MQ=255) ttGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGAACGCt > 2:717000/1‑150 (MQ=255) aTGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTca < 2:167918/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTcagc < 1:1685835/150‑1 (MQ=255) ggCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTcagc > 2:1333054/1‑150 (MQ=255) gTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTca > 2:884719/1‑139 (MQ=255) gTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTca < 1:884719/139‑1 (MQ=255) tACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTACTGATTGTCCCTGGACCGAATAAACTGCAGCGGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGTAGGTA‑GCCCAGGTTGTGGTGACCGCTTTCAGCAGGCATAGcccta > 2:780053/1‑147 (MQ=255) cAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGcac > 1:257436/1‑150 (MQ=255) cAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGGTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCTCCATCAGcac > 1:1852447/1‑150 (MQ=255) gCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATc < 2:1009317/150‑1 (MQ=255) tttCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GGCCAGGTAGTGAt > 2:1299113/1‑114 (MQ=255) tttCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGAt < 1:1299113/114‑1 (MQ=255) ttCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAg < 1:1179424/150‑1 (MQ=255) gCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTgg < 1:88802/150‑1 (MQ=255) gCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGAACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑ACCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTgg > 1:1850289/1‑150 (MQ=255) gCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATg < 2:1881651/105‑1 (MQ=255) gCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATg > 1:1881651/1‑105 (MQ=255) tGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCa > 1:329565/1‑150 (MQ=255) gTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGTCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCAt < 1:319816/150‑1 (MQ=255) gTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCAt > 2:576895/1‑150 (MQ=255) aCATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGc > 2:1513867/1‑150 (MQ=255) aTCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCg > 1:688146/1‑150 (MQ=255) cTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGc > 1:812008/1‑150 (MQ=255) cTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGc < 2:329565/150‑1 (MQ=255) tGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGcc > 1:1074101/1‑150 (MQ=255) aCCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATc > 2:632081/1‑125 (MQ=255) aCCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATc < 1:632081/125‑1 (MQ=255) cAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCg < 1:958456/150‑1 (MQ=255) ggTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGt > 1:1095507/1‑150 (MQ=255) cTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTAGC‑GACCAGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTAc < 1:717000/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGAGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTAcc > 1:1459198/1‑150 (MQ=255) gTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCCAATAGTGTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTAcccc > 1:1807210/1‑150 (MQ=255) gTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGAGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGTTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTAcccc > 1:1660174/1‑150 (MQ=255) ccATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGa < 2:234487/150‑1 (MQ=255) ccATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGa < 1:1333054/150‑1 (MQ=255) tGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCTCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTa < 2:1852447/150‑1 (MQ=255) aCCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTcagcc < 1:1316633/83‑1 (MQ=255) aCCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTcagcc > 2:1316633/1‑83 (MQ=255) cGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTAc > 1:1160546/1‑134 (MQ=255) cGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTAc < 2:1160546/134‑1 (MQ=255) cGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAg > 2:1680267/1‑150 (MQ=255) gATCCAACTGCAGCTGGATTTCGCGCACCCCCTGCTTTACCACCCGCAGGTT‑ACCCAGGTACTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTGCTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGt > 2:1888449/1‑150 (MQ=255) cGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTgg < 1:358878/150‑1 (MQ=255) 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cTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTggcggc < 2:1372000/126‑1 (MQ=255) cTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTggcggc > 1:1372000/1‑126 (MQ=255) gCTTTACCACCCgcaggtggcccgcgaaatccagctgcagttcgatcggtccatggacaaccagcacctggtgcagatgtacagccttagcgaaagcctggtgtattacgtcaacgccattcaaagcaatggcgccgtgctagccctgct > 1:1632153‑M2/1‑12 (MQ=255) cTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCt < 2:1850289/150‑1 (MQ=255) tttACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCAGCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTg > 1:535361/1‑150 (MQ=255) ttACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGa < 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tACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAg < 2:775216/150‑1 (MQ=255) caccCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTAc > 2:1939499/1‑150 (MQ=255) caccCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTAc > 1:1215882/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGGACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGGTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTACAAc > 1:608657/1‑150 (MQ=255) | GGCTAGCACGGCGCCATTGCTTTGAATGGCGTTGACGTAATACACCAGGCTTTCGCTAAGGCTGTACATCTGCACCAGGTGCTGGTTGTCCATGGACCGATCGAACTGCAGCTGGATTTCGCGGGCCACCTGCTTTACCACCCGCAGGTG‑GCCCAGGTAGTGATGCACGCTTTCAGCCAGCATCGCCATCAGCACATCCAGTGGGGTACTCATGCCGGCCTGCCGGTCTACCCCGGCGAGTAGCGAGTTGGCGGCGCAGATCACCACCAGGCGCTTTTCGCTGAGTACAAC > NC_002947/3359174‑3359464 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |