New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 3464300 = | 100 (1.370) | 6 (0.100) | 6/200 | NT | 7.5% | coding (101/1929 nt) | PP_3078 | ABC transporter substrate‑binding protein |
? | NC_002947 | 3464387 = | 68 (1.160) | coding (14/1929 nt) | PP_3078 | ABC transporter substrate‑binding protein |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TGGGTGGGAGCGGCCTGGACCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCATCTGGCCTGG > NC_002947/3464240‑3464536 | tgggtgggAGCGGCATGTACCGTAAAGCCTATGCGCGAAAATACAGGCCCCACCAATACTTGTGGGTGCGGGTTTACCAGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTACACCCGCTCCCACAggg < 1:719305/150‑1 (MQ=255) gtgggAGCGGCCTGGACCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAgggggg > 1:1636098/1‑150 (MQ=255) tgggAGCGGCCTGGACCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACCAGCCCGCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGc > 1:450663/1‑150 (MQ=255) tgggAGCGGCCTGGACCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTCTGGGAGCGGGGTTACTCTCAAAGGTGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGc > 1:1690422/1‑150 (MQ=255) ccTGGACCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCg < 2:65108/150‑1 (MQ=255) gACCGTAAAGCCTATGCCCGAAAATACAAGCCCCCACAGTGCTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTCCGCAGGTAAAAACGCTCCAAAAGGGGGACTGATCACCGGGAg < 2:1574742/150‑1 (MQ=255) aCCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTCACCCCGCTCCCATAGGGGGGCTGATCACCGGGAgg < 1:1798835/150‑1 (MQ=255) aCCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAgggggg < 2:1697647/135‑1 (MQ=255) aCCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAgggggg > 1:1697647/1‑135 (MQ=255) ccGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAggg < 2:262154/150‑1 (MQ=255) cGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAgggg > 2:344719/1‑150 (MQ=255) aaGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTGTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGaa > 1:1597176/1‑150 (MQ=255) aGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAAt < 2:866296/150‑1 (MQ=255) ccTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCa > 1:1571275/1‑150 (MQ=255) ccTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCa < 2:1856176/150‑1 (MQ=255) tATGCACGACAACACAGGCCCTAACTTTACTTGTGTGGGGGGTTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCAGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGt < 2:1870857/150‑1 (MQ=255) tATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGt > 2:929264/1‑150 (MQ=255) aCGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTgg < 2:1722176/150‑1 (MQ=255) aCGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAgggggg < 1:1457613/119‑1 (MQ=255) aCGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAgggggg > 2:1457613/1‑119 (MQ=255) aCGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTgg > 2:461691/1‑150 (MQ=255) gAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAgggg > 2:1421117/1‑134 (MQ=255) gAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAgggg < 1:1421117/134‑1 (MQ=255) aaaTACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCTCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCCggcggc < 2:1141315/150‑1 (MQ=255) cAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTc < 2:775597/150‑1 (MQ=255) aaGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCa > 2:411121/1‑150 (MQ=255) gCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACt > 1:63480/1‑150 (MQ=255) cccACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACGCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGaa < 1:1853193/125‑1 (MQ=255) cccACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAgg < 1:122149/119‑1 (MQ=255) cccACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAgg > 2:122149/1‑119 (MQ=255) acaATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTg > 1:97639/1‑120 (MQ=255) aaTACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCcagcag < 2:1705327/150‑1 (MQ=255) aaTACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCcagcag > 1:595605/1‑150 (MQ=255) aTACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAgg > 1:1804158/1‑150 (MQ=255) aTACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAgg > 1:494895/1‑150 (MQ=255) cTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAggtgg > 2:1884429/1‑150 (MQ=255) ttGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTc > 1:1172713/1‑139 (MQ=255) ttGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTc < 2:1172713/139‑1 (MQ=255) TGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTa > 1:878461‑M1/1‑150 (MQ=255) TGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTa > 2:726405‑M1/1‑150 (MQ=255) 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gtctggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGa > 2:1266172/1‑150 (MQ=255) tggCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCa > 1:773415/1‑150 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGt < 2:168837/104‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACgg > 2:878003/1‑150 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAggtgg > 1:421445/1‑88 (MQ=255) ctctTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCa < 1:1389938/119‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGgtg > 1:523823/1‑150 (MQ=255) ctTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGgtgt < 2:141840/150‑1 (MQ=255) taaacccgctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCt > 2:1497626‑M2/17‑150 (MQ=255) aaacccgctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCtt < 2:1082102‑M2/135‑1 (MQ=255) acccgctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGa < 1:571061‑M2/137‑1 (MQ=255) acccgctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGa > 2:683281‑M2/14‑150 (MQ=255) ccgctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTa < 1:515017‑M2/63‑1 (MQ=255) ccgctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGAcc > 1:400507‑M2/12‑150 (MQ=255) cgctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCa > 2:1082920‑M2/11‑150 (MQ=255) gctcccacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTg > 1:1147404‑M2/10‑45 (MQ=255) cacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTggg > 2:755380‑M2/5‑78 (MQ=255) cacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTggg < 1:755380‑M2/74‑1 (MQ=255) cacaGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGATGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCATCTGGc > 1:1473127‑M2/5‑150 (MQ=255) aGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCATCTGGCCTg < 2:961947‑M2/149‑1 (MQ=255) aGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTACATTGGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCATCTGGCCTg < 1:1884429‑M2/149‑1 (MQ=255) ggggggCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCATCTGGCCTgg < 2:400507/150‑1 (MQ=255) | TGGGTGGGAGCGGCCTGGACCGTAAAGCCTATGCACGAAAATACAAGCCCCCACAATACTTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCGGAGCAGGCAACGAGGTTGTCTGGTCTGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACAGGGGGGCTGATCACCGGGAGGGGTGAATCAGTCCTGGCGGCTGGTCACTTCCAGCAGGTGGTAGCCGAACTGGGTCTTCACCGGGCCTTGCACGGTGTTGACCGGTGCGCTGAAGACCACGGTGTCGAATTCCTTGACCATCTGGCCTGG > NC_002947/3464240‑3464536 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |