New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4043100 = | 67 (0.920) | 4 (0.060) | 4/244 | NT | 5.9% | coding (688/978 nt) | PP_3564 | AraC family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 4043129 = | 62 (0.860) | coding (659/978 nt) | PP_3564 | AraC family transcriptional regulator |
CAGCCACCAGGCCTTGGTGCTCATACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGCAAGCGCGTGACAGTAGTGCAACGGCCAGATCTATGG > NC_002947/4042981‑4043273 | cAGCCACCAGGCCTTGGTGCTCATACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTg > 1:1202963/1‑150 (MQ=255) aGCCACCAGGCCTTGGTGCTCATACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTgg > 2:1883175/1‑150 (MQ=255) ccaccaGGCCTTGGTGCTCATACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGgcg < 2:984950/150‑1 (MQ=255) caccaGGCCTTGGTGCTCATACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGgcgc > 2:828250/1‑150 (MQ=255) ggCCTTGGTGCTCATACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGGTGGCGCATGAGTGCTTGCGCCCGCTAGACCGGGCGCCCCTg > 2:1385583/1‑150 (MQ=255) cTTGGTGCTCATACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACa > 1:1436610/1‑150 (MQ=255) ttGGTGCTCATACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGTCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACaa < 2:815637/150‑1 (MQ=255) tGCTCATACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGACAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCAc > 2:980638/1‑150 (MQ=255) gCTCATACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCAcc < 2:234215/150‑1 (MQ=255) cATACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAg < 1:454510/150‑1 (MQ=255) tACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCt < 1:684189/150‑1 (MQ=255) cGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCa > 2:502301/1‑150 (MQ=255) tggcCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCagcgagc < 1:1701618/150‑1 (MQ=255) ggctggctgacatgctggtggacgagacccgcgacagccgtcacgccttgcgctcgctggagctgggtgcttgtcaggggcgccaGGCGCATCATTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGgc > 2:512106‑M1/86‑118 (MQ=255) ggctggctgacatgctggtggacgagacccgcgacagccgtcacgccttgcgctcgctggagctgggtgcttgtcaggggcgccaGGCGCATCATTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGgc < 1:512106‑M1/33‑1 (MQ=255) gcCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAgcgc < 2:1095657/150‑1 (MQ=255) ggAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTCATCACGCAGCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAgg > 1:1089063/1‑150 (MQ=255) gAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGc > 2:1470438/1‑150 (MQ=255) aCTGCCGGTCCCGTTGACGCCGCATGCTCCCCAGGTCGGCGGCCAGCTGCTCCCCGGATAACGTGGCCTTTAGTGGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGt < 1:35299/150‑1 (MQ=255) aCTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGt < 1:502301/150‑1 (MQ=255) ccGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTgg < 1:164964/106‑1 (MQ=255) ccGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTgg > 2:164964/1‑106 (MQ=255) ccGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACg > 1:1721743/1‑150 (MQ=255) atgctggtggacgagacccgcgacagccgtcacgccttgcgctcgctggagctgggtgcttgtcaggggcgccaGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTgg > 1:689634‑M1/75‑106 (MQ=255) atgctggtggacgagacccgcgacagccgtcacgccttgcgctcgctggagctgggtgcttgtcaggggcgccaGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTgg < 2:689634‑M1/32‑1 (MQ=255) gTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCt < 2:1695104/150‑1 (MQ=255) ttGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCAccc > 1:693936/1‑115 (MQ=255) ttGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCAccc < 2:693936/115‑1 (MQ=255) ttGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTcgcg < 2:1366829/150‑1 (MQ=255) tGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCgg < 1:760373/150‑1 (MQ=255) aCGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGt < 2:1475863/150‑1 (MQ=255) cGCCGGCTGATGCCCAGTTATGAGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGtc < 2:893010/150‑1 (MQ=255) gCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGtct > 1:1285447/1‑150 (MQ=255) cGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCg < 1:1470438/150‑1 (MQ=255) gATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTccac < 1:1883175/150‑1 (MQ=255) gATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTccac < 1:1171068/150‑1 (MQ=255) tGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTccacca > 2:798317/1‑150 (MQ=255) cccAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCggg > 1:1702127/1‑136 (MQ=255) cccAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCggg < 2:1702127/136‑1 (MQ=255) cccAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGc > 1:1187300/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCAACTTTCGCCCCTGACAAGCACACAGCTCTCGTCCGGACAAGGCTTTACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCa > 1:1885225/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCAAGGCCAACGGCGTGCGCAGGGGGTGGCGGATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAACACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGAGAGGGCTGTCGCGAGTATTGTCCCCCAGCa > 1:370932/1‑150 (MQ=255) tCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTca < 2:1436610/150‑1 (MQ=255) cTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTcag < 2:1285447/150‑1 (MQ=255) tGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGtacgc > 1:1160045/1‑146 (MQ=255) gCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTcagcc > 1:126375/1‑150 (MQ=255) ctgctCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCttt < 2:1721743/150‑1 (MQ=255) tgctCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTg > 1:252368/1‑150 (MQ=255) ctCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGa < 1:1860870/149‑1 (MQ=255) ctCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGa > 2:1860870/1‑149 (MQ=255) cGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCAc < 2:1187300/150‑1 (MQ=255) ccAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGCGCGCACggg > 1:82346/1‑150 (MQ=255) ccAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACggg > 1:1914366/1‑150 (MQ=255) cAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGt > 2:170816/1‑150 (MQ=255) ggCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGc < 2:126375/150‑1 (MQ=255) cGTGCCCAGGGGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCTCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCTCGCGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGccc < 2:89113/150‑1 (MQ=255) tGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGCCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGc > 1:3114/1‑150 (MQ=255) ccAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGccc < 2:1446311/145‑1 (MQ=255) ccAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGccc > 1:1446311/1‑145 (MQ=255) gccaggtgcagcgggcgcaagcaatgatgcgccTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCagccagcc < 1:512106‑M2/85‑1 (MQ=255) gccaggtgcagcgggcgcaagcaatgatgcgccTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCagccagcc > 2:512106‑M2/34‑118 (MQ=255) ccaggtgcagcgggcgcaagcactgatgcgccTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCAt > 1:689634‑M2/33‑106 (MQ=255) ccaggtgcagcgggcgcaagcactgatgcgccTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCAt < 2:689634‑M2/74‑1 (MQ=255) GGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGCAAGCGCGTGACa > 1:798317‑M1/1‑150 (MQ=255) aTCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCTAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGCAAGCGCGTGACagtagt < 1:828250/150‑1 (MQ=255) aTCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCAc < 2:41559/121‑1 (MQ=255) aTCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCAc > 1:41559/1‑121 (MQ=255) gtcaggggcgcCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGCAAGCGCGTGACAGTAGTGCa > 1:669033/8‑150 (MQ=255) tGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGCAAGCGCGTGACAGTAGTGCAAc > 2:1168433/1‑150 (MQ=255) cTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAg < 1:811402/56‑1 (MQ=255) cTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAg > 2:811402/1‑56 (MQ=255) ttGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGCAAGCGCGTGACAGTAGTGCAACGGc < 1:1168433/150‑1 (MQ=255) tGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGCAAGCGCGTGACAGTAGTGCAACGGcc < 2:252368/150‑1 (MQ=255) gcCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGCAAGCGCGTGACAGTAGTGCAACGGCCAgc > 2:381215/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGCAAGCGCGTGACAGTAGTGCAACGGCCAGATc > 1:379145/1‑150 (MQ=255) ccGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGCAAGCGCGTGACAGTAGTGCAACGGCCAGATc > 2:296374/1‑150 (MQ=255) gCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCGAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGCAAGCGCGTGACAGTAGTGCAACGGCCAGATCTATgg < 2:379145/150‑1 (MQ=255) | CAGCCACCAGGCCTTGGTGCTCATACCGTGGCTGGCCTGGAACTGCCGGTCCAGTTGACGCCGGCTGATGCCCAGTTCTGCGGCCAGCTGCTCCACGGCCAACGGCGTGCCCAGGTGATGGCGCATCAGTGCTTGCGCCCGCTGCACCTGGCGCCCCTGACAAGCACCCAGCTCCAGCGAGCGCAAGGCGTGACGGCTGTCGCGGGTCTCGTCCACCAGCATGTCAGCCAGCCCTTTGAGCGCACGGGTTCGCCCGCAAGCGCGTGACAGTAGTGCAACGGCCAGATCTATGG > NC_002947/4042981‑4043273 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |