New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4240195 = | 73 (1.000) | 5 (0.080) | 5/224 | NT | 7.2% | coding (139/900 nt) | PP_3717 | LuxR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 4240236 = | 63 (0.960) | coding (98/900 nt) | PP_3717 | LuxR family transcriptional regulator |
GCCCGCCCCTGGCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGC > NC_002947/4240089‑4240385 | gcccgcccCTGGCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCAtt < 1:1104884/150‑1 (MQ=255) gcccgcccCTGGAACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCAtt < 2:1764373/150‑1 (MQ=255) ccgcccCTGGCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATtgt < 2:459880/150‑1 (MQ=255) ccgcccCTGGCACTCAAGGCTGAGCATCATCGACTCCACCGGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACCTACTCCAGCGTCTCGGGGGTTCCACCATGGGCCAGGGCGCCCTGCAAC‑‑‑GCCACGTACCACTGCTGCAGCGCGCCCATtgt < 1:730439/150‑1 (MQ=255) gccgatgaacctggcgcaaagggctgtgcgcgggcgtgcctggcaggctagactgccgggcatgacccaggcctctcccgataccccgcttaccctcacaatGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGa < 2:258868‑M1/48‑1 (MQ=255) gcccCTGGCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGa > 2:1580471/1‑150 (MQ=255) ccccTGGCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAg < 1:277295/150‑1 (MQ=255) cccTGGCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAgg < 2:62280/150‑1 (MQ=255) cTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCAGAAACAGGCTGCAGCACGGCTTGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGTCCATTGTGAGGGTAAGCgg < 1:1198520/150‑1 (MQ=255) tggcgcaaagggctgtgcgcgggcgtgcctggcaggctagactgccgggcatgacccaggcctctcccgataccccgcttaccctcacaatgggcgcgctgcaacgccacgtgccactgctgcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCggg < 1:258868‑M2/18‑1 (MQ=255) cTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCg < 2:1785820/150‑1 (MQ=255) atcatcatcGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGga > 2:1178958/1‑150 (MQ=255) catcatcGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGgaga > 1:1080292/1‑150 (MQ=255) catcatcGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGgaga < 1:500632/150‑1 (MQ=255) atcatcGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGagag > 2:1054314/1‑150 (MQ=255) tcatcGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTGGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCAAGTGCCACTGGTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAgg > 2:842418/1‑150 (MQ=255) catcGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGc < 2:175446/150‑1 (MQ=255) catcGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACAATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGc < 2:1702875/150‑1 (MQ=255) tcGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCt > 2:1246021/1‑150 (MQ=255) tcGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCt > 2:203488/1‑150 (MQ=255) gACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGGGATCGGGGGATCGGGAGAGGCCTgg > 2:1901249/1‑150 (MQ=255) tCCACCTGCACCAACTGGTCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCgg < 1:670591/128‑1 (MQ=255) tCCACCTGCACCAACTGGTCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCgg > 2:670591/1‑128 (MQ=255) ccACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCa < 1:1729316/150‑1 (MQ=255) cACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCAt < 1:1054314/150‑1 (MQ=255) aCCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGa > 1:1706970/1‑115 (MQ=255) aCCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGa < 2:1706970/115‑1 (MQ=255) aCCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCCTg < 2:1295717/150‑1 (MQ=255) cACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCgg < 1:963057/150‑1 (MQ=255) ccAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCa < 1:572224/150‑1 (MQ=255) cAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAgg > 2:986561/1‑109 (MQ=255) cAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAgg < 1:986561/109‑1 (MQ=255) aaCTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGt > 2:697228/1‑110 (MQ=255) aaCTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGt < 1:697228/110‑1 (MQ=255) aaCTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGt < 1:203488/150‑1 (MQ=255) ggCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAg < 2:1080292/150‑1 (MQ=255) gCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGc > 2:1780815/1‑150 (MQ=255) cGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCt > 2:561940/1‑150 (MQ=255) ggCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCTGCAGTCTAGCCTGCCa < 1:1246021/150‑1 (MQ=255) gCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCTGGCAGGCTAGACTGccgg < 2:276536/150‑3 (MQ=255) gCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGAAGCGCGCCCATTGCGAGGCTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAg < 1:237581/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCgg < 2:1707458/103‑1 (MQ=255) cAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCgg > 1:1707458/1‑103 (MQ=255) aGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGc < 1:1780815/150‑1 (MQ=255) cGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGAGGTAAGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAgatcg > 1:990964/1‑146 (MQ=255) gCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGccc < 2:966252/115‑2 (MQ=255) 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tcacaatgggcgcgctgcagcagtggcacgtggcgttgcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGc < 2:258868‑M2/102‑1 (MQ=255) GCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCTGGCAGGCTAGACTGCCGggcatga > 2:1941586‑M1/1‑103 (MQ=255) GCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCTGGCAGGCTAGACTGCCGggcatga < 1:1941586‑M1/106‑4 (MQ=255) gcgctgcagcagtggcacgtggcgttgcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCAt < 1:459928‑M2/41‑1 (MQ=255) gcgctgcagcagtggcacgtggcgttgcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCAt > 2:459928‑M2/38‑78 (MQ=255) CAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAgc > 2:1516383‑M1/1‑150 (MQ=255) cagcagtggcacgtggcgttgcagcgcgcccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAgc > 1:1625383‑M2/32‑150 (MQ=255) c‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGcc < 2:1329815/150‑1 (MQ=255) ccACGTGCCACTGTTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGt > 1:15095/1‑150 (MQ=255) ccACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCCCACAAACTTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGCACAGGCCAAGCGCCGt < 1:1901249/150‑1 (MQ=255) aCGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTg > 2:1561968/1‑130 (MQ=255) aCGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTg < 1:1561968/130‑1 (MQ=255) gCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTc > 2:761727/1‑150 (MQ=255) aCTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcg > 1:1115718/1‑150 (MQ=255) aCTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcg > 1:672530/1‑150 (MQ=255) ctgcAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCAcgcgcg < 1:761727/150‑1 (MQ=255) 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ccATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAat > 1:1704604‑M2/3‑147 (MQ=255) cATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGTGCCAGGTTCATCGGCCTTg > 2:1034515‑M2/2‑107 (MQ=255) cATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGTGCCAGGTTCATCGGCCTTg < 1:1034515‑M2/106‑1 (MQ=255) aTTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGc > 1:1211834/1‑150 (MQ=255) | GCCCGCCCCTGGCACTCAAGGCTGATCATCATCGACTCCACCTGCACCAACTGGCCGATGGCAGCGGCCACATACTCCAGCGCCTCGGGGGTTTCACCATGGGCCAGGGCGCGCTGCAAC‑‑‑GCCACGTGCCACTGCTGCAGCGCGCCCATTGTGAGGGTAAGCGGGGTATCGGGAGAGGCCTGGGTCATGCCCGGCAGTCTAGCCTGCCAGGCACGCCCGCGCACAGCCCTTTGCGCCAGGTTCATCGGCCTTGGTACAGGCCAAGCGCCGTGAGTTCACGCGCGGTCTCAATGATGC > NC_002947/4240089‑4240385 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
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