| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4330908 | 97 (1.330) | 7 (0.100) | 6/234 | NT | 6.6% | coding (310/747 nt) | PP_3802 | cation ABC transporter ATP‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 4330959 | 107 (1.550) | coding (361/747 nt) | PP_3802 | cation ABC transporter ATP‑binding protein | |||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAACCGATG > NC_002947/4330811‑4331108 | ttGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGGGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCcg < 1:456976‑M2/150‑3 (MQ=255) ttGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCcg < 2:1133321‑M2/150‑3 (MQ=255) ttGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCcg > 1:1662394‑M2/1‑148 (MQ=255) ttGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTAGCCCGCGGCCTGCCAATACAAGGGGGCTATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCcg < 1:1690019‑M2/150‑3 (MQ=255) gCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCcggc > 1:888118‑M2/1‑146 (MQ=255) cATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCcggcc < 1:1095140‑M2/150‑6 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCcggcca > 1:862897‑M2/1‑144 (MQ=255) ttGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCcggccat < 1:386177‑M2/150‑8 (MQ=255) tGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAtt < 1:964712/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTg < 1:783138/150‑1 (MQ=255) gCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGa < 1:1299070/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGGCGATTTCATGGCCGCCATGTGACAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGAt < 2:665541/150‑1 (MQ=255) cTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGCAAGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATg < 1:1576514/150‑1 (MQ=255) cTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATg < 2:1095140/150‑1 (MQ=255) tGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGGGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGc < 2:456976/150‑1 (MQ=255) cgAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGt < 2:116376/150‑1 (MQ=255) gTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAg < 2:1115574/150‑1 (MQ=255) tGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAgg < 2:741658/150‑1 (MQ=255) gATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGt > 1:344652/1‑150 (MQ=255) aTTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGtt < 2:790600/150‑1 (MQ=255) aTTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGtt < 1:262057/150‑1 (MQ=255) aTTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGt > 2:620312/1‑149 (MQ=255) aTTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGt < 1:620312/149‑1 (MQ=255) 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gCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAgcgc > 1:905395/1‑150 (MQ=255) aCTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCAc < 2:528658/150‑1 (MQ=255) tGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCAcgc > 1:1553248/1‑150 (MQ=255) gAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACgcgg > 1:1385192/1‑150 (MQ=255) aGTTCGACCGCGGCCTGCCCACGACCGTGCACGATTTCTTGGACGGCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGTCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACgcggc < 1:1098054/150‑1 (MQ=255) 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gcgcCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCt > 1:672336/1‑150 (MQ=255) cgccgcCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGACGCCGGCCATTCATGCAGCCTTGGTGCACCTTGGCGTCCTCGACAAGGGCACGCTGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTg > 2:220370/1‑150 (MQ=255) cgccgcCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTg < 2:924663/150‑1 (MQ=255) gccCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATggggg > 2:1343338/1‑99 (MQ=255) gccCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATggggg < 1:1343338/99‑1 (MQ=255) ccGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATcccc < 1:1282510/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGa < 2:896392/150‑1 (MQ=255) cTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGcc > 1:1748274/1‑150 (MQ=255) ttCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCg > 1:169761/1‑150 (MQ=255) cTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAg > 1:708001/1‑150 (MQ=255) ccTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTtgct < 2:596759/150‑1 (MQ=255) cTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTtgctg > 1:562072/1‑150 (MQ=255) cTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTtgctg < 1:523135/150‑1 (MQ=255) cTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTtgctg > 2:575544/1‑150 (MQ=255) cggcgCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTtgctggtgctg < 1:1618200/150‑1 (MQ=255) gcgcGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGa < 2:1417915/150‑1 (MQ=255) cgcgTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTcc < 1:1286846/81‑1 (MQ=255) cgcgTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTcc > 2:1286846/1‑81 (MQ=255) cgcgTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGAc < 1:1331058/150‑1 (MQ=255) tGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAgcgc < 2:1096650/89‑1 (MQ=255) tGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAgcgc > 1:1096650/1‑89 (MQ=255) gCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAACCGAt < 1:575544/150‑1 (MQ=255) ccGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAACCGATg > 1:1489635/1‑150 (MQ=255) | CTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCGTGCTGCTGGCCCAGGGCCTGATCCCCGAGCCGCAGTTGCTGGTGCTGGACGAACCGATG > NC_002947/4330811‑4331108 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |