| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 5207233 = | 77 (1.050) | 4 (0.060) | 4/238 | NT | 5.1% | coding (117/594 nt) | PP_4588 | nitroreductase family oxidoreductase |
| ? | NC_002947 | 5207258 = | 75 (1.070) | coding (142/594 nt) | PP_4588 | nitroreductase family oxidoreductase | |||||
AGCCGCCATGAGCGCCAACCCCCGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGGCGCAACAGGCGTCGGCGCTGGTGCTGGTCATTTCCAAGACCACGT > NC_002947/5207110‑5207402 | aGCCGCCATGAGCGCCAACCCCCGCATTGCCGATTAAGTGATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGc < 1:1071683/150‑1 (MQ=255) ggcgccATGAGCGCCAACCCCCGTATTGCCGATGACGCCATCAACGAGGAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGcc < 2:396425/148‑1 (MQ=255) ccgccATGAGCGCCAACCCCCGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCt < 2:337516/150‑1 (MQ=255) tGAGCGCCAACCCCCGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCTATAACt > 1:1331127/1‑150 (MQ=255) cgcCAACCCCCGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCa < 2:1438022/150‑1 (MQ=255) cAACCCCCGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGcc > 1:320804/1‑150 (MQ=255) aCCCCCGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCtt < 2:91200/150‑1 (MQ=255) cccGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGc < 2:208545/130‑1 (MQ=255) cccGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGc > 1:208545/1‑130 (MQ=255) cccGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGgc < 1:770686/150‑1 (MQ=255) cccGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGgc > 2:1546149/1‑150 (MQ=255) cccGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGgc > 1:1359669/1‑150 (MQ=255) ccGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGgcg > 2:237320/1‑150 (MQ=255) cATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCtt < 1:1235644/150‑1 (MQ=255) 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cgaaggtgcccagcgggcggcttcgGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCccgccg < 1:1009690‑M2/41‑1 (MQ=255) GAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGGCGCAACAGGCGTCGGCgctggtgctg > 1:1147207‑M1/1‑150 (MQ=255) gcccgcTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGc < 1:1388609/100‑1 (MQ=255) gcccgcTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGc > 2:1388609/1‑100 (MQ=255) gcccgcTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGGCGCAACAGGCGTCGGCGCTGGTGCTGGTCAtt > 2:709570/1‑150 (MQ=255) gcTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGGCGCAACAGGCGTCGGCGCTGGTGCTGGTCATTTCCa > 2:562256/1‑150 (MQ=255) cACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGGCGCAACAGGCGTCGGCGCTGGTGCTGGTCATTTCCAAGACCa < 1:709570/150‑1 (MQ=255) cACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGGCGCAACAGGCGTCGGCGCTGGTGCTGGTCATTTCCAAGACCa < 1:977306/150‑1 (MQ=255) aCCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGgcg > 1:990309/1‑109 (MQ=255) aCCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGgcg < 2:990309/109‑1 (MQ=255) ccTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGGCGCAACAGGCGTCGGCGCTGGTGCTGGTCATTTCCAAGACCACg > 1:419495/1‑150 (MQ=255) cttcgGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGGCGCAGCAGGCGTCGGCGCGGGTGCTGGTCATTTCCAAGACCACGt > 1:973139‑M2/6‑150 (MQ=255) cttcgGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGGCGCAACa < 2:446797‑M2/107‑1 (MQ=255) cttcgGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGGCGCAACa > 1:446797‑M2/6‑112 (MQ=255) | AGCCGCCATGAGCGCCAACCCCCGCATTGCCGATTACGCCATCAACGAGCAGTTCATCAACCGCTGGTCGCCACGCGCCTTCACCGCCGAGCCGATCAGCGAAGAAACCCTGCTGAGCTTCCTCGAAGCCGCCCGCTGGGCACCTTCGGCCTATAACTCGCAGCCTTGGCGCTTCCTTTATGCCCGCCGCGACACGCCGAACTGGGAGCGTTACCTGAGCCTGCTGGTGCCCTTCAATCGCAACTGGGCGCAACAGGCGTCGGCGCTGGTGCTGGTCATTTCCAAGACCACGT > NC_002947/5207110‑5207402 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |