New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 942551 | NA (NA) | 3 (0.070) | 3/234 | NT | 9.1% | coding (3074/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
? | NC_002947 | = 942587 | 32 (0.650) | coding (3038/18933 nt) | PP_0806 | surface adhesion protein |
GCTGAACACGCCGGTCGGGCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAG > NC_002947/942436‑942697 | gCTGAACACGCCGGTCGGGCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGG < 2:388314‑M2/146‑1 (MQ=255) gCTGAACACGCCGGTCGGGCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGG > 1:388314‑M2/1‑146 (MQ=255) tggtCGGCCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGG > 2:604878‑M2/2‑135 (MQ=255) tggtCGGCCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGG < 1:604878‑M2/134‑1 (MQ=255) ggctgcCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCcagca < 1:1089581/149‑1 (MQ=17) tgcCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGtt < 2:1009159/150‑1 (MQ=32) tgcCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGtt > 1:959019/1‑150 (MQ=32) gcCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTc < 1:610591/150‑1 (MQ=32) ccGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGc > 1:1234556/1‑150 (MQ=32) ggTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCg > 1:126545/1‑150 (MQ=32) gCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGGAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCt > 1:651124/1‑150 (MQ=17) aCGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTtg > 2:645585/1‑150 (MQ=32) gCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGAGGCCGGGGCGGTGCTCTCGGGTGTGCGGGTCTGTTTGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGc < 2:1109565/150‑1 (MQ=11) cGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCgg > 1:830203/1‑150 (MQ=32) cGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCgg > 2:778434/1‑150 (MQ=32) gTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGGTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGAGGGCGGCGACGCAGCTCGGGCCATATGTTTGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCCTTGGCTTGTGCGGGa < 2:1008850/150‑1 (MQ=11) gatctcGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCATGGGCTATGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGAtt < 2:359027/145‑1 (MQ=255) aaCGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAg < 2:266779/150‑1 (MQ=32) cGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGtt < 2:527987/150‑1 (MQ=32) gCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCGGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTc > 1:840083/1‑150 (MQ=17) gCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTAGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCGAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAgatc > 1:359027/1‑147 (MQ=12) gCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGAACGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGGTTTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTCAGCTTGTGCGGGATTCAGTTc > 2:352167/1‑150 (MQ=11) cTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCg > 2:863597/1‑150 (MQ=32) tGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGa > 1:787988/1‑150 (MQ=32) gCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGAt < 2:131153/150‑1 (MQ=32) tCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTg > 2:1191494/1‑150 (MQ=32) ccGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGc > 2:1078356/1‑130 (MQ=33) ccGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGc < 1:1078356/130‑1 (MQ=33) gcgcTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGAgcgcggacggcagcgttatcaccggccgtgccgaaccgggcagcaccgtgcgcatcgtggctgccgacggaaccgaactgggcactgccgtggtcggcccgaccggcgtg < 2:598491‑M2/150‑111 (MQ=255) cgcTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGAgcgcggacggcagcgttatcaccggccgtgccgaaccgggcagcaccgtgcgcatcgtggctgccgacggaaccgaactgggcactgccgtg > 2:313867‑M2/1‑39 (MQ=255) cgcTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGAgcgcggacggcagcgttatcaccggccgtgccgaaccgggcagcaccgtgcgcatcgtggctgccgacggaaccgaactgggcactgccgtg < 1:313867‑M2/131‑93 (MQ=255) | GCTGAACACGCCGGTCGGGCCGACCACGGCAGTGCCCAGTTCGGTTCCGTCGGCAGCCACGATGCGCACGGTGCTGCCCGGTTCGGCACGGCCGGTGATAACGCTGCCGTCCGCGCTCACCGCCAGTTCGGTCGGTGCGGCAGGGGCGGTGATGTCGGGCGCGGTGATCTGTGCGGGCAGCGAGGAAACGCCGCCGTCATCGATGGCGACCACGTCCAGCAGTTCGCCGTTGGCTTGTGCGGGATTCAGTTCGATGCTGAAG > NC_002947/942436‑942697 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |