New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2676216 | 50 (1.020) | 3 (0.070) | 3/222 | NT | 5.9% | intergenic (‑39/‑199) | PP_2344/PP_2345 | hypothetical protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 2676262 | 52 (1.190) | intergenic (‑85/‑153) | PP_2344/PP_2345 | hypothetical protein/hypothetical protein |
GGCAATACCCCGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTCAGGTTGAATTAAGGACTGCTGG > NC_002947/2676068‑2676364 | ggCAATACCCCGGCATCGGCCGCCTGCAGGCAACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGATGGGCAGCCTTGAAGGTGACGGCGGGGTTTTTGATTTGGATG‑GCGCTCATGGCGGTTCTCTTGATCATAGAAGCAGCCTTGTGCTGCGAg > 2:116646/1‑150 (MQ=255) ggCAATACCCCGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTTATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAg > 1:198822/1‑150 (MQ=255) ggCAATACCCCGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAg < 1:1067948/150‑1 (MQ=255) ggCAATACCCCGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGACATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAg > 2:988195/1‑150 (MQ=255) cccGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCAtt > 2:110918/1‑150 (MQ=255) cccGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCAtt > 1:86990/1‑150 (MQ=255) ccGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTa > 2:523727/1‑150 (MQ=255) cGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTAc > 2:911038/1‑150 (MQ=255) aTCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGAt < 2:84318/150‑1 (MQ=255) gccTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTTGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGTCATTACAGATAacacac < 2:135216/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCt > 2:1278606/1‑150 (MQ=255) tGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAgggg > 2:85553/1‑129 (MQ=255) tGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAgggg < 1:85553/129‑1 (MQ=255) cGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCt < 1:110918/150‑1 (MQ=255) gCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTg > 1:185825/1‑150 (MQ=255) tCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGAt > 2:156108/1‑128 (MQ=255) tCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTAGTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGAt < 1:156108/128‑1 (MQ=255) cgcgGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTAt < 2:148799/150‑1 (MQ=255) ggATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTgg < 1:523727/150‑1 (MQ=255) tgtCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCtt < 1:628443/150‑1 (MQ=255) tCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTtc < 2:766924‑M2/150‑3 (MQ=255) gCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGATGGCGGGGTATTTGATGTATAAGAACAATAAT‑GCTCCTCTGCTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCgc < 1:1115244/150‑1 (MQ=255) gCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTtcgc < 2:325960‑M2/150‑5 (MQ=255) ggCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAaagggccaatacagccacctacaggtgtgttatctgtaatggcccctcgcagca < 1:809412‑M1/150‑55 (MQ=255) gCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGTGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCCGGTCTCTTCGGCTTCACCACAGGCTTGTGCTTCTAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTtcgcagcacaagg > 1:1119481‑M2/1‑137 (MQ=255) cTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTtcgcagcacaaggc > 1:325960‑M2/1‑136 (MQ=255) gccTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCTCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCATTTCGCGGCACAAGGCCGCACCt > 1:188380/1‑150 (MQ=255) gAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGt > 1:453786/1‑104 (MQ=255) gAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGt < 2:453786/104‑1 (MQ=255) ggTGAGGGCGGGGTATTCGCTGTTTATG‑TCGCTCATGGCGGGTCTGTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTgg < 2:297760/150‑1 (MQ=255) gTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTgg < 1:536246/106‑1 (MQ=255) gTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTgg > 2:536246/1‑106 (MQ=255) gTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTTGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTggg < 2:994058/150‑1 (MQ=255) gggCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCgc < 2:185825/150‑2 (MQ=255) ggggTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAg > 1:661632/1‑94 (MQ=255) ggggTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAg < 2:661632/94‑1 (MQ=255) gggTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCgg < 2:288186/150‑1 (MQ=255) tATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGtt < 1:766924/150‑1 (MQ=255) tttGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTtcgca > 1:938963‑M2/1‑106 (MQ=255) tttGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTtcgca < 2:938963‑M2/111‑6 (MQ=255) tttGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGTACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTgg < 1:174720/150‑1 (MQ=255) tttGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTgg < 1:1278606/150‑1 (MQ=255) aTG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACt > 2:486885/1‑150 (MQ=255) cgcTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTgcgc < 2:632866/150‑1 (MQ=255) gcTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTtcgcagc < 2:1217531‑M2/98‑8 (MQ=255) gcTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTtcgcagc > 1:1217531‑M2/1‑91 (MQ=255) tCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCAcc > 2:248486/1‑109 (MQ=255) tCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCAcc < 1:248486/109‑1 (MQ=255) tCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTAt < 2:88636/150‑1 (MQ=255) cATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATc < 2:198822/150‑1 (MQ=255) gggTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATgccg > 2:1147161/1‑150 (MQ=255) gggTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATgccg > 1:254808/1‑150 (MQ=255) gTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGc > 2:1274400/1‑111 (MQ=255) gTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGc < 1:1274400/111‑1 (MQ=255) ctTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCt > 2:519066/1‑150 (MQ=255) tGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAaagggccaatacagccacctacaggtgtgttatctgtaatgg < 1:953982‑M1/70‑43 (MQ=255) tGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAaagggccaatacagccacctacaggtgtgttatctgtaatgg > 2:953982‑M1/1‑28 (MQ=255) ggCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTggcggc > 2:172197/1‑120 (MQ=255) ggCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTggcggc < 1:172197/120‑1 (MQ=255) cATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTc < 1:1147161/150‑1 (MQ=255) aTAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTCa > 1:621193/1‑150 (MQ=255) tAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTCAg < 2:86990/150‑1 (MQ=255) gcagcCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTCAGGTTGa > 1:1046801/1‑150 (MQ=255) cagcCGTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACGCCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTCAGGTTGaa < 2:88018/150‑1 (MQ=255) gcCTTGTGCTGCGAaagggccaatacagccacctacaggtgtgttatctgtaatggcccctcgcagcacaaggctgctcctatgcccaagagacccgccatgagcgccatccacatcaaataccccgccctcaccttcaaggccggccag > 1:325960‑M1/1‑14 (MQ=255) gcCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAAAACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTCAGGTTGAAtt > 2:787149/1‑150 (MQ=255) ccTTGTGCTGCGAaagggccaatacagccacctacaggtgtgttatctgtaatggcccctagaagcacaagcctgtggtgaagccgaagagaccggccatgagcgccatccacatcaaatacaccgccctcaccttcaaggccggccagc > 1:1119481‑M1/1‑13 (MQ=255) cTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTCAGGTTGAATTaa < 1:787149/150‑1 (MQ=255) ttGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTCAGGTTGAATTAAg < 1:911038/150‑1 (MQ=255) tgctgcGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTtcgcagcacaaggctgctcctatgcccaagagacccgccatgagcgccatccacatcaaataccccgccctcaccttcaaggccggccagcgtgcc < 1:809412‑M2/150‑97 (MQ=255) gctgcGAaagggccaatacagccacctacaggtgtgttatctgtaatggcccctcgcagcacaaggctgctcctatgcccaagagacccgccatgagc < 2:1217531‑M1/98‑92 (MQ=255) gctgcGAaagggccaatacagccacctacaggtgtgttatctgtaatggcccctcgcagcacaaggctgctcctatgcccaagagacccgccatgagc > 1:1217531‑M1/1‑7 (MQ=255) tgcGAaagggccaatacagccacctacaggtgtgttatctgtaatggcccctcgcagcacaaggctgctcctatgcccaagagacccgccatgagcgccatccacatcaaa < 2:938963‑M1/111‑107 (MQ=255) tgcGAaagggccaatacagccacctacaggtgtgttatctgtaatggcccctcgcagcacaaggctgctcctatgcccaagagacccgccatgagcgccatccacatcaaa > 1:938963‑M1/1‑5 (MQ=255) gcGAaagggccaatacagccacctacaggtgtgttatctgtaatggcccctcgcagcacaaggctgctcctatgcccaagagacccgccatgagcgccatccacatcaaataccccgccctcaccttcaaggccggccagcgtgccttgc < 2:325960‑M1/150‑147 (MQ=255) gcGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTCAGGTTGAATTAAGGActgct < 1:1233362/150‑1 (MQ=255) gAaagggccaatacagccacctacaggtgtgttatctgtaatggcccctcgcagcacaaggctgctcctatgcccaagagacccgccatgagcgccatccacatcaaataccccgccctcaccttcaaggccggccagcgtgccttgcga < 2:766924‑M1/150‑149 (MQ=255) | GGCAATACCCCGACATCGGCCGCCTGCAGGCCACGCTCGCGGATGTGTCGCAAGGCACGCTGGCCGGCCTTGAAGGTGAGGGCGGGGTATTTGATGTGGATG‑GCGCTCATGGCGGGTCTCTTGGGCATAGGAGCAGCCTTGTGCTGCGAGGGGCCATTACAGATAACACACCTGTAGGTGGCTGTATTGGCCCTTTCGCAGCACAAGGCCGCACCTTGCACTGGGCCGAGTCGGGTTGGCGGCGTAACTGCGCTATCATGCCGCCAGCTGTTTTCAGGTTGAATTAAGGACTGCTGG > NC_002947/2676068‑2676364 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |