New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5121259 = | 46 (0.940) | 3 (0.070) | 3/234 | NT | 6.6% | coding (854/1455 nt) | trkH‑II | potassium transporter |
? | NC_002947 | 5121292 = | 42 (0.910) | coding (887/1455 nt) | trkH‑II | potassium transporter |
CCCGGCCGTGCACTGGGTTGCAGTAGTGGTGATGATCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCT > NC_002947/5121110‑5121406 | cccGGCCGTGCACTGGGTTGCAGTAGTGGTGATGATCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCGCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACctggct < 1:338787/150‑1 (MQ=255) gagcagccgccaacgaagcccaggtagaagaacagcatcagcgagaagttaccccacaggctgtagtcacccaaggagaagccggtggtggtgaccaccgaggtcacgttcagcgccacatggcgcagggcatcgagccagtgcaggtTg > 1:1044611‑M1/149‑150 (MQ=255) gagcagccgccaacgaagcccaggtagaagaacagcatcagcgagaagttaccccacaggctgtagtcacccaaggagaagccggtggtggtgaccaccgaggtcacgttcagcgccacatggcgcagggcatcgagccagtgcaggtTg > 2:1076883‑M1/149‑150 (MQ=255) ccGGCCGTGCACTGGGTTGCAGTAGTGGTGATGATCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACctggctg > 1:387229/1‑150 (MQ=255) gccgccaacgaagcccaggtagaagaacagcatcagcgagaagttaccccacaggctgtagtcacccaaggagaagccggtggtggtgaccaccgaggtcacgttcagcgccacatggcgcagggcatcgagccagtgcaggtTGGTGCt < 1:334895‑M1/7‑1 (MQ=255) gTGCACTGGGTTGCAGTAGTGGTGATGATCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTg < 1:398903/150‑1 (MQ=255) gCACTGGGTTGCAGTAGTGGTGATGATCCAGTGTATTCGCCTGGGCACCCTCTACGTAGCAACCCTGCGCGGCCCTCGCGGGCGGGTGCGGGCCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCCCGGGGCGGTTGCTggg > 1:1254971/1‑150 (MQ=255) gCACTGGGTTGCAGTAGTGGTGATGATCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTggg > 1:990646/1‑150 (MQ=255) tGGGTTGCAGTAGTGGTGATGATCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCAcc > 2:1091297/1‑150 (MQ=255) tGCAGTAGTGGTGATGATCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACctggta < 1:272052/150‑1 (MQ=255) gtagtGGTGATGATCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACctggtactgg < 2:1254801/150‑1 (MQ=255) gtagtGGTGATGATCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACctggtactgg < 1:469970/150‑1 (MQ=255) gtagtGGTGATGATCAGGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACctggtactgg < 1:959149/150‑1 (MQ=255) gatCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCaa > 2:492992/1‑150 (MQ=255) agcgagaagttaccccacaggctgtagtcacccaaggagaagccggtggtggtgaccaccgaggtcacgttcagcgccacatggcgcagggcatcgagccagtgcaggtTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCAc > 1:243151‑M1/110‑150 (MQ=255) ccGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGAt < 1:492992/150‑1 (MQ=255) cGTTCAAACTCTACGTAGCCACACTGCGTGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATg < 2:277478/150‑1 (MQ=255) gTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGc > 2:988333/1‑150 (MQ=255) ccTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTgcg > 2:346601/1‑150 (MQ=255) ctctACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCAc > 1:572326/1‑122 (MQ=255) ctctACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCAc < 2:572326/122‑1 (MQ=255) tctACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCCGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGcc > 2:376317/1‑150 (MQ=255) tACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCt > 2:155354/1‑125 (MQ=255) tACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCCGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCt < 1:155354/125‑1 (MQ=255) cGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCAtgt < 2:1022385/150‑1 (MQ=255) aGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGgc > 1:161185/1‑150 (MQ=255) tGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACg > 1:859533/1‑150 (MQ=255) gaagccggtggtggtgaccaccgaggtcacgttcagcgccacatggcgcagggcatcgagccagtgcaggtTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAAc < 2:1066680‑M1/35‑1 (MQ=255) gaagccggtggtggtgaccaccgaggtcacgttcagcgccacatggcgcagggcatcgagccagtgcaggtTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAAc > 1:1066680‑M1/72‑106 (MQ=255) ggCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGAcc > 2:554558/1‑150 (MQ=255) gCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCt > 1:962877/1‑150 (MQ=255) aaCCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTgc > 2:51728/1‑124 (MQ=255) aaCCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTgc < 1:51728/124‑1 (MQ=255) cGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCggtg > 2:653337/1‑150 (MQ=255) gcagGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCggt < 2:984562/126‑1 (MQ=255) gcagGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCggt > 1:984562/1‑126 (MQ=255) agGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGGTGGGCACCTGGTACTAGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTgg < 2:387229/150‑1 (MQ=255) gTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCtggtactggtac > 2:965358/1‑63 (MQ=255) gTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCtggtactggtac < 1:965358/63‑1 (MQ=255) cAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCtt > 1:522212/1‑143 (MQ=255) cAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCtt < 2:522212/143‑1 (MQ=255) cAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGAc > 2:779761/1‑150 (MQ=255) tGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCtgt < 1:554558/150‑1 (MQ=255) gggCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCtgtg < 1:346601/150‑1 (MQ=255) gCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTcaccaccac > 2:186165/1‑118 (MQ=255) gCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTcaccaccac < 1:186165/118‑1 (MQ=255) aTGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACa > 1:1063173/1‑139 (MQ=255) aTGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACa < 2:1063173/139‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTaa < 2:1254971/150‑1 (MQ=255) gtCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCg < 2:859533/150‑1 (MQ=255) aCCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGa > 2:550441/1‑122 (MQ=255) aCCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGa < 1:550441/122‑1 (MQ=255) aCCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTa > 2:514966/1‑125 (MQ=255) aCCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTa < 1:514966/125‑1 (MQ=255) ctggctggTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGGTCTGCGCCAGGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGGCACCACAACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGAt > 2:129269/1‑150 (MQ=255) ctggctggTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGAt > 2:1130890/1‑150 (MQ=255) ctggctggTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGAt > 1:891048/1‑150 (MQ=255) ctTGGTGCTGTTTACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCt > 2:32316‑M1/3‑150 (MQ=255) | CCCGGCCGTGCACTGGGTTGCAGTAGTGGTGATGATCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCT > NC_002947/5121110‑5121406 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |