New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5121259 = | 46 (0.940) | 3 (0.070) | 3/234 | NT | 6.6% | coding (854/1455 nt) | trkH‑II | potassium transporter |
? | NC_002947 | 5121292 = | 42 (0.910) | coding (887/1455 nt) | trkH‑II | potassium transporter |
GATCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTC > NC_002947/5121143‑5121439 | gatCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCaa > 2:492992/1‑150 (MQ=255) agcatcagcgagaagttaccccacaggctgtagtcacccaaggagaagccggtggtggtgaccaccgaggtcacgttcagcgccacatggcgcagggcatcgagccagtgcaggttggtgctgtaccagtaccaggtaaacagcaccaag > 2:32316‑M2/149‑149 (MQ=255) agcgagaagttaccccacaggctgtagtcacccaaggagaagccggtggtggtgaccaccgaggtcacgttcagcgccacatggcgcagggcatcgagccagtgcaggtTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCAc > 1:243151‑M1/110‑150 (MQ=255) ccGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGAt < 1:492992/150‑1 (MQ=255) cGTTCAAACTCTACGTAGCCACACTGCGTGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATg < 2:277478/150‑1 (MQ=255) gTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGc > 2:988333/1‑150 (MQ=255) ccTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTgcg > 2:346601/1‑150 (MQ=255) tctACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCCGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGcc > 2:376317/1‑150 (MQ=255) tACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCt > 2:155354/1‑125 (MQ=255) tACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCCGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCt < 1:155354/125‑1 (MQ=255) cGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCAtgt < 2:1022385/150‑1 (MQ=255) aGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGgc > 1:161185/1‑150 (MQ=255) tGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACg > 1:859533/1‑150 (MQ=255) gaagccggtggtggtgaccaccgaggtcacgttcagcgccacatggcgcagggcatcgagccagtgcaggtTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAAc < 2:1066680‑M1/35‑1 (MQ=255) gaagccggtggtggtgaccaccgaggtcacgttcagcgccacatggcgcagggcatcgagccagtgcaggtTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAAc > 1:1066680‑M1/72‑106 (MQ=255) ggCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGAcc > 2:554558/1‑150 (MQ=255) gCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCt > 1:962877/1‑150 (MQ=255) aaCCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTgc < 1:51728/124‑1 (MQ=255) aaCCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTgc > 2:51728/1‑124 (MQ=255) cGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCggtg > 2:653337/1‑150 (MQ=255) gcagGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCggt < 2:984562/126‑1 (MQ=255) gcagGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCggt > 1:984562/1‑126 (MQ=255) agGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGGTGGGCACCTGGTACTAGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTgg < 2:387229/150‑1 (MQ=255) cAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCtt > 1:522212/1‑143 (MQ=255) cAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCtt < 2:522212/143‑1 (MQ=255) cAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGAc > 2:779761/1‑150 (MQ=255) tGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCtgt < 1:554558/150‑1 (MQ=255) gggCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCtgtg < 1:346601/150‑1 (MQ=255) gCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTcaccaccac < 1:186165/118‑1 (MQ=255) gCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTcaccaccac > 2:186165/1‑118 (MQ=255) aTGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACa > 1:1063173/1‑139 (MQ=255) aTGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACa < 2:1063173/139‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTaa < 2:1254971/150‑1 (MQ=255) gtCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCg < 2:859533/150‑1 (MQ=255) gtgcaggttggtgctgtaccagtaccaggtgcccagcaccaACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCt > 1:243151‑M2/42‑150 (MQ=255) aCCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGa > 2:550441/1‑122 (MQ=255) aCCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGa < 1:550441/122‑1 (MQ=255) aCCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTa < 1:514966/125‑1 (MQ=255) aCCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTa > 2:514966/1‑125 (MQ=255) ctggctggTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGGTCTGCGCCAGGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGGCACCACAACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGAt > 2:129269/1‑150 (MQ=255) ctggctggTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGAt > 2:1130890/1‑150 (MQ=255) ctggctggTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGAt > 1:891048/1‑150 (MQ=255) gttggtgctgtaccagtaccaggtgcccagcaccaACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTtc > 1:1066680‑M2/36‑106 (MQ=255) gttggtgctgtaccagtaccaggtgcccagcaccaACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTtc < 2:1066680‑M2/71‑1 (MQ=255) ctTGGTGCTGTTTACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCt > 2:32316‑M1/3‑150 (MQ=255) GGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGACCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGctgag < 1:32316‑M1/150‑3 (MQ=255) TGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGTCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTtcttct < 1:686541‑M1/150‑1 (MQ=255) ggCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGAt > 1:525975/1‑137 (MQ=255) ggCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGAt < 2:525975/137‑1 (MQ=255) gCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTAcc < 2:161185/150‑1 (MQ=255) gCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTACGCCATGTGGCGCTGACCGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTAcc > 1:793843/1‑150 (MQ=255) ccTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTgg < 1:376317/150‑1 (MQ=255) ctggtactggtaCAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTggg < 2:990646/150‑1 (MQ=255) tactggtacAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTc < 2:962877/150‑1 (MQ=255) ctggtacAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGt < 1:779761/150‑1 (MQ=255) gtacAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTgg > 2:334895/1‑150 (MQ=255) agcaccaACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTggcggc < 1:334895‑M2/143‑1 (MQ=255) caACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTc > 2:1076883‑M2/3‑150 (MQ=255) caACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTc > 1:1044611‑M2/3‑150 (MQ=255) | GATCATGGGCAGCCTGCCGTTCACCCTCTACGTAGCCACCCTGCGCGGCAACCGCAAGGCGCTGATCCGCGACCAGCAGGTGCAAGGCTTGCTGGGCATGCTGGTGGTCACCTGGCTGGTGCTGGGCACCTGGTACTGGTACAGCACCAACCTGCACTGGCTCGATGCCCTGCGCCATGTGGCGCTGAACGTGACCTCGGTGGTCACCACCACCGGCTTCTCCTTGGGTGACTACAGCCTGTGGGGTAACTTCTCGCTGATGCTGTTCTTCTACCTGGGCTTCGTTGGCGGCTGCTC > NC_002947/5121143‑5121439 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |