New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1212590 = | 69 (1.410) | 4 (0.090) | 4/230 | NT | 6.9% | intergenic (‑118/+70) | PP_1060/PP_1061 | glutamate synthase large subunit/ATP‑dependent DNA helicase |
? | NC_002947 | 1212688 = | 44 (0.980) | coding (4277/4305 nt) | PP_1061 | ATP‑dependent DNA helicase |
CGGGCACTGCAAAATAAAATCGGGGTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCGGTTGCCAATCACTGCCGGCACTTTCGC > NC_002947/1212541‑1212836 | cGGGCACTGCAAAATAAAATCGGGGTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAgg < 1:488475/150‑1 (MQ=255) cGGGCACTGCAAAATAAAATCGGGGTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAgg < 1:387055/150‑1 (MQ=255) cGGGCACTGCAAAATAAAATCGGGGTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAgg < 1:992067/150‑1 (MQ=255) tGCAAAATAAAATCGGGGTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTcgc < 1:550074/150‑1 (MQ=255) aaaataaaatCGGGGTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCgca < 1:1219723/150‑1 (MQ=255) aaataaaatCGGGGTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAgg < 2:514898/139‑1 (MQ=255) aaataaaatCGGGGTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAgg > 1:514898/1‑139 (MQ=255) ataaaatCGGGGGAGCAAAAACCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTAGTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCgcagca < 2:171552/150‑1 (MQ=255) aatCGGGGTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGttt < 2:1126134/150‑1 (MQ=255) atCGGGGTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGtttt < 1:368040/150‑1 (MQ=255) tCGGGGTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGttttt < 2:1093423/150‑1 (MQ=255) ggggTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTgc < 2:771034/150‑1 (MQ=255) aGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCa < 1:105666/150‑1 (MQ=255) aaaaTCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCtt > 2:181468/1‑150 (MQ=255) aaaaTCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCtt > 1:1069392/1‑150 (MQ=255) tCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCt < 1:729535/150‑1 (MQ=255) ttCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGG‑CGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAgg > 1:883381/1‑112 (MQ=255) ttCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGG‑CGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAgg < 2:883381/112‑1 (MQ=255) ctcGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTcc < 2:964052/150‑1 (MQ=255) ggAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCtg < 2:137814/149‑1 (MQ=255) gAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCtgt < 1:966447/150‑1 (MQ=255) gAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCACAGGCTACCGTATTCGCGCGTAAAACCGCGCCTGTGAGGTGCTCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCtgt > 1:926702/1‑150 (MQ=17) gCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCtgcgc > 1:1218990/1‑147 (MQ=255) GCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACgccg > 2:946764‑M1/1‑149 (MQ=255) tttacccgcgaatacggtagcggcggcaacggtgcacggcgggtggagattggccagcaggcccggccctttcgcgggtgaacccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCa < 2:699705‑M2/29‑1 (MQ=255) tttacccgcgaatacggtagcggcggcaacggtgcacggcgggtggagattggccagcaggcccggccctttcgcgggtgaacccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCa > 1:699705‑M2/91‑119 (MQ=255) TTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCTCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGCTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGAcc > 1:426980‑M1/1‑150 (MQ=255) TCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCa > 2:842549‑M1/1‑150 (MQ=255) aCCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGa < 1:930507/150‑1 (MQ=255) cgAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTTCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATAcgc < 1:139858/150‑1 (MQ=255) aatacggtagcggcggcaacggtgcacggcgggtggagattggccagcaggcccggccctttcgcgggtgaacccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGt > 1:257309‑M2/81‑150 (MQ=255) aGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTaa < 1:553838/150‑1 (MQ=255) gccgggccTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTaa < 1:746266/147‑1 (MQ=255) gccgggccTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTaa > 2:746266/1‑147 (MQ=255) cgggccTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGccc < 2:836925/150‑1 (MQ=255) cgggccTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGccc < 2:836961/150‑1 (MQ=255) cgggccTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGccc > 1:1159699/1‑150 (MQ=255) gggccTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCg < 2:1069392/150‑1 (MQ=255) gggccTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCg < 1:181468/150‑1 (MQ=255) gccTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGc > 2:1089331/1‑150 (MQ=255) gctgGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATc > 2:475383/1‑150 (MQ=255) gctgGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATc < 2:7565/150‑1 (MQ=255) cAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCtgtg > 1:41506/1‑106 (MQ=255) cAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCtgtg < 2:41506/106‑1 (MQ=255) cAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCAcc < 1:594552/150‑1 (MQ=255) cccGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGt < 2:1159699/150‑1 (MQ=255) ccgccgTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGttttt < 1:489281/72‑1 (MQ=255) ccgccgTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGttttt > 2:489281/1‑72 (MQ=255) ccgccgTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCGCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTACCGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCAGTa > 1:323694/1‑150 (MQ=255) gTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCg > 1:946105/1‑150 (MQ=255) cACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTaa > 2:317865/1‑114 (MQ=255) cACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTaa < 1:317865/114‑1 (MQ=255) ccagcaggcccggccctttcgcgggtgaacccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATa < 2:257309‑M2/113‑1 (MQ=255) cgccgcTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGa < 2:926702/150‑1 (MQ=255) tACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCCCCGCCACCCGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCgg > 1:1167521/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCGGTTGCCaa < 2:946105/150‑1 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCGGTTGCCAATCa > 2:1031143/1‑150 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGCGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCGGTTGCCAATCa < 2:1218990/150‑1 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCGGTTGCCAATCACt > 1:847267/1‑150 (MQ=255) cccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGGCGTCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCACATCCGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCGGTTGCCAATCACTGCCGGCa > 2:249006‑M2/9‑150 (MQ=255) cccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGAcc < 2:344362‑M2/60‑1 (MQ=255) cccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGAcc > 1:344362‑M2/9‑68 (MQ=255) cccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAGGCCGGTTGCCAATCACTGCCGgcc > 2:617824‑M2/9‑149 (MQ=255) cccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCGGTTGCCAATCACTGCCGGCa > 2:82276‑M2/9‑150 (MQ=255) ccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATcc > 2:1215337‑M2/8‑110 (MQ=255) ccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATcc < 1:1215337‑M2/103‑1 (MQ=255) ccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCGGTTGCCAATCACTGCCGGCAc > 1:118917‑M2/8‑150 (MQ=255) ccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCGGTTGCCAATCACTGCCGGCAc > 2:98241‑M2/8‑150 (MQ=255) ccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGACCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGc > 2:489876‑M2/8‑127 (MQ=255) ccgctccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGACCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGc < 1:489876‑M2/120‑1 (MQ=255) tccAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCGGTTGCCAATCACTGCCGGCACTTTc < 1:82276‑M2/147‑1 (MQ=255) cAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCGGTTGCCAATCACTGCCGGCACTTTCGc < 2:847267‑M2/149‑1 (MQ=255) | CGGGCACTGCAAAATAAAATCGGGGTAGCGAAAATCATTCTCGAGCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGCCGTGCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCAGGGTGTCGCGCAGCAGTTTTTGCCGCCAGCTTTCCTGCTCCTGTGCGGACGCCTCGACCAGATACGCGTAACGCCCGGCCATCCGCACCGCCACCGGTATCCCGTCGCGATACAGAAGCCGGTTGCCAATCACTGCCGGCACTTTCGC > NC_002947/1212541‑1212836 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |