New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4889902 | 48 (0.980) | 4 (0.080) | 4/240 | NT | 8.1% | coding (151/894 nt) | glxR | 2‑hydroxy‑3‑oxopropionate reductase |
? | NC_002947 | = 4889909 | 45 (0.960) | coding (158/894 nt) | glxR | 2‑hydroxy‑3‑oxopropionate reductase |
ATCGGTTTCATCGGCACCGGCATCATGGGCAAGCCCATGGCTCAGAACCTGCAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAGGTGGTGATCGACATGAGCTCGATCTCGC > NC_002947/4889761‑4890046 | aTCGTTTTCATCGGCACCGGCATCATGGGCAAGCCCATGGCTCAGAACCTGCAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAg > 1:535763‑M2/1‑149 (MQ=255) ttCATCGGCACCGGCATCATGGGCAAGCCCATGGCTCAGAACCTGCAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGcc > 1:815309/1‑150 (MQ=255) aTCGGCACCGGCATCATGGGCAAGCCCATGGCTCAGAACCTGCAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAg > 1:1106523/1‑150 (MQ=255) tCGGCACCGGCATCATGGGCAAGCCCATGGCTCAGAACCTGCAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAg < 2:1241917‑M2/140‑2 (MQ=255) tCGGCACCGGCATCATGGGCAAGCCCATGGCTCAGAACCTGCAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAg > 1:1241917‑M2/1‑139 (MQ=255) aCCGGCATCATGGGCAAGCCCATGGCTCAGAACCTGCAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGcc > 2:1200108/1‑150 (MQ=255) catGGGCAAGCCCATGGCTCAGAACCTGCAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATtcat < 2:815309/150‑1 (MQ=255) tGGCTCAGAACCTGCAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTcc < 1:768021/150‑1 (MQ=255) cTGCAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCg > 2:363031/1‑150 (MQ=255) cTGCAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCg > 1:324146/1‑150 (MQ=255) cAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAg < 2:630947/150‑1 (MQ=255) aaGGCGGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTc < 2:507603/150‑1 (MQ=255) cAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGaaa < 1:1200108/150‑1 (MQ=255) tCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCTACACCCCGCAGGTCGAAAGCGt > 1:1172978/1‑150 (MQ=255) cacaGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCTACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTc < 2:1172978/150‑1 (MQ=255) cacaGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTc < 1:174990/150‑1 (MQ=255) gTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGaa > 1:296439/1‑136 (MQ=255) gTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGaa < 2:296439/136‑1 (MQ=255) ttCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGt < 2:404577/150‑1 (MQ=255) tttCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGaaa > 1:1046493/1‑150 (MQ=255) tCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATAATCGCCATTGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAAc < 2:501602/150‑1 (MQ=255) acccaccACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGc > 1:480087/1‑150 (MQ=255) ccaccaCGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGtt < 1:108821/135‑1 (MQ=255) ccaccaCGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGtt > 2:108821/1‑135 (MQ=255) acccccagacgGCGAGCCTGGCGACCTGATCGGTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGt > 2:282695/8‑150 (MQ=255) cacGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAaga < 2:371904/62‑1 (MQ=255) cacGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAaga > 1:371904/1‑62 (MQ=255) cacGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGcc > 2:980293/1‑150 (MQ=255) acgCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAgg > 1:572736/1‑150 (MQ=255) gccgcGCTAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGc > 2:16579/1‑150 (MQ=255) tctcacccGACCTGATCGCTGCCGGTGCCCTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGCCACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTg < 1:383229/144‑1 (MQ=255) aGCAGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGCACGAGGTTGCACAGGAAGCCGAGTTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGACAGCGTCCTGTTCGGTGAACACGGCGTGGCCGAGGGCATTGGcga > 2:383229/1‑148 (MQ=255) gCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATg < 2:667743/81‑1 (MQ=255) gCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATg > 1:667743/1‑81 (MQ=255) gACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTc < 2:629853/108‑1 (MQ=255) gACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTc > 1:629853/1‑108 (MQ=255) aCCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAgg > 1:1083394/1‑96 (MQ=255) aCCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAgg < 2:1083394/96‑1 (MQ=255) tCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAATCCGAAAGGGTTTGCCCAGGAAGGCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAggtgg < 2:480087/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAGgtggtg < 2:1106523/150‑1 (MQ=255) gCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAGgtggtg > 1:1165102/1‑150 (MQ=255) tGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAGGTGGTGAt > 2:1039878/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGGTGGCCCGAACAAGGTGGTGATCGa < 2:150065/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCACCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAGGTGGTGATCGAc > 1:776497/1‑150 (MQ=255) tGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAGGTGGTGATCGACAt < 1:363031/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTACCCGACACTCTCCATGTCTAAAGCTTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAGGTGGTGATCGACATg > 1:797209/1‑150 (MQ=255) cGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAggttggccagggccacggcaccggcagcgatcaggtcggctggcgcggcgtcgtggtgggtggaaatga > 2:13376‑M2/1‑24 (MQ=255) cGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAggttggccagggccacggcaccggcagcgatcaggtcggctggcgcggcgtcgtggtgggtggaaatga < 1:13376‑M2/93‑70 (MQ=255) ccTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGc > 1:354164/1‑118 (MQ=255) ccTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGc < 2:354164/118‑1 (MQ=255) tGGCCAACCCGAAAGAggttggccagggccacggcaccggcagcgatcaggtcggctggcgcggc < 2:58460‑M2/65‑50 (MQ=255) tGGCCAACCCGAAAGAggttggccagggccacggcaccggcagcgatcaggtcggctggcgcggc > 1:58460‑M2/1‑16 (MQ=255) gCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAGGTGGTGATCGACATGAGCTCGATCTCg < 1:153432/150‑1 (MQ=255) ccAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAGGTGGTGATCGACATGAGCTCGATCTCGc > 2:904387/1‑150 (MQ=255) ccGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAggtgg < 2:625684/121‑1 (MQ=255) ccGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAggtgg > 1:625684/1‑121 (MQ=255) | ATCGGTTTCATCGGCACCGGCATCATGGGCAAGCCCATGGCTCAGAACCTGCAAAAGGCAGGTCACAGCCTGTTCATTTCCACCCACCACGACGCCGCGCCAGCCGACCTGATCGCTGCCGGTGCCGTGGCCCTGGCCAACCCGAAAGAGGTTGCCCAGGAAGCCGAATTCATCATCGTCATGGTCCCCGACACCCCGCAGGTCGAAAGCGTCCTGTTCGGTGAAAACGGCGTGGCCGAGGGCGTTGGCCCGAACAAGGTGGTGATCGACATGAGCTCGATCTCGC > NC_002947/4889761‑4890046 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |