| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 207792 = | NA (NA) | 3 (0.030) | 3/234 | NT | 100% | coding (13298/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
| ? | NC_002947 | 207820 = | 0 (0.000) | coding (13326/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein | |||||
ACCTGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGtggca‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/207940‑207792‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTC > NC_002947/207820‑207973 ACCTGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGT < 1:2104844/150‑1ACCTGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGT < 2:1552966/150‑1 CTGGCTCGTCGGTAACCGACGTGTTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGACATTGCCGACATCAACACCTTCAACGGGTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGG > 1:2676444/1‑150 CTGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGTACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGTTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGG > 2:1982903/1‑150 CTGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGG < 1:1174421/150‑1 CTGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGG < 1:2093598/150‑1 TGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGC < 1:2949339/150‑1 TGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGC > 1:276843/1‑150 GGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCGCAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCA < 2:1622190/150‑1 GGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCA < 1:367928/150‑1 gcaCGTCGGTTACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCAg > 2:2698091/4‑149 CGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTG > 2:2618944/1‑133 CGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTG < 1:2618944/133‑1 ACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGC < 2:2674279/125‑1 ACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGC > 1:2674279/1‑125 TTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCA > 1:2921687/1‑117 TTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCA < 2:2921687/117‑1 TCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGG < 1:678711/112‑1 TCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGG > 2:678711/1‑112 GTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGC < 1:2657070/103‑1 GTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGC > 2:2657070/1‑103 CTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCA < 1:2448711/77‑1 CTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCA > 2:2448711/1‑77 GTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGAAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGC > 1:15354/1‑150 AACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAA > 1:1803396/1‑113 AACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGTGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAA < 2:1803396/113‑1 TGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAA < 1:753145/150‑1 TGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAA < 2:1306524/150‑1 GGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAG < 1:1312245/150‑1 GGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAG < 1:49062/150‑1 GGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACGGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAG < 1:296117/150‑1 GCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGATGGCGACCT < 1:884845/142‑1 GCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGATGGCGACCT > 2:884845/1‑142 CACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAAC > 2:2485138/1‑68 CACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAAC < 1:2485138/68‑1 ACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTC < 1:2398366/150‑1 ACCTGGCTCGTCGGTAACCGACGTGCTGACCGGGGTCTTGTCCAGTGTCAGTTGCTCGAACTTGCCGACATCCGCACCTTCAACGGTTGCGATCGATTTGATCACAGGGTCGTTGGTGCCAACGTAGACGTTGTCCGGGGCAGTCACGGtggca‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/207940‑207792‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAAGGTC > NC_002947/207820‑207973 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |