| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 207792 = | NA (NA) | 3 (0.030) | 3/234 | NT | 100% | coding (13298/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein |
| ? | NC_002947 | 207820 = | 0 (0.000) | coding (13326/26049 nt) | PP_0168 | putative surface adhesion protein | |||||
ACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCTAATGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTTGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAA > NC_002947/207671‑207969 | acctggctcgtcggtaaccgacgtgctgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggt < 2:1552966‑M2/1‑1 (MQ=255)acctggctcgtcggtaaccgacgtgctgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggt < 1:2104844‑M2/1‑1 (MQ=255) ctggctcgtcggtaaccgacgtgttgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgacattgccgacatcaacaccttcaacgggtgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTgg > 1:2676444‑M2/148‑150 (MQ=255) ctggctcgtcggtaaccgacgtgctgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgtacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttgttgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTgg > 2:1982903‑M2/148‑150 (MQ=255) ctggctcgtcggtaaccgacgtgctgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTgg < 1:2093598‑M2/3‑1 (MQ=255) ctggctcgtcggtaaccgacgtgctgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTgg < 1:1174421‑M2/3‑1 (MQ=255) tggctcgtcggtaaccgacgtgctgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGc < 1:2949339‑M2/4‑1 (MQ=255) tggctcgtcggtaaccgacgtgctgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGc > 1:276843‑M2/147‑150 (MQ=255) ggctcgtcggtaaccgacgtgctgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcgcagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGCa < 2:1622190‑M2/5‑1 (MQ=255) ggctcgtcggtaaccgacgtgctgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGCa < 1:367928‑M2/5‑1 (MQ=255) gcacgtcggttaccgacgtgctgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGcag > 2:2698091‑M2/145‑149 (MQ=255) cgacgtgctgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTg < 1:2618944‑M2/2‑1 (MQ=255) cgacgtgctgaccggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTg > 2:2618944‑M2/132‑133 (MQ=255) accggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGc > 1:2674279‑M2/122‑125 (MQ=255) accggggtcttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGc < 2:2674279‑M2/4‑1 (MQ=255) ttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGCa > 1:2921687‑M2/113‑117 (MQ=255) ttgtccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGCa < 2:2921687‑M2/5‑1 (MQ=255) tccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTgg > 2:678711‑M2/110‑112 (MQ=255) tccagtgtcagttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTgg < 1:678711‑M2/3‑1 (MQ=255) gttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGc > 2:2657070‑M2/100‑103 (MQ=255) gttgctcgaacttgccgacatccgcaccttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGc < 1:2657070‑M2/4‑1 (MQ=255) cttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGCa > 2:2448711‑M2/73‑77 (MQ=255) cttcaacggttgcgatcgatttgatcacagggtcgttggtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGCa < 1:2448711‑M2/5‑1 (MQ=255) gtgccaacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGAAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGc > 1:15354‑M2/35‑150 (MQ=255) aacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACaa < 2:1803396‑M2/84‑1 (MQ=255) aacgtagacgttgtccggggcagtcacggTGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACaa > 1:1803396‑M2/30‑113 (MQ=255) TGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCaa < 2:1306524‑M2/150‑1 (MQ=255) TGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCaa < 1:753145‑M2/150‑1 (MQ=255) | ACCATCACCCTGACCAACAAAGACGGCCTGCCGATCAACAACCACAGTGCATTGACCTTCACGCTGAGCGACGGCAAAACCGTCATCACCGTGCCGGCTAATGGCACCGTGGGTACTGCCACCGTGACTGCCCCGGACAACGTCTACGTTGGCACCAACGACCCTGTGATCAAATCGATCGCAACCGTTGAAGGTGCGGATGTCGGCAAGTTCGAGCAACTGACACTGGACAAGACCCCGGTCAGCACGTCGGTTACCGACGAGCCAGGTACGCCGGGCAACGAAGGCGACCTGGTCAA > NC_002947/207671‑207969 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |