| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4700803 | 114 (1.000) | 12 (0.120) | 9/216 | NT | 10.2% | intergenic (‑70/+80) | kdpD/kdpC | sensor protein/potassium‑transporting ATPase subunit C |
| ? | NC_002947 | = 4700847 | 111 (1.100) | intergenic (‑114/+36) | kdpD/kdpC | sensor protein/potassium‑transporting ATPase subunit C | |||||
GCCGGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4700641‑4700803‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgtaggagcgggttCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGATGCGCTGTTG < NC_002947/4700847‑4700701 GCCGGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCTGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGT > 1:2234720/1‑150GCCGGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGT > 2:342906/1‑150GCCGGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGT > 2:2537614/1‑150 CGGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGT < 1:2396330/150‑1 CGGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGT > 1:1530887/1‑150 GGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTA < 1:2249686/150‑1 GGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTAATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTA > 1:850713/1‑150 GGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAG < 2:2628202/150‑1 GGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGA < 2:126276/150‑1 GCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGATGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAG > 1:780670/1‑150 GCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGG < 2:1040508/150‑1 GCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGAGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGG > 1:1563778/1‑150 CGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGG > 2:1713197/1‑150 CCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTC > 1:392264/1‑150 CGTTGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGT < 1:896307/150‑1 GGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGT > 2:2691906/1‑103 GGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGT < 1:2691906/103‑1 GGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCG < 2:392264/150‑1 CAACAGCGCATCGGCGAGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAAC < 2:1563778/150‑1 CAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCG < 2:2082020/150‑1 ACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGG > 1:2160594/1‑117 ACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGG < 2:2160594/117‑1 TGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAAC < 2:2148754/118‑1 TGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAAC > 1:2148754/1‑118 TGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAAC > 1:2148637/1‑118 TGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAAC < 2:2148637/118‑1 CCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGC > 1:29823/1‑64 CCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGC < 2:29823/64‑1 TGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCG > 1:1656937/1‑150 TGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCG > 2:1278568/1‑150 TGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGC > 1:1525863/1‑148 TGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGC < 2:1525863/148‑1 GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGA > 1:2537614/1‑150 GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGA < 2:50154/124‑1 GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGA < 2:658262/124‑1 GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGA > 1:658262/1‑124 GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGA > 1:50154/1‑124 TAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGAT < 1:1197420/150‑1 AGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGATG < 1:1155426/150‑1 AGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGATG > 2:2453833/1‑150 GGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTG > 1:2328238/1‑104 GGAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTG < 2:2328238/104‑1 GAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGCATGATGGTCAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGATGCG > 1:188696/1‑150 GAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGATGCG > 2:2706553/1‑150 GAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGATGCG > 2:171333/1‑150 GAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAA > 2:1775705/1‑89 GAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAA < 1:1775705/89‑1 GAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCT < 1:2705464/86‑1 GAGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCT > 2:2705464/1‑86 AGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGA > 2:1248018/1‑116 AGCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGA < 1:1248018/116‑1 GCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGATGCGCT > 2:362982/1‑150 GCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGATGCGCT < 1:2680935/150‑1 GCGGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGATTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGGAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGATGCGCT > 2:947492/1‑150 GGGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGATCCAAAGGATGCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGATGCGCTGT > 2:1517736/1‑150 GGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGA < 2:1459484/122‑1 GGTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGA > 1:1459484/1‑122 GTTCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGATGCGCTGTTG < 2:1767138/150‑1 GCCGGGGGCAGCGCCCAGGAACACCTTCAGCCGGCCCCGGCCGGTGCGTGGGAGGTTGGCCAACAGCGCATCGGCGCGGGCGGAGTCACTCATGTTTCATCCTTTACTTTGTCCAACAGTCCGCCGCTTCAGGGAAAGCCCCCTTAACGTGTAGGAGCGGGTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/4700641‑4700803‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgtaggagcgggttCACCCGCGAATGCGGTGGTGGTGCCACTGACGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTTAAGGGGGCTTTCCCTGAAGCGGCGGACTGTTGGACAAAGTAAAGGATGAAACATGAGTGACTCCGCCCGCGCCGATGCGCTGTTG < NC_002947/4700847‑4700701 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |