| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5460828 | 123 (1.070) | 10 (0.090) | 10/230 | NT | 7.6% | intergenic (+161/‑56) | holA/PP_4797 | DNA polymerase III subunit delta/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 5460836 | 127 (1.180) | intergenic (+169/‑48) | holA/PP_4797 | DNA polymerase III subunit delta/hypothetical protein | |||||
CGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5460675‑5460828‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggccccc‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACC < NC_002947/5460836‑5460688 CGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGC < 2:569904/150‑1CGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGC < 2:2742063/150‑1 TCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCC > 1:1232152/1‑150 GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCCCC > 1:1423487/1‑150 GTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCCCC > 1:159244/1‑150 TAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTG > 1:215634/1‑143 TAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTG < 2:215634/143‑1 GAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCCCC‑CGAA > 2:2673391/1‑150 GTTTACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCCCC‑CGAAGGGTGG > 1:2564660/1‑150 CGCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACGGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAA < 2:841777/150‑1 GCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAAT < 2:2564660/150‑1 AGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGAT < 1:2673391/150‑1 CCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGT > 2:454791/1‑150 ATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTG > 1:2743539/1‑105 ATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTG < 2:2743539/105‑1 CCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATCGGCCCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTG > 2:2950131/1‑115 CCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATCGGCCCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTG < 1:2950131/115‑1 GCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTAT < 1:204841/69‑1 GCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTAT > 2:204841/1‑69 CATATACACAATCAATTGGCCCCCACCCTTCG‑GGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGG > 1:454791/1‑150 AATTGGCCCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGC < 1:604863/134‑1 AATTGGCCCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGC > 2:604863/1‑134 GCCCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGT > 2:1017068/1‑150 GCCCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGT > 1:2838187/1‑150 CCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGGGAACGGAGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGAGTAA > 1:900171/1‑150 CCCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAACGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTAA > 2:1510756/1‑150 CCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGCATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA > 2:1265822/1‑150 CCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTAAA > 2:2668650/1‑150 CCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGT > 1:2785718/1‑108 CCC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGT < 2:2785718/108‑1 CC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGTCCCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAC < 1:2335730/150‑1 CC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTAAAC < 2:2838187/150‑1 CC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCG > 1:1819448/1‑132 CC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCG < 2:1819448/132‑1 CC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATT > 1:2748185/1‑118 CC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATT < 2:2748185/118‑1 CC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGC > 2:461490/1‑91 CC‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGC < 1:461490/91‑1 C‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACC > 2:159244/1‑150 C‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACC > 2:625948/1‑150 C‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGGGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACC > 1:1494306/1‑150 CGTCGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGACCTGCTAATCAATCTCCACCCACCGTTCACCGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACATAGGCACCAGCGCCTCGACCATATACACAATCAATTGGCCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5460675‑5460828‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggccccc‑CGAAGGGTGGGGGCCAATTGATTGTGTATATGGTCGAGGCGCTGGTGCCTATGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAATACGGTGGCGGCGGCAACGGTGAACGGTGGGTGGAGATTGATTAGCAGGTCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACC < NC_002947/5460836‑5460688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |