| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | 12243 = | 125 (1.090) | 8 (0.070) | 7/230 | NT | 6.5% | coding (22/1104 nt) | recF | DNA replication/repair protein |
| ? | NC_002947 | 12275 = | 111 (1.030) | coding (54/1104 nt) | recF | DNA replication/repair protein | |||||
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
TGATGACTACTGAGCAAGTTCGTCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCATTTCGCAGCACCCGCCT > NC_002947/12094‑12391 | aggcagcctgttcgtactgaataaccggattcaggcgggtgctgcgaaatgaacgggccagcccgagcaaatgcacggcttcaagcacgctggtcttgccgctgccgttggcgccgtaaaggatgttgatgcggggggagggtaagagtg < 1:2073284‑M1/1‑1 (MQ=255) ggcagcctgttcgtactgaataaccggattcaggcgggtgctgcgaaatgaacgggtcagcccgagcaaatgcacggcttcaagcacgctggtcttgccgctgccgttggcgccgtaaaggatgttgatgcggggggagggtaagagtgt < 2:1983714‑M1/2‑1 (MQ=255) ggcagcctgttcggactgaataaccggattcaggcgggtgctgcgaaatgaactggccagccagagtaaatgcgctattgcaagcacgcgggggttgccgctgccgttggcgccgtaaaggatgttgatgcggggggagggtaagagtgt > 1:373411‑M1/149‑150 (MQ=255) gatgaCTACTGAGCAAGTTCGTCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGt > 1:2883016/1‑150 (MQ=255) tgaCTACTGAGCAAGTTCGTCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGt < 2:1356689/148‑1 (MQ=255) tactGAGCAAGTTCGTCTGATCTTGTCCGATTCAAACATCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACcgc > 2:1769457/1‑150 (MQ=255) ctGAGCAAGTTCGTCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCATGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCgg < 1:2089643/150‑1 (MQ=255) gcaacAAGTTCGTCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAAAAAATAGAAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGt > 1:107091/5‑150 (MQ=255) cAAGTTCGTCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTgcgc > 2:475364/1‑150 (MQ=255) aGTTCGTCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCaa < 2:2546665/150‑1 (MQ=255) gTTCGTCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAAc > 2:1891961/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAAc > 2:357369/1‑150 (MQ=255) ttCGTCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACt < 1:478107/150‑1 (MQ=255) tCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCCAGGAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCa < 1:807822/150‑1 (MQ=255) tCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCa > 2:6593/1‑150 (MQ=255) cTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGt < 1:2447291/150‑1 (MQ=255) cTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGt > 1:522596/1‑150 (MQ=255) gTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCAc > 2:1285852/1‑123 (MQ=255) 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aCAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTAcc < 1:1216504/148‑1 (MQ=255) aCAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCt < 1:2042331/150‑1 (MQ=255) agcagTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTcc > 1:2322843/1‑150 (MQ=255) cagTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTcccc < 1:2454710/150‑1 (MQ=255) cagTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTcccc > 1:403726/1‑150 (MQ=255) 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ggAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCt < 1:1587986/150‑1 (MQ=255) aGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTa > 1:1340219/1‑150 (MQ=255) cTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACg < 2:2340768/150‑1 (MQ=255) tGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACActc > 2:1722415/1‑118 (MQ=255) tGGCAATGACGATTCTTCCGACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACActc < 1:1722415/118‑1 (MQ=255) ggCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGATGCGCAACTTGCACTCTTGGACTCTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGgc < 2:107091/150‑1 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tCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCgg < 2:1364570/137‑1 (MQ=255) tCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCgg > 1:1364570/1‑137 (MQ=255) tCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCa > 2:1600970/1‑150 (MQ=255) ccTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCAtt > 2:486941/1‑150 (MQ=255) cTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCAttt > 2:2981722/1‑150 (MQ=255) ttCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGc < 2:798885/111‑1 (MQ=255) ttCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCATTTc > 1:672861/1‑150 (MQ=255) cGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCATTTCgc < 1:1393915/150‑1 (MQ=255) aCGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTCCCATCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCATTTCgcag > 2:2281944/1‑150 (MQ=255) gTATCATTGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCa > 1:1375430/1‑99 (MQ=255) gTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCATTTCgcagca < 1:195146/150‑1 (MQ=255) gTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCATTTCgcagca > 2:2915278/1‑150 (MQ=255) gTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCATTTCgcagca > 1:1718826/1‑150 (MQ=255) tCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCAttt > 2:962642/1‑140 (MQ=255) tCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCAttt < 1:962642/140‑1 (MQ=255) tCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCATTTCGCAGCAccc > 2:1089056/1‑150 (MQ=255) attGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCATTTCgcag < 2:2244558‑M1/140‑1 (MQ=255) tGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCATTTCGCAGCACCCGcc > 2:1901846/1‑150 (MQ=255) | TGATGACTACTGAGCAAGTTCGTCTGATCTTGTCCGATTCAAACAGCAGTGCGCTGCTGCAGGAAGCTGGCAATGACGATTCTTCCTACGTTGTCATGCCGATGCGCCTGTAACCTGTAGCAGGCGAAATGTCCCTTCGACGTATCATGGTCACCGCGGTGCGCAACTTGCACCCGGTGACACTCTTACCCTCCCCCCGCATCAACATCCTTTACGGCGCCAACGGCAGCGGCAAGACCAGCGTGCTTGAAGCCGTGCATTTGCTCGGGCTGGCCCGTTCATTTCGCAGCACCCGCCT > NC_002947/12094‑12391 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |