| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 395240 | 133 (1.160) | 8 (0.070) | 8/232 | NT | 5.9% | coding (619/1200 nt) | fdhA | formaldehyde dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 395249 | 131 (1.200) | coding (628/1200 nt) | fdhA | formaldehyde dehydrogenase | |||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
GCCATGGAAAAGATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAGTG > NC_002947/395093‑395389 | gCCATGGAAAAGATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCACACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGTCCGGTCGGCCTGGCCGGCGCTGCCT‑‑‑CGgcgcgc > 2:2227131/1‑150 (MQ=255) ccATGGAAAAGATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGcc < 2:1879226/150‑1 (MQ=255) aTGGAAAAGATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCctg > 1:2267122/1‑150 (MQ=255) tGGAAAAGATCCGTGACGTGACCTTCCTGTCCGACATCCTGACCAAAGACTATAAGGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTTCAGGGAGCACTGTCTACCTTGCCGGTGCTGGACCGGTAGGCCGGGCCGCCGAAGACT‑‑‑GGGCGCGCgtgc > 2:820733/1‑150 (MQ=255) ggAAAAGATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCctgct > 1:1974568/1‑150 (MQ=255) aaaGATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGg < 1:1873198‑M2/150‑2 (MQ=255) gATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGgcgc < 2:137111‑M2/150‑5 (MQ=255) gTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCt < 1:322122/150‑1 (MQ=255) gacctgacctGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCtgt < 1:133143/150‑1 (MQ=255) acctgacctgCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCtgtg > 1:849782/1‑150 (MQ=255) ctgacctgCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCTCGGCGGCGCccagcaggcgcgccgaggca > 1:1065765‑M1/1‑130 (MQ=255) tgacctgCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTaa < 1:2320219/150‑1 (MQ=255) tgacctgCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTaa > 1:928332/1‑150 (MQ=255) ctgcctgTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCtgt > 1:935260/1‑142 (MQ=255) gcctgTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAAtcgtcg > 2:1143134/1‑150 (MQ=255) gcctgTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAAtcgtcg < 2:2982297/150‑1 (MQ=255) cctgTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGTGACTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCgg > 1:1727260/1‑150 (MQ=255) cctgTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCgg < 2:2138914/150‑1 (MQ=255) cctgTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCgg > 1:123634/1‑150 (MQ=255) tCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGAc > 1:1107985/1‑150 (MQ=255) cccACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTTTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGGCTGTGTAATGGTCGGTGACCTGAACCCGGcc > 2:1374200/1‑150 (MQ=255) ccACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGccc > 2:1216890/1‑150 (MQ=255) ccACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGccc > 1:1812038/1‑150 (MQ=255) aCCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGc > 1:1576081/1‑150 (MQ=255) aCCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCCGCCGGTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGc > 1:2384006/1‑150 (MQ=255) ggCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTATACCTTTCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTg < 1:675619/150‑1 (MQ=255) aTCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGACAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTCGGCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCTGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGccc > 2:464291/1‑150 (MQ=255) tCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCgg < 1:3045733/123‑1 (MQ=255) tCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCgg > 2:3045733/1‑123 (MQ=255) aCGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGC < 1:2618859‑M1/90‑1 (MQ=255) aCGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGC > 2:2618859‑M1/1‑90 (MQ=255) cGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGc > 1:1677697/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGc < 2:1496076/150‑1 (MQ=255) tGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCaa < 1:1390707/150‑1 (MQ=255) 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tGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACa < 2:1000060/150‑1 (MQ=255) tGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACa > 2:1052996/1‑150 (MQ=255) gccgcgGCTACCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGGCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACAtt < 1:143973/150‑1 (MQ=255) gccgccGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCg > 1:1452686/1‑97 (MQ=255) gccgccGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCg < 2:1452686/97‑1 (MQ=255) ccgccgCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGACGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATtc > 1:1312980/1‑150 (MQ=255) cTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACa < 1:1961827/141‑1 (MQ=255) cTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCg > 2:2494296/1‑150 (MQ=255) tGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGgcgccgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacagtgctgcctggaccaacgccagcagtcacggcaccgtgatagccggtgggcaggatgtcggacaggcaggtcag < 2:1065765‑M2/150‑131 (MQ=255) cT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGgcgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacagtgctgcctggaccaacgcca < 1:1582171‑M2/91‑75 (MQ=255) cT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGgcgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacagtgctgcctggaccaacgcca > 2:1582171‑M2/1‑17 (MQ=255) cT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGCNNAATCGTCGGNGACCNGAANCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTTCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGAGCTTCTGGGCGAGcc > 1:2873046/1‑150 (MQ=255) t‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGgcgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacag < 1:1229948‑M2/70‑55 (MQ=255) t‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGTCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCg > 1:1981557/1‑150 (MQ=255) cGGCGCGCCTGCTGGgcgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacagtgctgc > 1:454617‑M2/1‑15 (MQ=255) gcgcccagcaggcgcgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacagtgctgcctggaccaacgccagcagtcacggcaccgtgatagccggtgggcaggatgtcggacaggcaggtcaggtcacggatc > 2:2273414‑M1/1‑4 (MQ=255) cgcgcCTGCTGGGCGCCCCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGCCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAg < 2:2873046/150‑1 (MQ=255) gcccagcaggcgcgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacagtgctgcctggaccaacgccagcagtcacggcaccgtgatagccggtgggcaggatgtcggacaggcaggtcaggtcacggatctt > 2:1143010‑M1/1‑2 (MQ=255) cgcCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGACGGAAGTg < 1:1216890/150‑1 (MQ=255) cccagcaggcgcgccgaggcagcggcggccaggccgaccgggccagcaccggcaacgtagacagtgctgcctggaccaacgccagcagtcacggcaccgtgatagccggtgggcaggatgtcggacaggcaggtcaggtcacggatcttt < 1:1873198‑M1/150‑150 (MQ=255) | GCCATGGAAAAGATCCGTGACCTGACCTGCCTGTCCGACATCCTGCCCACCGGCTATCACGGTGCCGTGACTGCTGGCGTTGGTCCAGGCAGCACTGTCTACGTTGCCGGTGCTGGCCCGGTCGGCCTGGCCGCCGCTGCCT‑‑‑CGGCGCGCCTGCTGGGCGCCGCCTGTGTAATCGTCGGTGACCTGAACCCGGCCCGCCTGGCCCACGCCAAGTCGCAAGGCTTCGAAGTGGTCGACCTGTCCAAGGACACCCCGCTGCACGAGCAGATCGTCGACATTCTCGGCGAGCCGGAAGTG > NC_002947/395093‑395389 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |