New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 733469 = | 81 (0.710) | 13 (0.120) +TGTTTCAAAA |
12/224 | NT | 14.1% | intergenic (+3/‑2) | PP_t07/PP_t08 | tRNA‑Asn/tRNA‑Pro |
? | NC_002947 | 733635 = | 92 (0.800) | intergenic (+6/‑41) | PP_t09/PP_t10 | tRNA‑Lys/tRNA‑Pro |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
GACAACGCGAAAGCGAAGAAGCTAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTGGTCGTAGGTTCGAAT > NC_002947/733320‑733613 | gACAACGCGAAAGCGAAGAAGCTAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAAtc > 1:964691/1‑150 (MQ=255) gctaaaGCGAAGAAGCTAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCgggg > 2:2820312/4‑150 (MQ=255) gcgAAAGCGAAGAAGCTAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCggg > 2:585614/1‑149 (MQ=255) gcgAAAGCGAAGAAGCTAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCGTCGGAGGTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCgggg > 2:812440/1‑150 (MQ=255) ctaacgacccaaaaatggtcggggtgaggggattcgaactcctgacatcctgctcccaaagcaggcgcgctaccggactgcgctacaccccgagtgtttcaaagaaaagggcatctcaaagagatgcccttttttttgaaacaCTCgggg > 2:2329752‑M1/144‑150 (MQ=255) gCGAAGAAGCTAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCggg > 1:584523/1‑143 (MQ=255) gCGAAGAAGCTAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCggg < 2:584523/143‑1 (MQ=255) gaagaaGCTAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAgcgc > 1:1854347/1‑150 (MQ=255) gaagCTAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGt > 2:496177/1‑150 (MQ=255) gCTAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATAATTAGCTATGTATATCTAGTCCAGGTCTCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCg > 2:860831/1‑150 (MQ=37) tAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGt > 1:1565856/1‑150 (MQ=255) tAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGCGTAGCGCAGTCCGGt > 1:630901/1‑150 (MQ=255) gTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAgcgcg < 1:1305852/150‑1 (MQ=255) gAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTATCGAAGTTCAGTTACGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTg > 2:240610/1‑150 (MQ=255) cGAACACAGTCTTTGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCttt < 1:1123509/150‑1 (MQ=255) cGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCttt < 2:1565856/150‑1 (MQ=255) cGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCttt < 1:1074820/150‑1 (MQ=255) gAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTg < 1:2566417/150‑1 (MQ=255) aaCACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTgg < 1:1251232/150‑1 (MQ=255) caGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGc < 1:2628790/150‑1 (MQ=255) gTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAg < 1:1475487/150‑1 (MQ=255) tCTTCGGAGTCGTACCGAAGTTCAGGACCGCGATAGATCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGTGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAgg < 2:494440/150‑1 (MQ=25) ttCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCggg < 2:801049/108‑1 (MQ=255) ttCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCggg > 1:801049/1‑108 (MQ=255) ttCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAATCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGCCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAt > 1:724591/1‑150 (MQ=255) ggTTGTACCGAACTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGTTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAg < 2:2066003/149‑1 (MQ=255) aGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAg < 2:1436194/150‑1 (MQ=255) aGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAATCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGCCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAg < 2:724591/150‑1 (MQ=255) tcccGACGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTCGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGtt > 2:2203809/3‑150 (MQ=255) tACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGCGCGAATCGCTGGGGGTTGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATATGAAGAGtt > 2:94239/1‑150 (MQ=21) tACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCttt < 2:2312848/129‑1 (MQ=255) tACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCttt > 1:2312848/1‑129 (MQ=255) tACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGa < 2:1378693/139‑1 (MQ=255) tACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGa > 1:1378693/1‑139 (MQ=255) ccGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGTGAGCAGGATGTCAGGAGTTCg > 2:1091238/1‑150 (MQ=255) ccGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCg > 2:262970/1‑150 (MQ=255) cGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGGGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGa > 1:489568/1‑150 (MQ=255) cGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTAAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGa > 2:601666/1‑150 (MQ=255) gAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGaa < 2:1589333/150‑1 (MQ=255) gttcagttcCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATcc < 1:2820312/150‑1 (MQ=255) ttcagttcCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATccc < 2:630901/150‑1 (MQ=255) ttcagttcCGCGATAGCTAAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATccc < 1:601666/150‑1 (MQ=255) agttcCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTc > 2:1979032/1‑140 (MQ=255) agttcCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTc < 1:1979032/140‑1 (MQ=255) gATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGAc < 1:812440/150‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAgcgcgc < 1:2696812/97‑1 (MQ=255) tCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAgcgcgc > 2:2696812/1‑97 (MQ=255) gTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTCGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTc > 2:2737875/1‑150 (MQ=255) gTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTACGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCCGACCTTCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTc < 1:860831/150‑1 (MQ=25) tAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCg > 1:2738830/1‑150 (MQ=255) gCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAg < 1:496177/150‑1 (MQ=255) aaTGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTc > 1:558006/1‑150 (MQ=255) aTGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAt > 1:1172391/1‑99 (MQ=255) aTGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGAt < 2:1172391/99‑1 (MQ=255) aTGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAAt < 2:541774/114‑1 (MQ=255) aTGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAAt > 1:541774/1‑114 (MQ=255) aCTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGtt > 1:843527/1‑150 (MQ=255) tcaaaaaaaagggcatctctttgagatgcccttttttttgaaacaCTCgg > 2:1358103‑M1/46‑50 (MQ=255) tcaaaaaaaagggcatctctttgagatgcccttttttttgaaacaCTCgg < 1:1358103‑M1/5‑1 (MQ=255) gTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCTGGTAGCGGAGCCAATCGCGGGGTGTACCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGt < 2:400942/150‑1 (MQ=255) gTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGt > 1:1563794/1‑150 (MQ=255) tCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc < 1:559633/150‑1 (MQ=255) tCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGc > 2:559633/1‑150 (MQ=255) aaaagggcatctctttgagatgcccttttttttgaaacaCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAAt < 1:2466426‑M1/63‑1 (MQ=255) aaaagggcatctctttgagatgcccttttttttgaaacaCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAAt > 2:2466426‑M1/40‑102 (MQ=255) aaagggcatctctttgagatgcccttttttttgaaacaCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTg > 2:191407‑M1/39‑76 (MQ=255) aaagggcatctctttgagatgcccttttttttgaaacaCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTg < 1:191407‑M1/38‑1 (MQ=255) gggcatctctttgagatgcccttttttttgaaacaCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTgg > 2:1370744‑M1/36‑74 (MQ=255) gggcatctctttgagatgcccttttttttgaaacaCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTgg < 1:1370744‑M1/39‑1 (MQ=255) gggcatctctttgagatgcccttttttttgaaacaCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGa < 1:2976999‑M1/41‑1 (MQ=255) gggcatctctttgagatgcccttttttttgaaacaCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGa > 2:2976999‑M1/36‑76 (MQ=255) ggcatctctttgagatgcccttttttttgaaacaCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTgg < 1:823869‑M1/39‑1 (MQ=255) ggcatctctttgagatgcccttttttttgaaacaCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTgg > 2:823869‑M1/35‑73 (MQ=255) ggTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTgg > 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gTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTg < 1:262970/150‑1 (MQ=255) atgcccttttttttgaaacaCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTgg > 2:1466583‑M1/21‑59 (MQ=255) atgcccttttttttgaaacaCTCGGGGTGTAGAGCAGGCCGGTAGCGCGCCTGCTTTgg < 1:1466583‑M1/39‑1 (MQ=255) tCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGc < 1:285493/115‑1 (MQ=255) tCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGc > 2:285493/1‑115 (MQ=255) tCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGGCt > 1:2860452/1‑137 (MQ=255) tCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGGCt < 2:2860452/137‑1 (MQ=255) tCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTgg > 1:1880673/1‑150 (MQ=255) tCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTgg < 2:558006/150‑1 (MQ=255) ccAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTGGt < 2:1854347/150‑1 (MQ=255) cAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTGGTc > 2:2832425/1‑150 (MQ=255) gcgGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTagag > 1:2857204/1‑120 (MQ=255) gcgGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTagag < 2:2857204/120‑1 (MQ=255) ggAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTCGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTGGTCGTAGGTTc < 1:2737875/150‑1 (MQ=255) ccAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAg < 2:658604/58‑1 (MQ=40) ccAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAg > 1:658604/1‑58 (MQ=40) ccAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTGGTCGTAGGTTCGAAt > 2:287839/1‑150 (MQ=255) acaCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTg > 1:2937219‑M1/4‑41 (MQ=255) aaTCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTg > 2:2937219/1‑41 (MQ=38) aaTCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGtt < 2:193348/105‑1 (MQ=255) aaTCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGtt > 1:193348/1‑105 (MQ=255) | GACAACGCGAAAGCGAAGAAGCTAAAGAGTCCGAAGCGAACACAGTCTTCGGAGTTGTACCGAAGTTCAGTTCCGCGATAGCTCAGTCGGTAGAGCAAATGACTGTTAATCATTGGGTCCCTGGTTCGAGTCCAGGTCGCGGAGCCAATCTCGGGGTGTAGCGCAGTCCGGTAGCGCGCCTGCTTTGGGAGCAGGATGTCAGGAGTTCGAATCCCCTCACCCCGACCATTTTCCGGGTCGTTAGCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGGCTTTTAACCAATTGGTCGTAGGTTCGAAT > NC_002947/733320‑733613 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |