| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | = 1088617 | 113 (1.040) | intergenic (+108/‑146) | pmbA/PP_0943 | regulatory protease/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
AAGTCACCATCGCCGGAAACATGAAGGACATGTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAAGACCCGGCCCTCGCGCCGGGTT > NC_002947/1088379‑1088677 | aaGTCACCATCGCCGGAAACATGAAGGACATGTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCGCCGGCC > 2:724491‑M1/1‑150 (MQ=255) aCCATCGCCGGAAACATGAAGGACATGTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCGCCGGCCCTTTc > 1:1171058/1‑150 (MQ=255) aCCATCGCCGGAAACATGAAGGACATGTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCGCCGGCCCTTTc > 1:2511513/1‑150 (MQ=255) 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aCATGAAGGACATGTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCg < 2:2001623/150‑1 (MQ=255) aaGGACATGTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTCGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCGCCGGCCCTTTCGCGGGTTTACCCGcgaaa < 2:1690239/150‑5 (MQ=255) aGGACATGTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:1779105/145‑1 (MQ=255) tgtgCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACggt < 2:1104547/150‑1 (MQ=255) ttCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACggtgg < 1:1012419/150‑1 (MQ=255) 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ggCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAAGACCCGGCCCTCGCGCCgg > 1:321869/1‑150 (MQ=255) ggCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAAGACCCGGCCCTCGCGCCgg < 2:2786580/150‑1 (MQ=255) ggCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAAGACCCGGCCCTCGCGCCgg < 1:1267725/150‑1 (MQ=255) gCCtcttcgcgggtgaacccgctcctacaacggcctgtgtccaaccccgatgtacgtccaccaccgtgtaggagcgggtttacccgcgaaagggccggcgcaggctaaagatcagctaccagcaacggtcatcc > 2:1299468‑M1/1‑3 (MQ=255) gCCtcttcgcgggtgaacccgctcctacaacggcctgtgtccaaccccgatgtacgtccaccaccgtgtaggagcgggtttacccgcgaaagggccggcgcaggctaaagatcagctaccagcaacggtcatcc < 1:1299468‑M1/134‑132 (MQ=255) cccTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAAGACCCGGCCCTCGCGCCGGGt > 1:1602569/1‑150 (MQ=255) ctcttcgctggtgaacccgctcctacaacggcctgtgtccaaccccgatgtacgtccaccaccgtgtaggagcgggtttacccgcgaaagggccggcgcaggctaaagatcagctacca < 2:2782338‑M1/119‑119 (MQ=255) ccTTTGGCGGGTAAACCCGCTCCTCCACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGTGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAAGACCCGGCCCTCGCGCCGGGtt > 2:822701/1‑150 (MQ=255) | AAGTCACCATCGCCGGAAACATGAAGGACATGTTCCAGCAGATTGTCGCGATCGGTAGCGATCTTGAAACCCGTAGCAATATTCATACGGGCTCGGTGTTGATCGAGCGGATGACCGTTGCTGGTAGCTGATCTTTAGCCTGCGCCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTGGTGGACGTACATCGGGGTTGGACACAGGCCGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGCACTACACCTTTCCCTGCAAATCCGAAGACCCGGCCCTCGCGCCGGGTT > NC_002947/1088379‑1088677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |