New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1447657 = | 146 (1.280) | 7 (0.060) | 6/234 | NT | 5.4% | coding (1748/2178 nt) | PP_1264 | fusaric acid resistance protein |
? | NC_002947 | 1447714 = | 106 (0.970) | coding (1805/2178 nt) | PP_1264 | fusaric acid resistance protein |
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
GCATGTTCGTCTGTGCCGCCGCCGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGT > NC_002947/1447510‑1447801 | gCATGTTCGTCTGTGCCGCCGCCGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCa > 1:2074351/1‑150 (MQ=255) cATGTTCGTCTGTGCCGCCGCCGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCAc > 1:2847157/1‑150 (MQ=255) acggcccatgacacggattgcctggcgccacggctgcgactcggcataggccgggtgcaccggggcgcgggcttgctccttgcgcagctcgatgacggtgtggccgatctccagcacggtgaacatccagccaatcagctggctctGCAc > 2:2105302‑M1/147‑150 (MQ=255) acggcccatgacacggattgcctggcgccacggctgcgactcggcataggccgggtgcaccggggcgcgggcttgctccttgcgcagctcgatgacggcgtggccgatctccagcacggtgaacatccagcccatcagctggctctGCAc < 2:2360771‑M1/4‑1 (MQ=255) acggcccatgacacggattgcctggcgccacggctgcgactcggcataggccgggtgcaccggggcgcgggcttgctccttgcgcagctcgatgacggcgtggccgatctccagcacggtgaacatccagcccatcagctggctctGCAc < 2:2821091‑M1/4‑1 (MQ=255) acggcccatgacacggattgcctggcgccacggctgcgactcggcataggccgggtgcaccggggcgcgggctggctccttgcgcagctcgatgacggcgtggccgatctccagcacggtgaacatcccttccatcagctggctctGCAc < 1:2461325‑M1/4‑1 (MQ=255) aTGTTCGTCTGTGCCGCCGCCGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCAcc > 1:2297376/1‑150 (MQ=255) tGTTCGTCTGGGCCGCCGCCGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCAccc > 2:898719/1‑150 (MQ=255) gTTCGTCTGTGCCGCCGCCGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCcg > 1:2925918/1‑150 (MQ=255) ttCGTCTGTGCCGCCGCCGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCcgc < 2:2775636/150‑1 (MQ=255) gTCTGTGCCGCCGCCGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGAc < 2:2925918/150‑1 (MQ=255) ttgtgCCGCCGCCGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAATGCTCTCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACct < 1:2173246/149‑1 (MQ=255) tgCCGCCGCCGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGTATTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACctgct < 1:1781306/150‑1 (MQ=255) tgCCGCCGCCGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGGGACctgct > 2:483630/1‑150 (MQ=255) gccgccgccGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACctgctg < 2:2426244/150‑1 (MQ=255) gccgccgccGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACctgctg < 1:2146137/150‑1 (MQ=255) gccgccgGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGGGACCTGCTGCAc < 1:483630/150‑1 (MQ=255) cgccgGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCa < 2:2502468/150‑1 (MQ=255) 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atcCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTg < 1:2200287/150‑1 (MQ=255) ccTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTggc > 1:568129/1‑150 (MQ=255) ccgccCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGcggcc > 2:1528723/1‑150 (MQ=255) cccAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGcggccggc < 2:1470209/150‑1 (MQ=255) cccAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGcggccggc > 1:2485288/1‑150 (MQ=255) ccAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCa > 1:1764095/1‑150 (MQ=255) cAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTggcggc < 1:352692/144‑1 (MQ=255) cAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTggcggc > 2:352692/1‑144 (MQ=255) cAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGCCCTATGGACCGGcggccgacta > 2:1709018/1‑146 (MQ=255) aaCAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCCAg > 2:1135337/1‑150 (MQ=255) aCAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGc < 2:217129/150‑1 (MQ=255) aGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAGAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCg > 1:441681/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGcc < 1:2447913/124‑1 (MQ=255) ccGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCa < 2:2191812/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCa > 2:2085551/1‑150 (MQ=255) cGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTTGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTggc > 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> 2:1820724/1‑134 (MQ=255) tCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTg < 1:1820724/134‑1 (MQ=255) cgatctccagcacggtgaacatccagcccatcagctggctctGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTg > 2:1147198‑M1/43‑98 (MQ=255) cGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCAt < 2:2484741/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATc > 2:2461325/1‑150 (MQ=255) ccgccTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGc < 1:2628788/136‑1 (MQ=255) ccgccTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGc > 2:2628788/1‑136 (MQ=255) cTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCAcc < 1:2635724/117‑1 (MQ=255) cTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCAcc > 2:2635724/1‑117 (MQ=255) gcgGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCa > 1:1556969/1‑150 (MQ=255) ggCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAg < 2:1859057/150‑1 (MQ=255) ggCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAg < 2:2666592/150‑1 (MQ=255) cTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCACGTTCGGAGGCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGCGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAg > 1:371275/1‑150 (MQ=255) gggCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCa < 1:1788762/84‑1 (MQ=255) tgcGGCTTTCGAAGGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGACTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACTCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGc > 2:813378/3‑150 (MQ=255) ccTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCaa > 1:1734579/1‑58 (MQ=255) ttCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCCCCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAgg < 2:345849/136‑1 (MQ=255) ttCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGcc > 2:1989285/1‑150 (MQ=255) ttCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGCCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGcc < 2:2156421/150‑1 (MQ=255) ttCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGATGACAAACTGCCTGTTCACCTTGCTGGATATCGGCTACGCCGTCACCGACCTTCGCAAGGAGCAAGCCCGCGcc > 1:2360771/1‑150 (MQ=255) tgcGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGCCAGGCCTCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGCCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGcc < 1:809589/148‑1 (MQ=255) tCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGccc < 1:1236224/150‑1 (MQ=255) tCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGccc > 2:523186/1‑150 (MQ=255) cGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGcccc > 1:1366377/1‑150 (MQ=255) aaaGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGCAAGGCTACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCgg < 2:107322/150‑1 (MQ=255) aaaGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCgg > 1:113589/1‑150 (MQ=255) GCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGt < 1:514638‑M1/145‑1 (MQ=255) | GCATGTTCGTCTGTGCCGCCGCCGGGGCGATCATCCTGCCGCCCAACAGCCGCTGGTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGT > NC_002947/1447510‑1447801 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |