New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 1447657 = | 146 (1.280) | 7 (0.060) | 6/234 | NT | 5.4% | coding (1748/2178 nt) | PP_1264 | fusaric acid resistance protein |
? | NC_002947 | 1447714 = | 106 (0.970) | coding (1805/2178 nt) | PP_1264 | fusaric acid resistance protein |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
GTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAATCCGTGTCATGGGCCGT > NC_002947/1447565‑1447859 | tgtgTAGCCGCCTGGAGCATGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCaga < 2:1541130/150‑1 (MQ=255) gtgGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCagag > 1:228819/1‑150 (MQ=255) tgGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCGGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGc < 2:1298926/150‑1 (MQ=255) gAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCa > 2:2541310/1‑150 (MQ=255) aGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCAGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAg < 2:1495288/150‑1 (MQ=255) gccgccTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAGAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGc < 2:441681/150‑1 (MQ=255) gccgccTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGACTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGc < 2:1674353/150‑1 (MQ=255) gccTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCaga > 1:646410/1‑141 (MQ=255) ccgggAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGAt < 2:1827576/147‑1 (MQ=255) ccTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGAt < 2:1135070/150‑1 (MQ=255) ccTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGAt < 2:323739/150‑1 (MQ=255) cTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATg < 1:2541310/150‑1 (MQ=255) tGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATgg < 1:2144495/150‑1 (MQ=255) 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gctgcACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGa > 2:1476804/1‑150 (MQ=255) gctgcACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGa < 2:1502159/150‑1 (MQ=255) ggccgccaggccataggcctggtgcagcaggtcgcgggtgcGGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGTTGGAGATCGGCGACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTc < 1:1842708‑M2/109‑1 (MQ=255) cTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTg > 1:1653831/1‑150 (MQ=255) aTGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGgc < 2:2632874/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGcc > 2:262680/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGga > 1:1874680/1‑61 (MQ=255) tGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGga < 2:1874680/61‑1 (MQ=255) gcggcCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCa > 1:2298730/1‑150 (MQ=255) ggccggcAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGCGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAAt < 2:1741049/150‑1 (MQ=255) ggccggcAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTAACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAAt > 1:1388608/1‑150 (MQ=255) aGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAATCCGTGTCa < 1:977171/150‑1 (MQ=255) gCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAATCCGTGTCAt < 1:2729056/150‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAATCCGTGTCATg < 2:2298730/150‑1 (MQ=255) ccGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAATCCGTGTCATg < 2:2074351/150‑1 (MQ=255) cGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAATCCGTGTCATgg < 1:1185861/150‑1 (MQ=255) gCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGc > 1:854662/1‑80 (MQ=255) gCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGc < 2:854662/80‑1 (MQ=255) gCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAATCCGTGTCATggg < 1:898719/150‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAATCCGTGTCATGGGc > 2:2303444/1‑150 (MQ=255) gtgcAGAGCCAGCTGATTGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACACCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAATCCGTGTCATGGGCCGt > 2:2105302‑M2/5‑150 (MQ=255) gtgcAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAATCCGTGTCATGGGCCGt < 2:2821091‑M2/146‑1 (MQ=255) gtgcAGAGCCAGCTGATGGAAGGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCCAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAATCCGTGTCATGGGCCGt < 1:2461325‑M2/146‑1 (MQ=255) | GTTGTGGAGCCGCCTGGAGCAGGCGTTGCGCGAGCAGGTGCTGTTCGCCATCAGCGGCCGCCTGCGCGGCCTGGGCTCGGCCTTCGAAAGCCGCACCCGCGACCTGCTGCACCAGGCCTATGGCCTGGCGGCCGGCAAGCCGCAGGTGCAGAGCCAGCTGATGGGCTGGATGTTCACCGTGCTGGAGATCGGCCACGCCGTCATCGAGCTGCGCAAGGAGCAAGCCCGCGCCCCGGTGCACCCGGCCTATGCCGAGTCGCAGCCGTGGCGCCAGGCAATCCGTGTCATGGGCCGT > NC_002947/1447565‑1447859 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |