New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
AAGCGGTAACCCTTGCCAAACGGCAAGGGCGGCGCAGGTACCTGATAGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGT > NC_002947/1559881‑1560175 | tcccctcctctcaaaccgatcgaacaaactatccttctgataggtccacctttaggcatttcatcgccggcaattcaacgccggatgacagacccgaagacgatcccggagggatgctgatcgtgcacatcgccgacatcaccatgttct < 2:410922‑M1/1‑1 (MQ=255) ctctcaaaccgatcgaacaaactatccttctgataggtccacctttaggcatttcatcgccggcaattcaacgccggatgacagacccgaagacgatcccggagggatgttgatcgtgcacatcgccgacatcaccatgttcTAc < 1:711702‑M1/3‑1 (MQ=255) ccTTGCCAAACGGCAAGGGCGGCGCAGGTACCTGATAGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGc > 1:492569/1‑150 (MQ=255) 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aGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGaa < 1:2653371/150‑1 (MQ=255) aGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGaa < 2:1835290/150‑1 (MQ=255) aGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGaa < 2:963312/150‑1 (MQ=255) gATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCa > 2:2380537/1‑60 (MQ=255) gATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAg < 2:1999374/150‑1 (MQ=255) caccatgttcTACGCCCCGGCCAGCGGTGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGa < 1:259943‑M1/129‑1 (MQ=255) caccatgttcTACGCCCCGGCCAGCGGTGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGa > 2:259943‑M1/11‑139 (MQ=255) accatgttcTACGCCCCGGCCAGCGGTGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGAc < 2:2812597‑M1/130‑1 (MQ=255) aGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGAt < 1:718785/150‑1 (MQ=255) gtacgtacGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGc > 2:1311730/1‑109 (MQ=255) gtacgtacGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGc < 1:1311730/109‑1 (MQ=255) tacgtacgCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAg < 2:1869901/61‑1 (MQ=255) tacgtacgCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGc > 1:1917436/1‑122 (MQ=255) tacgtacgCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGt > 1:2431463/1‑150 (MQ=255) gtacgCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGAt > 2:3015203/1‑55 (MQ=255) | AAGCGGTAACCCTTGCCAAACGGCAAGGGCGGCGCAGGTACCTGATAGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGT > NC_002947/1559881‑1560175 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |