New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1560030 = | 115 (1.000) | 6 (0.060) | 6/232 | NT | 5.3% | coding (60/1122 nt) | PP_1370 | group 1 family glycosyl transferase |
? | NC_002947 | 1560054 = | 104 (0.960) | coding (36/1122 nt) | PP_1370 | group 1 family glycosyl transferase |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GGGCGGCGCAGGTACCTGATAGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGATCGGTTTGAGAGGAGGGGAG > NC_002947/1559907‑1560203 | gggCGGCGCAGGTACCTGATAGATGCAATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGAGTCGAGACGGTGCTGTTTGTCCTCAAAATCGGTATGTACGCCACCTCTGGCCTGGGCGTAGaa < 2:1275222/150‑1 (MQ=255) ggcgCAGGTACCTGATAGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATg < 1:2296774/150‑1 (MQ=255) gcAGGTACCTGATAGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTg < 2:1454226/150‑1 (MQ=255) gTACCTGATAGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGt > 2:1481506/1‑150 (MQ=255) tACCTGATAGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTc > 2:1509700/1‑150 (MQ=255) cTGATAGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGc > 1:1744768/1‑150 (MQ=255) tGATAGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCg > 2:468984/1‑150 (MQ=255) gtccacctttaggcatttcatcgccggcaattcaacgccggatgacagacccgaagacgatcccggagggatgctgatcgtgcacatcgccgacatcaccatgttctacgccaccgctggccggggcgtaGAACATGGt > 1:2812597‑M2/131‑139 (MQ=255) tccacctttaggcatttcatcgccggcaattcaacgccggatgacagacccgaagacgatcccggagggatgctgatcgtgcacatcgccgacatcaccatgttctacgccaccgctggccggggcgtaGAACATGGTg > 2:259943‑M2/130‑139 (MQ=255) aTAGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGAt < 1:1277298/150‑1 (MQ=255) aGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGCCGAtgt < 2:2204897/150‑1 (MQ=255) gATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGAtgtg > 2:2332878/1‑150 (MQ=255) aTGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGc > 2:529481/1‑150 (MQ=255) tGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCa < 1:1509700/150‑1 (MQ=255) ccATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACg < 1:2332878/150‑1 (MQ=255) cATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGa > 2:1024888/1‑150 (MQ=255) cGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCa < 1:1024888/150‑1 (MQ=255) gtgtTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCAt < 2:2540312/150‑1 (MQ=255) gggCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTc > 1:638617/1‑150 (MQ=255) gcgcTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGGTGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCg < 1:632094/150‑1 (MQ=255) gcgcTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCg < 2:2735153/150‑1 (MQ=255) cTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGa < 2:2868689/150‑1 (MQ=255) cTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGa < 1:500514/150‑1 (MQ=255) gCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCgg < 2:1537446/118‑1 (MQ=255) cACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGt < 1:3009300/150‑1 (MQ=255) aCCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTc > 2:2625548/1‑140 (MQ=255) aCCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTc < 1:2625548/140‑1 (MQ=255) ccGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCt > 2:650474/1‑150 (MQ=255) cGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCtt < 1:529481/150‑1 (MQ=255) gggAATCAACAGGCTGTGGCGTACGGCTTAAATGGCACCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTc < 2:1781613/150‑1 (MQ=255) gAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCgg < 1:2607986/150‑1 (MQ=255) gAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCgg < 1:874425/150‑1 (MQ=255) aaCAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTg > 1:2536101/1‑150 (MQ=255) aaCAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTg > 1:2016261/1‑150 (MQ=255) aaCAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTg < 1:1481506/150‑1 (MQ=255) aCAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGt > 2:558553/1‑150 (MQ=255) aGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATGAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATATCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCa > 1:2090808/1‑150 (MQ=255) tgGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGc < 2:2016261/150‑1 (MQ=255) tagCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGc < 1:870822/148‑1 (MQ=255) cGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGtt < 2:2475013/150‑1 (MQ=255) aCGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGaa < 1:529029/150‑1 (MQ=255) aCGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGaa < 2:2536101/150‑1 (MQ=255) gCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCgg > 1:2457753/1‑116 (MQ=255) gCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATc < 1:967678/138‑1 (MQ=255) gCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATc > 2:967678/1‑138 (MQ=255) gCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAAtt < 1:2554258/150‑1 (MQ=255) cTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCGTCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGc > 1:1499693/1‑150 (MQ=255) cTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGc > 2:2816412/1‑150 (MQ=255) cTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGc < 2:638617/150‑1 (MQ=255) ttGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGcc < 2:1744768/150‑1 (MQ=255) tGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCg < 1:468984/150‑1 (MQ=255) tGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGa < 1:2821207/150‑1 (MQ=255) tGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGa > 2:152392/1‑150 (MQ=255) gagaCGGTGCTGTTTGGGATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATg < 2:638282/150‑1 (MQ=255) gaCGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGcc < 1:3033964/150‑1 (MQ=255) ggTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCAc < 1:1124485/79‑1 (MQ=255) ggTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCAc > 2:1124485/1‑79 (MQ=255) gTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACGTGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTaaa < 2:2055938/150‑1 (MQ=255) tttGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCCAAGTTTTCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGa < 1:1146105/150‑1 (MQ=255) tttGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCGTTCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGCATTGCCGGCGAGGAAAGGCCTAAAGGTGGa > 1:2972283/1‑150 (MQ=255) gCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTa > 1:1999374/1‑150 (MQ=255) aTCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATc > 2:2604905/1‑150 (MQ=255) cAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTAGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGAGGGTCTTCGGGACTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGGGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAg > 1:920923/1‑150 (MQ=255) aaGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGAtgt < 2:827991/59‑1 (MQ=255) aGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGt > 1:1739838/1‑93 (MQ=255) aGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGaa < 2:1835290/150‑1 (MQ=255) aGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGaa < 2:963312/150‑1 (MQ=255) aGATAGGTACCTGCGCCACCGCTGGCCAGTGCGTAGAACATGATGATGGCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGaa < 1:767272/150‑1 (MQ=255) gATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCa > 2:2380537/1‑60 (MQ=255) gATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAg < 2:1999374/150‑1 (MQ=255) caccatgttcTACGCCCCGGCCAGCGGTGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGa < 1:259943‑M1/129‑1 (MQ=255) accatgttcTACGCCCCGGCCAGCGGTGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGAc > 1:2812597‑M1/10‑139 (MQ=255) accatgttcTACGCCCCGGCCAGCGGTGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGAc < 2:2812597‑M1/130‑1 (MQ=255) aGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGAt < 1:718785/150‑1 (MQ=255) gtacgtacGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGc > 2:1311730/1‑109 (MQ=255) gtacgtacGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGc < 1:1311730/109‑1 (MQ=255) tacgtacgCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAg < 2:1869901/61‑1 (MQ=255) tacgtacgCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGc > 1:1917436/1‑122 (MQ=255) tacgtacgCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGc < 2:1917436/122‑1 (MQ=255) tacgtacgCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGt > 1:2431463/1‑150 (MQ=255) gtacgCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGAt > 2:3015203/1‑55 (MQ=255) CGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTTATGTCGGCGATGTGCACTATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTc > 2:685071‑M1/1‑150 (MQ=255) ccccggccagcggtggcgtaGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCgg < 1:294048‑M2/44‑1 (MQ=255) ccccggccagcggtggcgtaGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCgg > 2:294048‑M2/21‑64 (MQ=255) CACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGa < 1:1778340‑M1/108‑1 (MQ=255) CACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGa > 2:1778340‑M1/1‑108 (MQ=255) CACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGAt > 1:2604905‑M1/1‑150 (MQ=255) CACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGAt < 2:2980731‑M1/150‑1 (MQ=255) gCTGGACGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGATCGGt < 1:1287911/150‑1 (MQ=255) tGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGATCGGttt > 1:578394/1‑150 (MQ=255) cGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGATCGGTTTgaga < 2:578394/150‑1 (MQ=255) ggggCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAgg > 1:3052816/1‑125 (MQ=255) ggggCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAgg < 2:3052168/125‑1 (MQ=255) ggggCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAgg > 1:3052168/1‑125 (MQ=255) gtaGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGATCGGt < 1:431946‑M2/135‑1 (MQ=255) gtaGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCCGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGATCGGt > 2:431946‑M2/4‑138 (MQ=255) gtaGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAACATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGATCGGTTTGagag > 2:711702‑M2/4‑145 (MQ=255) gtaGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAACATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGATCGGTTTGagag < 1:711702‑M2/142‑1 (MQ=255) aGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGATCGGTTTGAGAGGAGGGGa < 2:410922‑M2/149‑1 (MQ=255) gAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGATCGGTTTGAGAGGAGGGGAg > 2:1294115/1‑150 (MQ=255) | GGGCGGCGCAGGTACCTGATAGATGCCATCGCCGTGTTGGGCGCTGGCACCGGGAATCAACAGGCTGTGGCGTACGCCTTGAATGGCGTCGAGACGGTGATGTTTGGCATCAAGATAGGTACGTACGCCACCGCTGGCCGGGGCGTAGAACATGGTGATGTCGGCGATGTGCACGATCAGCATCCCTCCGGGATCGTCTTCGGGTCTGTCATCCGGCGTTGAATTGCCGGCGATGAAATGCCTAAAGGTGGACCTATCAGAAGGATAGTTTGTTCGATCGGTTTGAGAGGAGGGGAG > NC_002947/1559907‑1560203 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |