| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 1653990 = | 102 (0.890) | 7 (0.060) | 6/234 | NT | 6.6% | coding (2821/4527 nt) | PP_1449 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 1654020 = | 100 (0.910) | coding (2791/4527 nt) | PP_1449 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
CCGGCGGCGCGTACATTCAGGTCTTCGCCGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGACCGTCATGTCGGCCCCCACGCTGGGA > NC_002947/1653842‑1654138 | ccGGCGGCGCGTACATTCAGGTCTTCGCCGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGTCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCCCCTGACGCTGCGGTGCCTCGATTTCCAGTGACCCGGCATTg < 2:117220/150‑1 (MQ=255)ccGGCGGCGCGTACATTCAGGTCTTCGCCGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGTCGGCATTg < 1:10738/150‑1 (MQ=255)ccGGCGGCGCGTACATTCAGGTCTTCGCCGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTg < 1:1838001/150‑1 (MQ=255) aagcttcgcccgaagaagccattgcatctcccagcgtgggggccgacatgacggtcgaacacctcaagcgcctggaaaaccagcgccgtggaattgctcaggtcagcgagttgtccgcagcaaaggtcgaggtcaaggctgacacacTgg > 2:1477041‑M1/148‑150 (MQ=255) cggcgCGTACATTCAGGTCTTCGCCGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGccc < 2:1288401/150‑1 (MQ=255) tACATTCAGGTCTTCGCCGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGc < 1:2988930/150‑1 (MQ=255) aTTCAGGTCTTCGCTGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTAGTACGGTGGTTTCCAGGCTATATCCGGCGACGATCACTTCATGCAGCGGGGCCTGGTTTTGCGGCGAGCCTGCATTGGCCCGCCAGGCtgt < 2:349607/150‑1 (MQ=255) aTTCAGGTCTTCGCCGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAg < 1:1718002/145‑1 (MQ=255) aTTCAGGTCTTCGCCGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAg > 2:1718002/1‑145 (MQ=255) ggTCTTCGCAGGTGGTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGCTATTTTCGGCGGCGCTCAGCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCt < 2:414889/150‑1 (MQ=255) gTCTTCGCCGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTg > 1:948813/1‑150 (MQ=255) cTTCGCCGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGt < 2:2539075/150‑1 (MQ=255) gcacctcccagcgcgggggccgacatgacgggcgcacacctcaagcgcctggaaaaccagcgccgtggaattgatcaggtcaaggagttgtccgcagcaaaggtcgaggtcaaggctgacacatTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCg < 1:1137854‑M1/26‑1 (MQ=255) gCCGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGc > 2:89652/1‑150 (MQ=255) cGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCa > 1:1187224/1‑150 (MQ=255) tGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAgtg < 1:853641/150‑1 (MQ=255) ccgcgtgggggccgatatggcggtcgaacaagtcaagcgcctggaaaacgagcgccgtggaattgctcaggtcagcgagtggtccgcagcaaaggtcgcggtcaaggctgacacgcTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCagtgg > 2:1137854‑M1/117‑149 (MQ=255) tGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAgtgtgt < 1:2052873/150‑1 (MQ=255) 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aTAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCttt < 2:2073551/145‑1 (MQ=255) aTAGGCCAGGCGACCCACCGTGGTTACCTCATTGTTTTCGGCGGCGCTCGCCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTtgctgc < 2:804928/150‑1 (MQ=255) tAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCg < 2:26764/150‑1 (MQ=255) tAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCg < 2:2641796/150‑1 (MQ=255) aGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAgt > 1:3066097/1‑119 (MQ=255) 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atcTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGAcc < 1:1440340/148‑1 (MQ=255) ccTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCa < 2:2502205/113‑1 (MQ=255) ccTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCa > 1:2502205/1‑113 (MQ=255) cTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTc < 1:1252448/126‑1 (MQ=255) cTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTc > 2:1252448/1‑126 (MQ=255) tCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGCCCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGGCCGTc > 2:2627699/1‑150 (MQ=255) tCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGACCGTc > 1:117968/1‑150 (MQ=255) tCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGACCGTc < 1:972846/150‑1 (MQ=255) cGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGACCGTcc > 2:3065949/1‑149 (MQ=255) gATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGGGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACCTCTTGCTGCCAAGGGGATGCGCAGCGCGCCGAGGGTCCAGGCGCTCGAGGTGTTCGACCgagat > 2:1440340/1‑146 (MQ=255) tCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGACCGTCATGTCgg < 2:1145178/150‑1 (MQ=255) tCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGACCATCATGTCgg < 1:2936522/150‑1 (MQ=255) gCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGACCGTCATGTCGGccc > 1:611379/1‑150 (MQ=255) gCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGATTGAGGTGTTCGACCGTCATGTCGGccc < 1:2388543/150‑1 (MQ=255) cGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCTACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGACCGTCTTGTAGGCCCCCACGc > 2:1046356/1‑150 (MQ=255) cGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGACCGTCATGTCGGCCCCCACGc > 1:316873/1‑150 (MQ=255) cATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGACCGTCATGTCGGCCCCCACGCTgg < 2:2496126/150‑1 (MQ=255) aTTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTc > 2:1964505/1‑105 (MQ=255) aTTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTc < 1:1964505/105‑1 (MQ=255) ttGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGACCGTCATGTCGGCCCCCACGCTGGGa < 2:316873/150‑1 (MQ=255) | CCGGCGGCGCGTACATTCAGGTCTTCGCCGGTGCTGGTGTCCAGGCGCGCATCGCCACCATAGGCCAGGCGTTGAACGGTGGTTTCCTGGGTATTTTCGGCGGCGCTCACCTGATGCTGCTGCGCCTCGATTTTCAGCGAGCCGGCATTGGCCCGCCAGGCTGTGCCCTGGTCGGCCAGTGTGTCAGCCTTGACCTCGACCTTTGCTGCGGACAACTCGCTGACCTGAGCAATTCCACGGCGCTGGTTTTCCAGGCGCTTGAGGTGTTCGACCGTCATGTCGGCCCCCACGCTGGGA > NC_002947/1653842‑1654138 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |