New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 1919965 = | 97 (0.900) | coding (534/2115 nt) | prc | tail‑specific protease Prc |
Only 100 of 153 total aligned reads displayed.
TGGTGTGTGGGTCGTAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAGCTCGGCCAGG > NC_002947/1919781‑1920079 | acctcgaccgcgtcaagcaacgcctggacttcgccctggccgagctgaacaagggtgtggacaagattgacttcaccaccaaggaaaccttgctgatcgaccgcaaggacgcgccgtggatgaagaaccaggccgagctcgacgacttgt > 2:759546‑M1/150‑150 (MQ=255) ggTGTGTGGGTCGTAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTg < 2:2850892/150‑1 (MQ=255) ggTGTGTGGGTCGTAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCGGCTTGGGTTCCTTGGCGGCGATCTTCTg < 2:166365/150‑1 (MQ=255) 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aGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCgcag > 2:436293/1‑142 (MQ=255) ggACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCgac < 2:1066856/150‑3 (MQ=255) ggACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTc < 2:725530/150‑1 (MQ=255) tGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTg < 1:513062/150‑1 (MQ=255) tGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTg > 2:2667249/1‑150 (MQ=255) 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cTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTtggt < 2:744758/141‑1 (MQ=255) tcttctTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCTTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCt < 2:2854945/150‑1 (MQ=255) gCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTtgg > 2:811586/1‑132 (MQ=255) gCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGt > 1:1421950/1‑150 (MQ=255) tGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGCCAATCTTGTCca < 2:830520/150‑1 (MQ=255) gggTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAg < 2:2655303/136‑1 (MQ=255) gTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCacac > 2:3048969/1‑150 (MQ=255) ccTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCt < 1:2819871/120‑1 (MQ=255) ccTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCt > 2:2819871/1‑120 (MQ=255) cTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGc > 1:1950305/1‑64 (MQ=255) acagCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTCAGGTCGATGAGCACGGTATGCTTGGTGGTGATTGCAATCTTGTCCACACCCtt > 1:2410902/4‑150 (MQ=255) ttGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTg > 2:2990287/1‑150 (MQ=255) cGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAgtcgtc < 2:1934473/55‑1 (MQ=255) ggCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAg > 2:2593309/1‑150 (MQ=255) aTCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCa < 1:2643073/97‑1 (MQ=255) ttctGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAGCTCGGcc > 2:1916447/1‑150 (MQ=255) | TGGTGTGTGGGTCGTAGGACTGGGCAAAGGTGTTGATGTAGGCCTGGAAGATGTCCTCGGCACGGGTCTGGTCCAGGCGCGTGAGCTGGTTCTTGTAGCGCTTGATCAGGGTTTCCTGGATCTGCTTGGGTTCCTTGCCGGCGATCTTCTGGCGCAGCACTTCGTCTTTGACGCGTTTGCGCCACAAGTCGTCG‑AGCTCGGCCTGGTTCTTCATCCACGGCGCGTCCTTGCGGTCGATCAGCAAGGTTTCCTTGGTGGTGAAGTCAATCTTGTCCACACCCTTGTTCAGCTCGGCCAGG > NC_002947/1919781‑1920079 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |