| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2354594 | 125 (1.090) | 6 (0.060) | 4/228 | NT | 5.1% | intergenic (‑20/+38) | PP_2068/PP_2069 | multidrug MFS transporter membrane fusion protein/multidrug MFS transporter outer membrane protein |
| ? | NC_002947 | 3531425 = | 106 (0.990) | intergenic (+97/+86) | dnaEB/yeaE | error‑prone DNA polymerase/methylglyoxal reductase | |||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
TGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTCGCGCTCGCTGTCGAGC > NC_002947/2354446‑2354743 | cAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTgg > 1:2774007/1‑150 (MQ=255) aaTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTggg < 2:62466/150‑1 (MQ=255) aTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGc > 1:2989636/1‑150 (MQ=255) tctcGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACAAGGGCGAAGCCCGTGCCATACACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCg < 1:1605528/150‑1 (MQ=255) gAATTGGGCCTGGTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTGACTTTCTAAAAGGTGGCGCGTGTGGGAGAGGGCTTGCCCGCGAGCACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGc < 2:2006024/150‑1 (MQ=25) ttGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCg < 1:282536/150‑1 (MQ=255) tGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCgc < 1:650246/150‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCgctg > 1:2085665/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCgctgct > 1:990098/1‑150 (MQ=255) ccTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCgctgct < 1:616768/150‑1 (MQ=255) ccTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCCGGTACAGTGGGCGGGGCTCgctgct > 2:1165223/1‑150 (MQ=255) ctgctgGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGctgctg < 1:708887/150‑1 (MQ=255) ctgctgGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGctgctg > 1:1914514/1‑150 (MQ=255) tgctgGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTgg > 1:611522/1‑150 (MQ=255) gctgTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTg > 2:2304415/1‑150 (MQ=255) ctgTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGc < 2:1243604/150‑1 (MQ=255) tgTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGACGCACGTGACCTCAACCGCCGGCTTCGCGTCCGGGGGACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGcc > 2:2200405/1‑150 (MQ=21) ggTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTTCCtctc < 1:1202398/150‑1 (MQ=255) ggTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCtctc < 1:1222654/150‑1 (MQ=255) ggAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGc < 1:2660319/117‑1 (MQ=255) aCTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCAccgccc < 2:2506951/150‑1 (MQ=255) aCTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCAccgccc < 1:991166/150‑1 (MQ=255) tCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCgcccgccc > 1:1706098/1‑150 (MQ=255) cTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCa > 1:1196647/1‑150 (MQ=255) tCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCtt < 1:1685991/120‑1 (MQ=255) tCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAgcgcg > 1:182112/1‑150 (MQ=255) tCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGAGGACTTGTATCTGACTACGACCGACGCCCGACCCATCCATCTCTAAGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAgcgcg > 1:56690/1‑150 (MQ=255) ttCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGACCGTGCCATCCACCGCGGTGGATTCTGCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGaa > 1:2676680/1‑150 (MQ=255) tCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAAc > 2:912923/1‑150 (MQ=255) cTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACa < 1:1294937/150‑1 (MQ=255) tAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATTCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAg > 1:1502418/1‑150 (MQ=255) aaaaGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAgg > 2:2009314/1‑150 (MQ=255) aaaaGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAgg > 1:1646609/1‑150 (MQ=255) 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1:2624849/123‑1 (MQ=255) tgtATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTcgc < 1:2142585/150‑1 (MQ=255) tATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTCgcgc < 1:1940747/150‑1 (MQ=255) ttcttcGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAgcgcgc < 1:671056/71‑1 (MQ=255) ttcttcGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTCGcgctc > 2:1562553/1‑150 (MQ=255) ttcGCGGGcatgcccgctcccacagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaagacagctgctcccaaaggtcgcgtccagattgcgctcgcctacaccatcgccaaccgctgcttgcgcgtcggtgcagggaacgcccggtcgatcg > 2:1665065‑M1/1‑8 (MQ=255) ttcGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCt > 2:1292683/1‑103 (MQ=255) ttcGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTCGcgctcgct > 1:1877491/1‑150 (MQ=255) cgcgGGcatgcccgctcccacagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaagacagctgctcccaaaggtcgcgtccagattgcgctcgcctacaccatcgccaaccgctgcttgcgcgtcggtgcagggaacgcccggtcgatcgcc < 2:1317786‑M1/150‑145 (MQ=255) gcgGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTCGCGCTCGCTGTc < 2:2676680/150‑1 (MQ=255) gggcatgcccgctcccacagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaagacagctgctcccaaaggtcgcgtccagattgcgctcgcctacaccatcgccaaccgctgcttgcgcgtcggtgcagggaacgcccggt > 1:900318‑M1/1‑3 (MQ=255) gggcatgcccgctcccacagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaagacagctgctcccaaaggtcgcgtccagattgcgctcgcctacaccatcgccaaccgctgcttgcgcgtcggtgcagggaacgcccggt < 2:900318‑M1/139‑137 (MQ=255) ggcatgcccgctcccacagggatcgcgccagcttttagaaattgagcaagacagctgctcccaaaggtcgcgtccagattgcgctcgcctacaccatcgccaaccgctgcttgcgcgtcggtgcagggaacgcccggtcgatcgcccgca < 2:865834‑M1/150‑149 (MQ=255) gcatgcccgctcccacagggatcgcgccagcttttagacattgagcaagacagctgctcccaaaggtcgcgtccagattgcgctcgcctacaccatcgccaaccgctgcttgcgcgtcggtgcagggaacgcccggtcgatcgcccgcag < 1:26291‑M1/150‑150 (MQ=255) gTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTCGCGCTCGCTGTCGAGc > 2:2761716/1‑150 (MQ=255) | TGGTTTCCAATCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCAATTTCTAAAAGCTGGCGCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAAGCCCGTGCCATCCACCGCGGTGTATTCTTCGCGGGTACAGTGGGCGGTGCTCGCTGCTGGTCTTGCCTCTCGCTACCACCGCCCGCCCAGCGCGCGGAACAGGTTTACCTGCGCTTGCGCCAGGCGCCCTCGGGCTTCTGTGTGGTTGGCCCGCAGGCTGATCATTTCGCGCTCGCTGTCGAGC > NC_002947/2354446‑2354743 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |