| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_002947 | 2813386 = | 90 (0.830) | coding (528/1017 nt) | pheS | phenylalanine‑‑tRNA ligase subunit alpha | |||||
Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
AGCAGTTCTTCACCCACATTGGCTACGGCATTGCCGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTGATCGATC > NC_002947/2813208‑2813504 | gTTCTTCACCCACATTGGCTACGGCATAGCCGAAGGCCCCGAAGTCGAAAACCACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGACGCACGACACCTTATACTTCAATACCAACAtgctgatgccacc > 2:394594/1‑146 (MQ=255) ttgaggtcggcgaagttgatatcgcgatcgatcagcaggccttcgacctggtggaacatcggcgagtgggtgatatccgagtcgcagcggtatacgcggcccgggcacacaatgcgaatgggcggctgggtggactccatggtcCGCAcc < 2:2113165‑M1/6‑1 (MQ=255) ttcACCCACATTGGCTACGGCATTGCCGAGGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCAccc > 2:1254193/1‑148 (MQ=255) ttcACCCACATTGGCTACGGCATTGCCGAGGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCAccc < 1:1254193/148‑1 (MQ=255) ttcACCCACATTGGCTACGGCATTGCCGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCcac > 1:1675027/1‑150 (MQ=255) aCCCACATTGGCTACGGCATTGCCGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACAcc > 1:1760555/1‑150 (MQ=255) ttGGCTACGGCATTGCCGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCgg > 1:2958644/1‑150 (MQ=255) tACGGCATTGCCGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCaa > 2:2964935/1‑149 (MQ=255) tACGGCATTGCCGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAg > 2:2123976/1‑150 (MQ=255) tACGGCATTGCCGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAg > 1:1179022/1‑150 (MQ=255) cgcgatcgatcagcaggccttcgacctggtggaacatcggcgagtgggtgatatccgagtcgcagcggtatacgcggcccgggcacacaatgcgaatgggcggctgggtggactccatggtcCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGc > 1:1735022‑M1/123‑150 (MQ=255) ttGCCGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGa < 1:1264864/150‑1 (MQ=255) ccGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCa < 2:1179022/150‑1 (MQ=255) aaGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATgg > 2:936639/1‑150 (MQ=255) aGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGa < 1:936639/150‑1 (MQ=255) aGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGa < 1:695997/150‑1 (MQ=255) cAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCa < 2:556225/150‑1 (MQ=255) cAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCa > 2:1878374/1‑150 (MQ=255) cAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCa > 1:556225/1‑150 (MQ=255) cAGAAGTAGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTAGCCACCACCCCGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCa < 1:1980827/150‑1 (MQ=255) aaGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACAAGCTGCTGCGCACCCCCACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGGCCATGGAGTCCACCCAgccgc < 2:32493/150‑1 (MQ=255) acgacTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCa < 2:1038781/150‑1 (MQ=255) gacTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCa > 2:914975/1‑97 (MQ=255) gacTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCa < 1:914975/97‑1 (MQ=255) gacTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATg < 1:2115214/129‑1 (MQ=255) gacTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATg > 2:2115214/1‑129 (MQ=255) acTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTc < 1:1878374/150‑1 (MQ=255) tACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGc > 2:1464676/1‑150 (MQ=255) ccACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCa > 1:261980/1‑92 (MQ=255) ccACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCa < 2:261980/92‑1 (MQ=255) ccACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAt > 2:339832/1‑150 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTg < 1:1456606/114‑1 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAtt < 1:1951912/150‑1 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAtt > 1:2711692/1‑150 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAtt > 2:1859662/1‑150 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAtt > 1:446560/1‑150 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAt < 1:2063137/149‑1 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAt > 2:2063137/1‑149 (MQ=255) cacaACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTGCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCAtt > 2:1951912/1‑150 (MQ=255) caACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAATATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATtgt < 2:1750306/150‑1 (MQ=255) 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ttCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTccac > 1:523119/1‑150 (MQ=255) cTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTccacca < 2:814644/150‑1 (MQ=255) ttCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACAACTCGTCGGGGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTc > 1:1780971/1‑150 (MQ=255) cAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGa < 1:2196350/150‑1 (MQ=255) aTGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAg < 1:2502807/150‑1 (MQ=255) aTGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAg < 1:394594/150‑1 (MQ=255) tGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGa < 2:689575/47‑1 (MQ=255) tGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGa < 2:690355/47‑1 (MQ=255) tGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGa > 1:689575/1‑47 (MQ=255) tGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGa > 1:690355/1‑47 (MQ=255) cAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCct > 1:1939979/1‑150 (MQ=255) cAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAAGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCct < 1:2173268/150‑1 (MQ=255) aaCATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCctg > 2:360722/1‑150 (MQ=255) aaCATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCctg > 1:1440987/1‑150 (MQ=255) cATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCctgct > 1:2113165/1‑150 (MQ=255) gctgctgcGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTgat < 1:303527/150‑1 (MQ=255) gctgcGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTgatcga < 1:2370159/150‑1 (MQ=255) ctgcGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTgatcgat < 1:1859662/150‑1 (MQ=255) | AGCAGTTCTTCACCCACATTGGCTACGGCATTGCCGAAGGCCCAGAAGTGGAAGACGACTACCACAACTTCGAAGCGCTCAACATCCCTGGCCACCACCCGGCGCGGGCGATGCACGACACCTTCTACTTCAATGCCAACATGCTGCTGCGCACCCACACCTCGCCGGTGCAGGTGCGGACCATGGAGTCCACCCAGCCGCCCATTCGCATTGTGTGCCCGGGCCGCGTATACCGCTGCGACTCGGATATCACCCACTCGCCGATGTTCCACCAGGTCGAAGGCCTGCTGATCGATC > NC_002947/2813208‑2813504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |