New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 2980458 = | 110 (0.960) | 6 (0.050) | 4/236 | NT | 5.6% | coding (232/321 nt) | PP_2606 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2980493 = | 97 (0.880) | coding (197/321 nt) | PP_2606 | hypothetical protein |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CATTCAAGGGGGGGCATGGAAGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAACTCGCTGGTGAAAAAGCCCACCAGGTTGCCCAGGTGTTCGCTCTGCACC > NC_002947/2980311‑2980606 | caTTCAAGGGGGGGCATGGAAGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCg < 2:524706/150‑1 (MQ=255) aTTCAAGGGGGGGCATGGAAGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGc > 1:2011783/1‑150 (MQ=255) aTTCAAGGGGGGGCATGGAAGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGc > 2:1505777/1‑150 (MQ=255) tggctggccctgtaccaaagccacgcactcgaggtgcagagcgaacacctgggcaacctggtgggctttttcaccagcgagttcggcgacgtcaaccaagtggtgcacatctggggctatgccagcctcgacgaccgcatggcacgccgc > 1:2446918‑M1/147‑150 (MQ=255) aGGGGGGGCATGGAAGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAgc > 1:2702960/1‑150 (MQ=255) gCATGGAAGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCGCCT‑CCGGGTTGCTCCGCGGGAATCCGCCCCAGcccgcgcc > 2:392584/1‑146 (MQ=255) cATGGAAGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCt < 2:25913/150‑1 (MQ=255) aTGGAAGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTg > 1:1357915/1‑150 (MQ=255) aGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCt < 1:1884911/144‑1 (MQ=255) aGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCt > 2:1884911/1‑144 (MQ=255) gTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATgg < 1:1216127/150‑1 (MQ=255) ccGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCt < 1:169285/150‑1 (MQ=255) cTCGGATGTTGGAAGAAGAGGCGTTTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTgcg > 2:1725131/1‑150 (MQ=255) tGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGTAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGt < 1:1648221/150‑1 (MQ=255) tGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGt < 2:2917319/150‑1 (MQ=255) ggAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCa > 1:2318445/1‑150 (MQ=255) gaagaaGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCAt > 1:1499472/1‑150 (MQ=255) aagaagTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATg < 2:1499472/150‑1 (MQ=255) gaagTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCg > 1:73393/1‑107 (MQ=255) gTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGgtc > 2:2500015/1‑150 (MQ=255) gTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGgtc < 1:1116463/150‑1 (MQ=255) ggCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCg > 1:41072/1‑102 (MQ=255) ggCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCg < 2:41072/102‑1 (MQ=255) ctgggcaacctggtgggctttttcaccagcgagttcggcgacgtcaaccaagtggtgcacatctggggctatgccagcctcgacgaccgcatggcacgCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCgcggc > 2:553041‑M1/99‑134 (MQ=255) ctgggcaacctggtgggctttttcaccagcgagttcggcgacgtcaaccaagtggtgcacatctggggctatgccagcctcgacgaccgcatggcacgCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCgcggc < 1:553041‑M1/36‑1 (MQ=255) ctgggcaacctggtgggctttttcaccagcgagttcggcgacgtcaaccaagtggtgcacatctggggctatgccagcctcgacgaccgcatggcacgCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCgcggc < 1:552945‑M1/36‑1 (MQ=255) gtgGCTTACTGCAGCGGTGAGAACCCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAgg < 1:2185560/150‑1 (MQ=255) ggCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCt < 1:302032/150‑1 (MQ=255) gCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTg > 2:1629144/1‑150 (MQ=255) gCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTg < 1:2736962/150‑1 (MQ=255) gCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTg > 2:2054213/1‑150 (MQ=255) cTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTgg > 2:76670/1‑150 (MQ=255) ttACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGgtcgtc > 2:2408268/1‑141 (MQ=255) ttACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGgtcgtc < 1:2408268/141‑1 (MQ=255) tGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGt > 1:463028/1‑123 (MQ=255) tGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAg > 2:2045933/1‑150 (MQ=255) gCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTgcc < 2:801737/104‑1 (MQ=255) aGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCTCCAGGGCTGCG‑CTCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGccc < 1:1725131/150‑1 (MQ=255) aGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCa < 2:1092251/106‑1 (MQ=255) aGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCa > 1:1092251/1‑106 (MQ=255) aGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGccc < 1:1629144/150‑1 (MQ=255) 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tGCTTCGCTAGAATTCCGTCCAGCGAGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGTCTCCTATGTGCACTACTTGGTTGACGTCGCCGAACTCGCTGGTGAATAAGCCCACCAGGTTGCCCAGgt < 2:2130728/150‑1 (MQ=255) gCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAACTCGCTGGTGAAAAAGCCCACCAGGTTGCCCAGgt > 2:744792/1‑149 (MQ=255) gCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAACTCGCTGGTGAAAAAGCCCACCAGGTTGCCCAGgt < 1:744792/149‑1 (MQ=255) gTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAACTCGCTGGTGAAAAAGCCCACCAGGTTGCCCAGGTGtt > 2:2117292/1‑150 (MQ=255) gcgAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAAc < 1:2333179/110‑1 (MQ=255) gcgAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAAc > 2:2333179/1‑110 (MQ=255) gagaATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGcac > 1:2804200/1‑86 (MQ=255) gagaATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGcac < 2:2804200/86‑1 (MQ=255) agaATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAACTCGCTGGTGAAAAAGCCCACCAGGTTGCCCAGGAGATCggaag > 1:2970128/1‑146 (MQ=255) gaATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAACTCGCTGGTGAAAAAGCCCACCAGGTTGCCCAGGTGTTCGCTCTg < 2:1357915/150‑1 (MQ=255) aaTTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAACTCGCTGGTGAAAAAGCCCACCAGGTTGCCCAGGTGTTCGCTCTGc < 1:2117292/150‑1 (MQ=255) aaTTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAACTCGCTGGTGAAAAAGCCCACCAGGTTGCCCAGGTGTTCGCTCTGc < 2:2157194/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGAtgt > 1:2061760/1‑77 (MQ=255) ttCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGAtgt < 2:2061760/77‑1 (MQ=255) ttCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAACTCGCTGGTGAAAAAGCCCACCAGGTTGCCCAGGTGTTCGCTCTGCAc < 1:1606934/150‑1 (MQ=255) ttCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAACTCGCTGGTGAAAAAGCCCACCAGGTTGCCCAGGTGTTCGCTCTGCAc > 2:1685869/1‑150 (MQ=255) ttCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAACTAGCTGGTG‑AAAAGCCCACCAGGTTGCCCAGGTGTTCGCTCTGCAcc > 1:1963507/1‑150 (MQ=255) | CATTCAAGGGGGGGCATGGAAGGGGTCCGCTCGGATGTTGGAAGAAGTGGCGTGTGGCTTACTGCAGCGGTGAGAAACCGGTCGGGCGCAGCAGCCGCGATTGCAGGCGCAGTACCGCGCCCAGCT‑CGCGGTTGCGTCGCGAGAATTCCGCCCAGCGCGAGTCTGCCGCCATGGCTGCGCGGCGTGCCATGCGGTCGTCGAGGCTGGCATAGCCCCAGATGTGCACCACTTGGTTGACGTCGCCGAACTCGCTGGTGAAAAAGCCCACCAGGTTGCCCAGGTGTTCGCTCTGCACC > NC_002947/2980311‑2980606 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |