New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 3522816 | 100 (1.000) | intergenic (+560/‑137) | PP_5584/PP_3113 | hypothetical protein/transposase |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
CCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGA > NC_002947/3522610‑3522908 | ccGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGt > 1:433232/1‑150 (MQ=255) ccGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGt > 2:1305250/1‑150 (MQ=255) ccGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGt < 1:1305250/150‑1 (MQ=255) ccGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGt > 2:242531/1‑150 (MQ=255) gCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCa < 2:1285832/150‑1 (MQ=255) gCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGAAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCa < 1:1578175/150‑1 (MQ=255) cAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAg < 2:919045/150‑1 (MQ=255) aTGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCa < 2:433232/150‑1 (MQ=255) aGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGGTCAGCAtgt < 2:750414/150‑1 (MQ=255) gTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCAtgtg < 2:1829540/150‑1 (MQ=255) tCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCg < 2:1258457/150‑1 (MQ=255) gAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGc < 1:1073373/150‑1 (MQ=255) aGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGTCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGt < 1:666077/150‑1 (MQ=255) aGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCa < 1:446481/138‑1 (MQ=255) aGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCa > 2:446481/1‑138 (MQ=255) gCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGNTAGGGCAGCGGGGCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTc > 1:843586/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCTTTCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCa < 1:2547918/150‑1 (MQ=255) cAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGt < 1:790523/146‑1 (MQ=255) 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tGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTcc < 2:874731/136‑1 (MQ=255) tGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACAtt > 1:1961454/1‑150 (MQ=255) gcccaggcccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTgg < 2:2610018/114‑1 (MQ=255) gcccaggcccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTgg > 1:2610018/1‑114 (MQ=255) gcccaggcccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGc < 2:2976135/121‑1 (MQ=255) gcccaggcccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGc > 1:2976135/1‑121 (MQ=255) ccaggcccaTGGCatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgcccta > 1:1386100‑M1/1‑13 (MQ=255) ccaggcccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTCCTTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTAGGCATGGTCCTGCAGGTCCAACGGTCCTGGCATTGGCTCGTGAGCGCTCCATCACCCCCACCTTCgaa < 2:843586/150‑1 (MQ=255) caggcccaTGGCatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgccctac < 1:1871596‑M1/150‑139 (MQ=255) ccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgccctac < 2:2571911‑M2/145‑82 (MQ=255) ccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgccctac > 1:2571911‑M2/1‑64 (MQ=255) ccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCtt > 1:1119752/1‑150 (MQ=255) ccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCtt < 1:1760485/150‑1 (MQ=255) ccaTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCtt > 1:1959426/1‑150 (MQ=255) caTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGcc > 1:1459814/1‑60 (MQ=255) caTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGcc < 2:1459814/60‑1 (MQ=255) caTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgccctacctcacc < 1:768396‑M2/150‑88 (MQ=255) aTGGCatcggcatgtgcgtggtgaccaacgcaccgcggctgaacgccgagcacatgctgaacgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggccgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgccctacctcaccg > 2:1589746‑M1/1‑5 (MQ=255) aTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTAc < 1:300463/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTAc < 2:2824309/150‑1 (MQ=255) ggCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCt < 2:1437247/150‑1 (MQ=255) cGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATgccatgggcctgggccagcactttgaacatgtgctggtggtcgaagagctggcacggcccaaaccggacccgctgccctacctcaccggcct > 2:1867428‑M2/1‑58 (MQ=255) cGTTCAGCACGTGCCCGTCTTTGAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCGCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGa < 2:560651/150‑1 (MQ=38) | CCCCGGCAATGAGTCCTCGAAGGCCAGCGCTTGCCCGGCCTCGACACCCAGCCGCTGCAGGCCGGTGAGGTAGGGCAGCGGGTCCGGTTTGGGCCGTGCCAGCTCTTCGGCCACCAGCACATGTTCAAAGTGCTGGCCCAGGCCCATGGCGTTCAGCATGTGCTCGGCGTTCAGCCGCGGTGCGTTGGTCACCACGCACATGCCGATGCCATGGGCCTGGGCATGCTCCAGCAGGCGCAACAGGCCTGGCATTGGCTCGTAAGCGCTCCATGAACCCCACATTCAAAGCGCTTACCTGA > NC_002947/3522610‑3522908 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |