New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | = 5385891 | 96 (0.870) | coding (574/1146 nt) | lldD | L‑lactate dehydrogenase |
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
ATGCGCAATGCCCTGGAGCGCGCCAAGGCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGATGGGCCGCCCGCATGACTTGGGCAACATCTCCAAATACCGTGGCAACCCCACCGGCCTTGCCGACTACATCGGCTGGCTGGGCAACAACTTCGACCCGTCCATTTCCTGGAAAG > NC_002947/5385726‑5386023 | tGCGCAATGCCCTGGAGCGCGCCAAGGCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGa < 1:1630416/150‑1 (MQ=255) tGCGCAATGCCCTGGAGCGCGCCAAGGCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGa > 2:802906/1‑150 (MQ=255) cgcAATGCCCTGGAGCGCGCCAAGGCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGacc < 1:9795/150‑1 (MQ=255) gcAATGCCCTGGAGCGCGCCAAGGCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGaccc > 1:1204103/1‑150 (MQ=255) gatccactccaggtctttccaggaaatggacgggtcgaagttgttgcccagccagccgatgtagtcggcaaggccggtggggttgccacggtatttggagatgttgcccaagtcatgcgggcggcccatcacgcccacatcCCATg < 1:2063398‑M1/5‑1 (MQ=255) gatccactccaggtctttccaggaaatggacgggtcgaagttgttgcccagccagccgatgtagtcggcaaggccggtggggttgccacggtatttggagatgttgcccaagtcatgcgggcggcccatcacgcccacatcCCATg > 2:2063398‑M1/142‑146 (MQ=255) cTGGAGCGCGCCAAGGCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAg > 1:772898/1‑150 (MQ=255) tGGAGCGCGCGAAGGCCGTCGGAGTCAAGGTCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGACAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAGt < 2:1012097/150‑1 (MQ=255) gAGCGCGCCAAGGCCGCCGCCGTCAAGACCCTGCTGTTCACCGTGGACATTCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAGTgg < 2:1383988/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCAAGGCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAGTGGGc < 2:1029244‑M2/150‑2 (MQ=255) gcgcCAAGGCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAGTGGGcat < 1:1106730‑M2/150‑4 (MQ=255) cgcCAAGGCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAGTGGGcatg > 2:817601‑M2/1‑146 (MQ=255) gcCAAGGCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAGTGGGcatgg < 2:527623‑M2/150‑6 (MQ=255) aGGCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGAtg < 1:527623/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGAtgt < 1:794359/150‑1 (MQ=255) cgccgGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTggg > 2:1700704/1‑150 (MQ=255) ggCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGa > 2:1093227/1‑118 (MQ=255) ggCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGa < 1:1093227/118‑1 (MQ=255) cGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGAt < 1:2273192/150‑1 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CCATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGATGGGCCGCCCGCATGACTTGGGCAACATCTCCAAATACCGTGGCAACCCCACCGGCCTTGCCGACTACATCGGCTGGCTGGGCAACAACTTCGACCCGTCCATTTCCTGGa < 2:2556968‑M1/150‑1 (MQ=255) cATGcccactcggggtgggtcatggcttgcagcacgcggcgcagcgggccgttcttgccgctcatgccagagtgggcgtcgcggtagcgggcaccgggtacgggcatgtccacggtgaacaccagggtcttgacgccggcggccttggcg > 2:817601‑M1/1‑4 (MQ=255) CATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGATGGGCCGCCCGCATGACTTGGGCAACATCTCCAAATACCGTGGCAACCCCACCGGCCTTGCCGACTACATCggctg < 1:2295428‑M1/114‑1 (MQ=255) CATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGATGGGCCGCCCGCATGACTTGGGCAACATCTCCAAATACCGTGGCAACCCCACCGGCCTTGCCGACTACATCGGCTGGCTGGGCAACAACTTCGACCCGTCCATTTCCTGGaa < 2:1931859‑M1/150‑1 (MQ=255) CATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGATGGGCCGCCCGCATGACTTGGGCAACATCTCCAAATACCGTGGCAACCCCACCGGCCTTGCCGACTACATCGGCTGGCTGGGCAACAACTTCGACCCGTCCATTTCCTGGaa > 1:2397483‑M1/1‑150 (MQ=255) CATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGATGGGCCGCCCGCATGACTTGGGCAACATCTCCAAATACCGTGGCAACCCCACCGGCCTTGCCGACTACATAggctg > 2:2295428‑M1/1‑114 (MQ=255) aTGcccactcggggtgggtcatggcttgcagcacgcggcgcagcgggccgttcttgccgctcatgccagagtgggcgtcgcggtagcgggcaccgggtacgggcatgtccacggtgaacaccagggtcttgacgccggcggccttggcgc > 2:788702‑M1/1‑3 (MQ=255) aTGcccactcggggtgggtcatggcttgcagcacgcggcgcagcgggccgttcttgccgctcatgccagagtgggcgtcgcggtagcgggcaccgggtacgggcatgtccacggtgaacaccagggtcttgacgccggcggccttggcgc < 1:1106730‑M1/150‑148 (MQ=255) aTGACCCACCCCGAGTGGGcatggcttgcagcacgcggcgcagcgggcc > 1:1434956‑M2/1‑19 (MQ=255) ATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGATGGGCCGCCCGCCTTACTTGGGCAACATCTCCAAATACCGTGGCAACCCCACCGGCCTTGCCGACTACATCGGCTGGCTGGGCAACAACTTCGACCCGTCCATTTCCTGGaaa > 1:1441710‑M1/1‑150 (MQ=255) ATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGATGGGCCGCCCGCATGACTTGGGCAACATCTCCAAATACCGTGGCAACCCCACCGGcc > 1:1050422‑M1/1‑94 (MQ=255) ATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGATGGGCCGCCCGCATGACTTGGGCAACATCTCCAAATACCGTGGCAACCCCACCGGCCTTGCCGACTACATCGGCTGGCTGGGCAACAACTTCGACCCGTCCATTTCCTGGaaa < 2:2994580‑M1/150‑1 (MQ=255) ATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGATGGGCCGCCCGCATGACTTGGGCAACATCTCCAAATACCGTGGCAACCCCACCGGCCTTGCCGACTACATCGGCTGGCTGGGCAACAACTTCGACCCGTCCATTTCCTGGaaa < 1:1916353‑M1/150‑1 (MQ=255) TGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGATGGGCCGCCCGCATGACTTGGGCAACATCTCCAAATACCGTGGCAACCCCACCGGCCTTGCCGACTACATCGGCTGGCTGGGCAACAACTTCGACCCGTCCATTTCCTGGAAAg < 2:277964‑M1/150‑1 (MQ=255) gcccactcggggtgggtcatggcttgcagcacgcggcgcagcgggccgttcttgccgctcatgccagagtgggcgtcgcggtagcgggcaccgggtacgggcatgtccacggtgaacaccagggtcttgacgccggcggccttggcgcgc < 2:1029244‑M1/150‑150 (MQ=255) | ATGCGCAATGCCCTGGAGCGCGCCAAGGCCGCCGGCGTCAAGACCCTGGTGTTCACCGTGGACATGCCCGTACCCGGTGCCCGCTACCGCGACGCCCACTCTGGCATGAGCGGCAAGAACGGCCCGCTGCGCCGCGTGCTGCAAGCCATGACCCACCCCGAGTGGG‑CATGGGATGTGGGCGTGATGGGCCGCCCGCATGACTTGGGCAACATCTCCAAATACCGTGGCAACCCCACCGGCCTTGCCGACTACATCGGCTGGCTGGGCAACAACTTCGACCCGTCCATTTCCTGGAAAG > NC_002947/5385726‑5386023 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |