New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 138 total aligned reads displayed.
GGGGGATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCC > NC_002947/5743244‑5743540 | gggggATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGcggtcg > 1:2142093/1‑150 (MQ=255) tggcacacaccgcaggagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccCGCTcc > 2:1620504‑M1/145‑150 (MQ=255) tggcacacaccgcaggagcggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcttcggaccgcaccattcgcgcatatgccacctagatctggaagggatgggaatgcggagaggccgttctcgggcacgccCCCTcc < 1:1308197‑M1/6‑1 (MQ=255) gcacacaccgcagtagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccCGCTCCca > 2:1911632‑M1/143‑150 (MQ=255) acacaccgcaggagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccCGCTCCcaca > 1:1104033‑M1/141‑150 (MQ=255) cacaccgcaggagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccCGCTCCCACAg < 1:775946‑M1/11‑1 (MQ=255) aaaaCCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAg < 1:956631/150‑1 (MQ=255) caccgcaggagtggtggcgcaaggcggtattgaacacggcacggatgggctggttctcgtcggaccgcaccattcgcgaatatgccaccgagatctggaaggcattggattgaggtgaggccgttcgcgggcacgccCGCTCCCACAGGt > 2:1903028‑M1/138‑150 (MQ=255) cccACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGACTCTCAGACGGCACAATAGGTCCGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGCTCTGGATGCGGGTTCAGGCGGGGGCGCGCTCGCCCCCACAGGTAc > 1:686294/1‑150 (MQ=255) aCGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAgc < 2:191988/150‑1 (MQ=255) cGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAgcg < 1:1676220/150‑1 (MQ=255) aGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCaa < 1:657359/150‑1 (MQ=255) gggAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTTTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGaa > 2:788480/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) gTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTg > 2:2226147/1‑150 (MQ=255) gTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTg > 2:1432876/1‑150 (MQ=255) gTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTg < 1:1488175/150‑1 (MQ=255) gTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTg < 2:1757508/150‑1 (MQ=255) cagtctgtCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAAGGCCTAACCTCAAGCCAATGCCTTCCAGGTCTCGTTGGCATTGTCGCGAATGGTGc > 1:2410746/6‑150 (MQ=37) tgtgtgTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCg < 1:2294155/150‑1 (MQ=255) tCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCtg‑tg > 1:497289/1‑66 (MQ=255) tCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCtg‑tg < 2:497289/66‑1 (MQ=255) ccgttcgcgggcacgccCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑Tgg > 1:858124‑M1/18‑66 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTgccaagatagggacacacaaccagaccaccggcctggcgaaggctgaactaccgacctattgtgccgtctgagagc < 1:2204837‑M2/150‑77 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTg < 1:1524530/121‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGGGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgacga > 2:1308197/1‑150 (MQ=255) gcgGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAAc < 1:2226147/150‑1 (MQ=255) gcgcgcTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCacc > 2:775946/1‑148 (MQ=255) gcgcgcTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGc > 2:1827988/1‑150 (MQ=255) gctcgctcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑Tgg > 1:2820117/1‑52 (MQ=255) gctcgctcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑Tgg < 2:2820117/52‑1 (MQ=255) gctcgctcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGcctcac < 2:1732422/80‑1 (MQ=255) gctcgctcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGcctcac > 1:1732422/1‑80 (MQ=255) gctcgctcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCAt > 1:986262/1‑150 (MQ=255) tcgctcCCACAGGTACAGCGCACGCGTTGAAGCTTTCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATcc < 2:2688795/150‑1 (MQ=255) tcgctcCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATGCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATcc > 1:1697161/1‑150 (MQ=255) cCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCaa < 1:1883249‑M1/87‑1 (MQ=255) cCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCaa > 2:1883249‑M1/2‑88 (MQ=255) | GGGGGATGAAAAACCCACGCAGTTTACAGGGAGAGTGACGGGCTAGCGAGTGATGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCC > NC_002947/5743244‑5743540 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |