New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
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acaATGGGTGGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCaa > 2:2294155/1‑150 (MQ=255) acaATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCgg > 2:527973/1‑123 (MQ=255) ggTCGGTAGTTCCGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGGGTGCGCGCGCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAAt < 1:2970957/150‑1 (MQ=255) gTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATg > 1:2555066/1‑150 (MQ=255) cAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAATCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGAt < 2:2142093/150‑1 (MQ=255) 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tctcgcaagcttcaaggcttgcgctgtacctgtgggagcgAGCGCGCCCGCGAATGGACACACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATa < 1:1101647‑M2/110‑1 (MQ=255) gcgcAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATAcc > 1:2502632/1‑150 (MQ=255) cgcAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTgcccgcaaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaagactgaactaccgacctattgtgccgtctgagagccgtggcgagtctcatcacccgctagcccgtca > 2:2204837‑M2/1‑42 (MQ=255) aaGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCTGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCt > 2:2819860/1‑150 (MQ=255) aaGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGAACAACGATATCTTGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCt > 2:245467/1‑150 (MQ=255) cTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTgcg > 1:1060056/1‑150 (MQ=255) cTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTgcg > 2:46943/1‑150 (MQ=255) cTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTgcc > 2:1408003/1‑149 (MQ=255) ttGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgac < 2:2438019/108‑1 (MQ=255) gAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGcca > 1:537205/1‑150 (MQ=255) aaGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGccac < 1:1527275/150‑1 (MQ=255) gCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCcgac > 2:2279430/1‑103 (MQ=255) gagaCA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTg < 2:32529/150‑1 (MQ=255) gaCA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCg < 1:1574421/150‑1 (MQ=255) tgtacctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATccgtgccgt > 2:2623062‑M2/17‑118 (MQ=255) acctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGgtg > 2:1903028‑M2/14‑150 (MQ=255) ctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGgtgtg > 2:2977647‑M2/12‑150 (MQ=255) ctgtgggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGgtgtg < 1:775946‑M2/139‑1 (MQ=255) gggAGCGGGCGTgcccgcgaatggacacacaaccagaccaccggcctggcgaaggctgaactaccgacctattgtgccgtctgagagccgtggcgagtctcatcactcgctagcccgtcactctccctgtaaactgcgtgggtttttcat > 1:446706‑M2/1‑12 (MQ=255) ggagcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGGTGTGTGCca > 2:1620504‑M2/7‑150 (MQ=255) agcgGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGGTGTGTGCcaca < 2:537205‑M2/146‑1 (MQ=255) ggCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGGTGTGTGCCACAGATc < 2:1104033/150‑1 (MQ=255) | TGAGACTCGCCACGGCTCTCAGACGGCACAATAGGTCGGTAGTTCAGCCTTCGCCAGGCCGGTGGTCTGGTTGTGTGTCCATTCGCGGGCGCGCTCGCTCCCACAGGTACAGCGCAAGCCTTGAAGCTTGCGAGACA‑CCTG‑TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAACGGCCTCACCTCAATCCAATGCCTTCCAGATCTCGGTGGCATATTCGCGAATGGTGCGGTCCGACGAGAACCAGCCCATCCGTGCCGTGTTCAATACCGCCTTGCGCCACCACTCCTGCGGTGTGTGCCACAGATC > NC_002947/5743297‑5743595 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |