New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | 6076376 = | 113 (0.990) | 6 (0.060) | 6/228 | NT | 5.9% | coding (242/2289 nt) | PP_5328 | phosphate ABC transporter permease |
? | NC_002947 | 6076413 = | 86 (0.800) | coding (205/2289 nt) | PP_5328 | phosphate ABC transporter permease |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CGGGTAGTTCGACACGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCGGTCCTTGAGGGCGCGC > NC_002947/6076227‑6076525 | tttcaatacgcccgagttgcaacgcaagcgccgcatgcgcgccctcaaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtt < 2:1802862‑M1/1‑1 (MQ=255) gggTAGTTCGACACGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTc > 2:2875751/1‑150 (MQ=255) caatacgcccgagttgcaacgcaagcgccgcatgcgcgccctcaaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcgtcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtTCCa > 1:2394730‑M1/147‑150 (MQ=255) atacgcccgagttgcaacgcaagcgccgcatgcgcgccctcaaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtTCCAgg > 2:2223184‑M1/145‑150 (MQ=255) ttCGACACGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTTCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAggtg > 2:171631/1‑148 (MQ=255) gACACGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCttt > 2:819124/1‑150 (MQ=255) acacGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGTGATCATCAGTGGCTTCCCGTCACCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTc < 1:2680700/150‑1 (MQ=255) acacGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAgg < 2:1243785/144‑1 (MQ=255) acacGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAgg > 1:1243785/1‑144 (MQ=255) gCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGc > 2:2818915/1‑150 (MQ=255) cTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCt < 1:1486563/150‑1 (MQ=255) ttGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTg < 1:2818915/150‑1 (MQ=255) ttGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTg > 2:2747017/1‑150 (MQ=255) 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ttGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTgg < 1:2747017/150‑1 (MQ=255) tATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACa > 2:599038/1‑150 (MQ=255) tCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGt < 1:2915861/150‑1 (MQ=255) tCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGt < 1:2070287/150‑1 (MQ=255) tCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGt < 2:878730/150‑1 (MQ=255) tCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGt > 2:1599134/1‑150 (MQ=255) gaagaaCAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTgg < 1:2551017/150‑1 (MQ=255) aagaaCAATGCCTGGCCCTTGTCCGAANCACGCATCCCCANCTGATTNTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCGAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGgc > 1:2481515/1‑150 (MQ=255) aagaaCAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGc < 2:2837759/129‑1 (MQ=255) aagaaCAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGc > 1:2837759/1‑129 (MQ=255) agaaCAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGgca < 1:1599134/150‑1 (MQ=255) aaggaccgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACa > 2:2824898‑M1/104‑143 (MQ=255) aaCAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGgcagc < 2:240832/150‑1 (MQ=255) cAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGcac < 2:1715530/150‑1 (MQ=255) aaTTCCTTGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGcacc > 1:2745912/1‑150 (MQ=255) cgcctgacccgctggtatgtgctggtaggcgggcttgccgtattggcggcaatcacgttgatcttcttctacctggcttatgtggtgctgccactgtTc > 2:1446312‑M1/98‑99 (MQ=255) 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tGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGcac > 2:228138/1‑150 (MQ=255) ggCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGcaca < 1:1482747/150‑1 (MQ=255) ttCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATAc > 1:2374726/1‑150 (MQ=255) ttCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATAc < 1:1588348/150‑1 (MQ=255) cctgCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGa < 1:994111/106‑1 (MQ=255) ccGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCTGGCCAGCACATGCCAg < 2:2745912/150‑1 (MQ=255) ctgctgCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCTCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAg > 1:673694/1‑150 (MQ=255) ctgctgCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAg > 1:1315523/1‑150 (MQ=255) gcAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCGGt < 1:1363509/150‑1 (MQ=255) cAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCg < 2:1831722/147‑1 (MQ=255) aGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCGGTcc > 2:2912415/1‑150 (MQ=255) gCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCTCTGGCAGAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGAGCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCGGTCCt > 2:2733724/1‑150 (MQ=255) gCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTagaaga < 2:842998/81‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTagaaga > 1:842998/1‑81 (MQ=255) ccAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCGGTCCtt > 1:2126383/1‑150 (MQ=255) gTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCCGATACCAGGGGGTTAGGCGCTCCTTGAgg < 2:1655322/150‑1 (MQ=255) gTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCGGTCCTTGAgg < 1:1930381/150‑1 (MQ=255) ggCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCgg < 1:1449001/129‑1 (MQ=255) | CGGGTAGTTCGACACGCTTGAGTTCGTTACCGGTCTTGGTATCGAAGAACAATGCCTGGCCCTTGTCCGAAACACGCATCCCCACCTGATTCTGCTCTTCAAGCGCGATCATCAGTGGCTTCCCGGCATCCTGCTGCAGCCAGGTCGGCTCCAGGGCTTTCTTGCTGGTCAGCTCGGCGCCCTGGAACAGTGGCAGCACCACATAAGCCAGGTAGAAGAAGATCAACGTGATTGCCGCCAATACGGCAAGCCCGCCTACCAGCACATACCAGCGGGTCAGGCGGTCCTTGAGGGCGCGC > NC_002947/6076227‑6076525 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |