New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6177257 | 80 (0.700) | 4 (0.040) | 4/228 | NT | 4.8% | coding (284/861 nt) | atpG | ATP synthase subunit gamma |
? | NC_002947 | = 6177263 | 83 (0.780) | coding (278/861 nt) | atpG | ATP synthase subunit gamma | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
ATGGCTCTTCGCCCAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGGTTGGCGTTGGCCAGATGACCGATCACCTGGCGGATACGTTCCGCG > NC_002947/6177108‑6177406 | aTGGCTCTTCGCCCAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACA < 2:2159310‑M1/150‑1 (MQ=255) gCTCTTCGCCCAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGt > 1:1658428/1‑150 (MQ=255) gCTCTTCGCCCAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGt < 1:1487039/150‑1 (MQ=255) tctTCGCCCAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACA < 1:1938555‑M1/145‑1 (MQ=255) ctTCGCCCAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTgg < 1:2368045/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGt > 2:1842174‑M2/1‑149 (MQ=255) cccAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGtgttc < 1:1717284‑M2/150‑6 (MQ=255) ccAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGtgttca < 2:804757‑M2/150‑7 (MQ=255) cAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGTAGAAAGCCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTTACCCGGGCCTTGAACAGGTTGGtgttcaa > 1:2829475‑M2/1‑143 (MQ=255) cAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGtgttcaa > 1:2261843‑M2/1‑143 (MQ=255) cAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGtgttcaa > 2:599288‑M2/1‑143 (MQ=255) cAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGtgttcaa > 2:1658428‑M2/1‑143 (MQ=255) cAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATCTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGtgttcaa > 1:1743359‑M2/1‑143 (MQ=255) aTCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGcac < 1:1646669/150‑1 (MQ=255) tACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACg > 2:547226/1‑150 (MQ=255) cgacgTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGt < 1:918308/150‑1 (MQ=255) cgTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCAc < 1:1259093/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACt < 1:1085741/150‑1 (MQ=255) ccgccAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTc < 1:2022929/150‑1 (MQ=255) aaaGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTcaccac > 2:128119/1‑150 (MQ=255) aaaGATGCGGAAGAAAGTCGCACAATTGCTGCCGATGACCCTGAAAACGGTTTGCAGTCTTTTTGCCCCAGTAGCACTCAGTGCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTcaccac > 2:1885839/1‑150 (MQ=255) ggAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGtgttc > 1:177647‑M2/1‑102 (MQ=255) gaagaaAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAAcc < 1:547226/150‑1 (MQ=255) tCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCt > 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(MQ=255) acaGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGATCAGGTTGGtgttcaa < 1:153485‑M2/76‑8 (MQ=255) acaGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGATCAGGTTGGtgttcaa > 2:153485‑M2/1‑69 (MQ=255) aGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGtt > 1:203771/1‑65 (MQ=255) aGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAAGGCGGTCGAGCATGAACggg > 2:2382263/1‑150 (MQ=255) gTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAccaacctgttcaaggc > 1:2927165‑M1/1‑59 (MQ=255) gTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAccaacctgttcaaggc < 2:2927165‑M1/75‑17 (MQ=255) gTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACg > 2:1242870/1‑106 (MQ=255) gTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTg > 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ttCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCACTGAACCGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGgttggc > 1:2546576/1‑150 (MQ=255) gcgGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGgttggcgtt > 2:2586956/1‑150 (MQ=255) gcgGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGgttggcgtt > 1:1258857/1‑150 (MQ=255) gcgGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAAAGGGTGGCGGTATTCCGGgttggcgtt > 1:1250848/1‑150 (MQ=255) cgGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGgttggcgttg < 1:552058/150‑1 (MQ=255) cgcTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGgttggcgtt < 2:2987413/142‑1 (MQ=255) cgcTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGgttggcgtt > 1:2987413/1‑142 (MQ=255) cgcTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGGTTGGCGTTGGCCAGAt > 2:638572/1‑150 (MQ=255) gcTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGt < 2:378241/62‑1 (MQ=255) gcTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGt > 1:378241/1‑62 (MQ=255) gcTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGgtt > 2:482321/1‑135 (MQ=255) gcTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGgtt < 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ggCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGGTTGGCGTTGGCCAGATGACCGATCACCTGGCGGAt > 1:1827050/1‑150 (MQ=255) gCCTTGAACAGGTTGGtgttcaaggccctggtcaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggaaatcgac > 1:2927165‑M2/1‑16 (MQ=255) gCCTTGAACAGGTTGGtgttcaaggccctggtcaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggaaatcgac < 2:2927165‑M2/75‑60 (MQ=255) cTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGgttggcgttggc < 1:559720/123‑1 (MQ=255) cTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGgttggcgttggc > 2:559720/1‑123 (MQ=255) ttGAACAccaacctgttcaaggccctggtcaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggagatcgacctgtgcgtgatcggcagcaagggtgcgactttcttccgcatctttggcggcaacgtcgtagcagcgatcagccacttg > 1:1743359‑M1/1‑7 (MQ=255) ttGAACAccaacctgttcaaggccctggtcaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggaaatcgacctgtgcgtgatcggcagcaagggtgcgactttcttccgcatctttggcggcaacgtcgtagcagcgatcagccacttg > 1:2261843‑M1/1‑7 (MQ=255) ttGAACAccaacctgttcaaggccctggtcaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggaaatcgacctgtgcgtgatcggcagcaagggtgcgactttcttccgcatctttggcggcaacgtcgtagcagcgatcagccacttg > 2:599288‑M1/1‑7 (MQ=255) ttGAACAccaacctgttcaaggccctggtcaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggaaatcgacctgtgcgtgatcggcagcaagggtgcgactttcttccgcatctttggcggcaacgtcgtagcagcgatcagccacttg > 2:1658428‑M1/1‑7 (MQ=255) ttGAACAccaacctgttcaaggcccgggtaaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggaaatcgacctgtgcgtgatcggcagcaagggtgcggctttctaccgcatctttggcggcaacgtcgtagcagcgatcagccacttg > 1:2829475‑M1/1‑7 (MQ=255) ttGAACAccaacctgatcaaggccctggtcaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggaaatcgacctgt < 1:153485‑M1/76‑70 (MQ=255) tGAACAccaacctgttcaaggccctggtcaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggaaatcgacctgtgcgtgatcggcagcaagggtgcgactttcttccgcatctttggcggcaacgtcgtagcagcgatcagccacttgg < 2:804757‑M1/150‑145 (MQ=255) gAACAccaacctgttcaaggccctggtcaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggaaatcgacctgtgcgtgatcggcagcaagggtgcgactttcttccgcatctttggcggcaacgtcgtagcagcgatcagccacttggg < 1:1717284‑M1/150‑146 (MQ=255) gAACAccaacctgttcaaggccctggtcaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggaaatcgacctgtgcgtgatcggcagcaagggtgcgactttcttcc < 2:177647‑M1/107‑103 (MQ=255) gAACAccaacctgttcaaggccctggtcaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggaaatcgacctgtgcgtgatcggcagcaagggtgcgactttcttcc > 1:177647‑M1/1‑5 (MQ=255) gAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGGTTGGCGTTGGCCAGATGACCGATCACCTGGCGGATACGTTc > 2:145310/1‑150 (MQ=255) aCAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGGTTGGCGTTGGCCAGATGACCGATCACCTGGCGGATACGTTCcg > 2:1729454/1‑150 (MQ=255) aCAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGGTTGGCGTTGGCCAGATGACCGATCACCTGGCGGATACGTTCcg > 2:196769/1‑150 (MQ=255) accaacctgttcaaggccctggtcaaggacatgagcgcaaaccgcgaacagggcgtggaaatcgacctgtgcgtgatcggcagcaagggtgcgactttcttccgcatctttggcggcaacgtcgtagcagcgatcagccacttgggcgaa > 2:1842174‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATGGCTCTTCGCCCAAGTGGCTGATCGCTGCTACGACGTTGCCGCCAAAGATGCGGAAGAAAGTCGCACCCTTGCTGCCGATCACGCACAGGTCGATTTCCACGCCCTGTTCGCGGTTTGCGCTCATGTCCTTGACCAGGGCCTTGAACAGGTTGGTGTTCAAGCCACCGCACAGACCACGGTCACTGCTCACCACGATATAACCAGCGCGCTTTACAGGGCGCTCGATCATGAACGGGTGGCGGTATTCCGGGTTGGCGTTGGCCAGATGACCGATCACCTGGCGGATACGTTCCGCG > NC_002947/6177108‑6177406 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |