New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 614281 = | 28 (0.240) | 8 (0.090) | 6/200 | NT | 21.9% | intergenic (‑97/+81) | dxs/ispA | 1‑deoxyxylulose‑5‑phosphate synthase/farnesyl diphosphate synthase |
? | NC_002947 | = 4675357 | 34 (0.360) | intergenic (+10/+94) | PP_4137/chrR | outer membrane siderophore receptor/chromate reductase |
ACCTGCGCAACCTGACCAACCAGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCT > NC_002947/4675211‑4675503 | cggcgagcttgttcgaggattcgggcaagctcaatgacaagacgcgaccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgtgtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcttgctgtgtaacgcccctgtgtaggaGCgg > 2:826103‑M1/147‑150 (MQ=255) aCCTGCGCAACCTGACCAACCAGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgg > 2:2939657‑M2/1‑147 (MQ=255) aCCTGCGCAACCTGACCAACCAGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgg > 2:1507558‑M2/1‑147 (MQ=255) aCCTGCGCAACCTGACCAACCAGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGCCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgg > 1:675613‑M2/1‑147 (MQ=255) ccTGCGCAACCTGACCAACCAGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGACCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcggg > 1:177687‑M2/1‑146 (MQ=255) cTGCGCAACCTGACCAACCAGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggt < 1:1323764‑M2/150‑6 (MQ=255) tGCGCAACCTGACCAACCAGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCACTGACCGGGGGGCGcgggtt > 2:3052759‑M2/1‑144 (MQ=255) gtctccacctgacTATCCAGCGGTATGCAACGACCCTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGCCACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtt > 2:1296812‑M2/7‑144 (MQ=255) cgggcttgttcgaggattcgggcaagctgaatgacaagacgcgaccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGtt > 2:23848‑M1/144‑150 (MQ=255) gcAACCTGACCAACCAGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttac < 1:1426438‑M2/150‑10 (MQ=255) gcAACCTGACCAACCAGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttac > 2:1443832‑M2/1‑141 (MQ=255) ccTGACCAACCAGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacccgc > 1:150091‑M2/1‑137 (MQ=255) cTGACCAACCAGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacccgcg < 1:2510218‑M2/150‑15 (MQ=255) ggccaaccagcGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacccgcgaa > 2:646522‑M2/3‑134 (MQ=255) cgaggattcgggcaagctcaatgacaagacgcgaccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGaa > 2:817127‑M1/134‑150 (MQ=255) tccaaccagCGCTGTCCAGCAACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacccgcgaat > 2:1426438‑M2/2‑133 (MQ=255) gaggattcgggcaagctcaatgacaagacgcgcccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACACGCGAAt < 1:1053321‑M1/18‑1 (MQ=255) ggattcgggcaagctcaatgacaagacgcgaccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAAt < 1:362594‑M1/18‑1 (MQ=255) ggattcgggcaagctcaatgacaagacgcgaccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAAt > 2:362594‑M1/131‑148 (MQ=255) caaccaGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacccgcgaatgc > 1:2540094‑M2/1‑131 (MQ=255) gattcgggcaagctcaatgacaagacgcgaccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCg < 1:617971‑M1/21‑1 (MQ=255) ttcgggcaagctcaatgacaagacgcgaccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTc < 1:739618‑M1/23‑1 (MQ=255) caGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCa > 1:2615894/1‑150 (MQ=255) gcgcTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCAtt < 1:2688397/150‑1 (MQ=255) gcTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGa < 2:2568435/150‑1 (MQ=255) gcTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGa < 2:376783/150‑1 (MQ=255) cTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCAGTTTTACGCCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGaa < 1:1571858/150‑1 (MQ=255) tATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacccgcgaatg < 1:1867286‑M2/139‑19 (MQ=255) tATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacccgcgaatg > 2:1867286‑M2/1‑121 (MQ=255) gCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATCTg < 1:253126/150‑1 (MQ=255) tcaatgacaagacgcgaccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGc < 2:1774879‑M1/34‑1 (MQ=255) cAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGTGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGc < 2:1698859/150‑1 (MQ=255) tgacaagacgcgaccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCg > 2:112177‑M1/113‑133 (MQ=255) tgacaagacgcgaccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCg < 1:112177‑M1/21‑1 (MQ=255) aCCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGAc > 1:1524662/1‑149 (MQ=255) aCCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGAc < 2:1524662/149‑1 (MQ=255) acaagacgcgaccgttctttcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGt < 2:848803‑M1/22‑1 (MQ=255) acaagacgcgaccgttctttcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcacctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGt > 1:848803‑M1/111‑132 (MQ=255) cGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCTAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacccgcgaatgcgtcggcaaattcaatgacgca > 1:1216954‑M2/1‑110 (MQ=255) agacgcgaccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCAtt > 1:1774879‑M1/108‑150 (MQ=255) gacgccaccgttcttgcaggcgtttgtcgacaggtttgcgtcatgggtgaagttgaacagggcggtctgaacccctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTc > 1:195509‑M1/107‑150 (MQ=255) cGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTcgc < 2:2615894/150‑1 (MQ=255) ccGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacccgcgaatgcgtcggcaaattcaatgacgcattcgcgg > 2:1147372‑M2/1‑103 (MQ=255) ccGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAGTTTGCCGACGCATTCGCgg < 1:832512/150‑1 (MQ=255) 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tACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAAc < 1:1831178/150‑1 (MQ=255) aCAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTTGGGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGTTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAAcc > 1:857953/1‑150 (MQ=255) aaCGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTATAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacccgcgaatgcgtcggcaaattcaatgacgcattcgc < 1:2416850‑M2/139‑46 (MQ=255) aaCGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTATAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacccgcgaatgcgtcggcaaattcaatgacgcattcgc > 2:2416850‑M2/1‑94 (MQ=255) aaCGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacc > 2:2872960‑M2/1‑94 (MQ=255) aaCGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGcgggtttacc < 1:2872960‑M2/104‑11 (MQ=255) cgCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 1:1943531/150‑1 (MQ=255) ccGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTcgc < 1:1386041/132‑1 (MQ=255) ccGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTcgc > 2:1386041/1‑132 (MQ=255) cAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGcc > 1:1576247/1‑116 (MQ=255) cAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGcc < 2:1576247/116‑1 (MQ=255) cAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAgg > 1:1837263/1‑150 (MQ=255) 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ccGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACtt > 2:1000410/1‑150 (MQ=255) ggggTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCa > 2:1479079/1‑150 (MQ=255) cctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTc > 1:1607216‑M1/34‑77 (MQ=255) cctaatcctgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTc < 2:1607216‑M1/44‑1 (MQ=255) tgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCAtt > 2:2427654‑M1/26‑68 (MQ=255) tgctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCAtt < 1:2427654‑M1/43‑1 (MQ=255) gctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTcgc > 2:2305061‑M1/25‑70 (MQ=255) gctgtgcaacgcccctgtgtaggaGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTcgc < 1:2305061‑M1/46‑1 (MQ=255) gCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCTCCCATGACGCAAACCTGTc < 2:1323764/150‑1 (MQ=255) gCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTc < 2:1513970/150‑1 (MQ=255) ggTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAAc < 2:2974029/150‑1 (MQ=255) ttcgcgGGTAAACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGtt < 1:1061954/110‑1 (MQ=255) ttcgcgGGTAAACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGtt > 2:1061954/3‑112 (MQ=255) ttcgcgGGTAAACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCt > 2:617971/3‑150 (MQ=255) cgcgGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCggg > 2:471911/1‑50 (MQ=255) cgcgGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCggg < 1:471911/50‑1 (MQ=255) | ACCTGCGCAACCTGACCAACCAGCGCTATGCAGCGACCGTGACGCCGGCCTACAACGACGCCGGCCAGGACAATGCCCGTTCGACACCGGGCGAAGGATTTGGCGTGTATGCCGGGGTTTCCTACAGCTTCCGCTGACGGGTGGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGCGTCATTGAATTTGCCGACGCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACAGGGGCGTTGCACAGCAGGATTAGGGGTTCAGACCGCCCTGTTCAACTTCACCCATGACGCAAACCTGTCGACAAACGCCT > NC_002947/4675211‑4675503 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |