| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 1436044 | 114 (1.000) | 10 (0.090) | 8/228 | NT | 8.3% | intergenic (‑74/+79) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase |
| ? | NC_002947 | = 1436081 | 114 (1.070) | intergenic (‑111/+42) | PP_1256/PP_1257 | alpha‑ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase/1‑pyrroline‑4‑hydroxy‑2‑carboxylate deaminase | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGTCGGTCAGGACGTCGGTCTCGTT > NC_002947/1435937‑1436230 | agaggccgATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGAttcgc > 2:723632‑M2/4‑145 (MQ=255) ctGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGAttcgcg > 2:2550799‑M2/1‑144 (MQ=255) aacagcagtacgcgctgttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctctccctgtgggagcgggcgtgCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCgg < 2:802651‑M1/52‑1 (MQ=255) aacagcagtacgcgctgttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctctccctgagggagcgggcgtgCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCgg > 2:2206681‑M1/99‑150 (MQ=255) gCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGc > 1:298568/1‑150 (MQ=255) gATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACg > 2:874569/1‑150 (MQ=255) gtacgcgctgttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctctccctgtgggagcgggcgttCCCTCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCgg > 2:3050233‑M1/92‑143 (MQ=255) gtacgcgctgttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctctccctgtgggagcgggcgtgCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCgg < 1:3050233‑M1/52‑1 (MQ=255) cgcgctgttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctctccctgtaggagcgggttcaCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGc > 2:2935805‑M1/89‑150 (MQ=255) ggTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGAGAACACCGGACAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGTCTGATTTTCGGCCACTCCTGCTcc < 2:2807242/150‑1 (MQ=38) gTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTccc > 1:185707/1‑150 (MQ=255) ctgttccacagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctctccctgtaggagcgggttcaCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTccc > 2:2585889‑M1/85‑150 (MQ=255) ttccgcagctggtatgccagctggtcggccgagcaaaacatcgcctgagcagccactgctccccctgtaggagcgggttcaCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaca > 2:1991893‑M1/82‑150 (MQ=255) cggtgAGGGGCATGTAGCCGCCTTTGAAATGTATAGCAGATGCATGGGGGTGATTACTACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGACGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg < 2:576092/148‑1 (MQ=25) cTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 2:702970/1‑150 (MQ=255) tgAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgag > 2:1235771/1‑150 (MQ=255) gAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaga < 1:1853920/150‑1 (MQ=255) gAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGgaga < 2:2781701/150‑1 (MQ=255) 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aCCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATGCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTActgctg > 1:1478670/1‑150 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGc < 1:1069834‑M1/129‑1 (MQ=255) CCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGATgta < 2:647155‑M1/150‑2 (MQ=255) CGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTc > 1:2814253‑M1/1‑150 (MQ=255) cacCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAgg > 2:141153/1‑63 (MQ=255) cGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGc < 2:1835700/104‑1 (MQ=255) cGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGagag > 2:439231/1‑56 (MQ=255) cGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGagag < 1:439231/56‑1 (MQ=255) ggTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACa < 1:1038909/115‑1 (MQ=255) ggTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACa > 2:1038909/1‑115 (MQ=255) gTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGt < 2:130902/150‑1 (MQ=255) gTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGACCGCTCCCCCAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGCCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAAAGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGt > 2:945071/1‑150 (MQ=255) gTGCCATGCACCGGGTCGCCGGTgttcgcgggtgaacccgctcctacaggggtcgtaa < 1:2350616‑M2/58‑36 (MQ=255) tGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGTc < 2:1478670/150‑1 (MQ=255) ccATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCGCGCTCCCAGAGGTAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGTCgg > 2:520591/1‑150 (MQ=255) aTGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGc < 1:2292139/103‑1 (MQ=255) aTGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGTCGGTc > 1:503722/1‑150 (MQ=255) aTGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGTCGGTc > 1:1477018/1‑150 (MQ=255) aTGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGAGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCGGCTGCGGAACAGCGCGAACTGCTTTTCGGCATAGTTGCACTGGGCGGCGGTc > 2:385222/1‑150 (MQ=255) tGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGTCGGTCa < 1:1709667/150‑1 (MQ=255) gCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATATCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGTCGGTCAg < 2:1991155/150‑1 (MQ=255) gCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGTCGGTCAg < 1:1123235/150‑1 (MQ=255) gggTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGTCGGTCAGGACGt > 1:336052/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGTCGGTAGGGACGTCgg > 1:2161851/1‑150 (MQ=255) ccTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGc > 2:1074922/1‑90 (MQ=255) aTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGGGAGTATTTGTGTTCGGAATAGTTGCGCTGATCGTCGGTCAGGACGTCGGTCTCGtt < 1:385222/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGTCGGTCAGGACGTCGGTCTCGtt > 1:2121100/1‑150 (MQ=255) | TCTGGCCGATCAGCAGGTTGCCTGTGAGGGGCATGTAGCCTCCTTGGAAATCTAATGCAGATGCATGGGGGGGATTACGACCCCTGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAACACCGGCGAAGCCGGTGCCATGCACCGGGTCGCCTGATTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGGAGAGCAGTGGCTGCTCAGGCGATGTTTTGCTCGGCCGACCAGCTGGCATACCAGCTGCGGAACAGCGCGTACTGCTGTTCGGCATAGTTGCGCTGAGCGTCGGTCAGGACGTCGGTCTCGTT > NC_002947/1435937‑1436230 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |