New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1581603 = | 125 (1.090) | 7 (0.060) | 6/234 | NT | 5.7% | coding (994/1155 nt) | ttgA | efflux pump periplasmic linker TtgA |
? | NC_002947 | 1581631 = | 110 (1.000) | coding (966/1155 nt) | ttgA | efflux pump periplasmic linker TtgA |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
AGGACCGGCCGGCTTCTTGACGTTGGTGGCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGCCTTGAGCCGCGCATGCACGAACATGCCT > NC_002947/1581484‑1581778 | aGGACCGGCCGGCTTCTTGACGTTGGTGGCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCtt < 1:1969553/150‑1 (MQ=255) aGGACCGGCCGGCTTCTTGACGTTGGTGGCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCtt > 1:346270/1‑150 (MQ=255) gACCGGCCGGCTTCTTGACGTTGGTGGCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGa < 2:1549296/150‑1 (MQ=255) gACCGGCCGGCTTCTTGACGTTGGTGGCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGa < 1:3030315/150‑1 (MQ=255) ccggcTTCTTGACGTTGGTGGCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCTTTCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGgc < 1:2835728/150‑1 (MQ=255) cggcTTCTTGACGTTGGTGGCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGgcg > 2:1718383/1‑150 (MQ=255) gACGTTGGTGGCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGAc < 1:2141673/150‑1 (MQ=255) gACGTTGGTGGCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGAc < 1:153239/150‑1 (MQ=255) cGTTGGTGGCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCt < 1:1402472/150‑1 (MQ=255) gtggCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTtc > 2:1926830/1‑150 (MQ=255) gCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTcc < 1:1926830/150‑1 (MQ=255) gCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTcc < 2:1390067/150‑1 (MQ=255) gCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCAGGGCTCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTcc > 1:2859899/1‑150 (MQ=255) aTCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCCTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCGGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGCCCTTGTTCTCCTg > 2:214985/1‑150 (MQ=255) gCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGtt > 1:804645/1‑150 (MQ=255) tGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGa < 2:1280973/150‑1 (MQ=255) cTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGaccac > 2:2553042/1‑150 (MQ=255) cTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTGGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTg > 2:2108788/1‑117 (MQ=255) ttCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGtt < 1:142420/124‑1 (MQ=255) ttCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGtt > 2:142420/1‑124 (MQ=255) cccgcGACGCCTGGGCGCACGTACTGCTGCTCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGGTCAGCGAGTCGCTATCCACGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAgg < 2:1349983/146‑1 (MQ=255) aCCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCCCCAgg < 2:2051453/150‑1 (MQ=255) cTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGc > 2:1301239/1‑150 (MQ=255) gACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATTGGCTGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCggt < 1:939501/150‑1 (MQ=255) gACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCggt < 2:787402/150‑1 (MQ=255) aCGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAAGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCggtg < 1:207178/150‑1 (MQ=255) cTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCggtgggtg > 1:323813/1‑150 (MQ=255) tcaagggcgcacccaccgccctggtggtcaaccaggagaacaaggtcgaactgcgccagctcaagGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTgg < 1:309199‑M1/38‑1 (MQ=255) tGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTgc < 2:1699188/150‑1 (MQ=255) tcaagggcgcacccaccgccctggtggtcaaccaggagaacaaggtcgaactgcgccagctcaaggccagtcgctacccaaggtgcggctggcCTTGAGCTgg < 2:309199‑M2/10‑1 (MQ=255) gggCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCtt < 2:2100996/95‑1 (MQ=255) gggCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCtt > 1:2100996/1‑95 (MQ=255) cACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCtt > 2:801217/1‑150 (MQ=255) aCGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGtt > 1:1166880/1‑122 (MQ=255) gTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAg < 2:1058496/150‑1 (MQ=255) acccaccgccctggtggtcaaccaggagaacaaggtcgaactgcgccagctcaagGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCtt > 2:2998204‑M1/56‑86 (MQ=255) acccaccgccctggtggtcaaccaggagaacaaggtcgaactgcgccagctcaagGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCtt < 1:2998204‑M1/31‑1 (MQ=255) aCTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAATGG‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGt < 1:2359092/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTcgcg > 1:241647/1‑150 (MQ=255) aGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCgg < 2:1910212/150‑1 (MQ=255) aGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCgg < 1:2111541/150‑1 (MQ=255) cTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCa > 2:2928258/1‑150 (MQ=255) cTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTAGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCa > 2:2219201/1‑150 (MQ=255) ttCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCtt < 1:1614775/135‑1 (MQ=255) ttCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCAc > 2:2162586/1‑150 (MQ=255) ctCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCAc > 2:1896251/2‑150 (MQ=255) ggTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGcc < 1:732767/150‑1 (MQ=255) gTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTgg > 2:462215/1‑102 (MQ=255) aTCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGtt > 1:2647577/1‑101 (MQ=255) cAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCttgttg < 1:1928441/150‑1 (MQ=255) ccaggagaacaaggtcgaactgcgccagctcaagGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCtt > 1:70932‑M1/35‑65 (MQ=255) aGGCTGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGc < 2:1620408/150‑1 (MQ=255) aGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTgg > 2:1937913/1‑96 (MQ=255) gCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGtt < 1:1564975/96‑1 (MQ=255) gCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGtt > 2:1564975/1‑96 (MQ=255) gCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCgg < 2:241647/150‑1 (MQ=255) aCCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAg < 1:659725/150‑1 (MQ=255) aCCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAg > 1:1014845/1‑150 (MQ=255) aCCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTAACCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCgg < 1:1165345/144‑1 (MQ=255) aCCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTAACCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCgg > 2:1165345/1‑144 (MQ=255) cccGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGc > 2:2489212/1‑133 (MQ=255) ccGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTgcgc > 2:2388870/1‑111 (MQ=255) ccGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGa > 1:526815/1‑150 (MQ=255) ctggTTGAGGGCTTCCTTGATTGGCCAGTGATTACGCCACGT‑GCGGCGTGTCTGGAGCTGGCGCTGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGTGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGAt < 2:344526/148‑1 (MQ=255) gTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGAtggc < 2:2859899/150‑1 (MQ=255) gTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGNGCGCCCNTGAGGTCGCGGGNCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGAtggc < 1:2750071/150‑1 (MQ=255) ttGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCggt > 1:1688700/1‑98 (MQ=255) gAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTTGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGAtggcgtt < 1:2928258/150‑1 (MQ=255) ggCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGAtggcgttgg > 1:1050125/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGAtggcgttggc > 1:2194625/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGAtggcgttggc > 2:723931/1‑150 (MQ=255) gCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTAAGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGTCGGTGGGTGCGCCCTTGATGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGAtggcgttggc < 2:346270/150‑1 (MQ=255) ttCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATggcgttggcgtt < 1:2162586/150‑1 (MQ=255) tCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGc > 1:1975113/1‑126 (MQ=255) ccagctcaagGCCAGCCGC‑ACCTTGGGTAGCGACTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGa < 2:309199‑M1/93‑1 (MQ=255) cTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCgg > 2:1422402/1‑109 (MQ=255) cAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGc < 1:1718383/150‑1 (MQ=255) aaggccagccgcaccttgggtagcgactggcCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTgg < 2:70932‑M2/34‑1 (MQ=255) CCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTTGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCTCCTGTGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGCCtt > 1:1301239‑M1/1‑150 (MQ=255) CCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCa > 2:490576‑M1/1‑122 (MQ=255) CCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCa < 1:490576‑M1/122‑1 (MQ=255) cagccgcaccttgggtagcgactggcCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGCCTTg > 2:63800‑M2/27‑150 (MQ=255) GTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAggg < 2:2327788‑M1/71‑1 (MQ=255) GTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAggg > 1:2327788‑M1/1‑71 (MQ=255) cAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGAtggc > 1:1658704/1‑117 (MQ=255) cAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGAtggc < 2:1658704/117‑1 (MQ=255) cAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGCCTTGAGCCGCGCATg > 1:960451/1‑150 (MQ=255) aaGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGCCTTGAGCCGCGCATGc > 2:2601662/1‑150 (MQ=255) aGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGCCTTGAGCCGCGCATGCa < 1:801217/150‑1 (MQ=255) ggT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGCCTTGAGCCGCGCATGCAc < 2:2249474/150‑1 (MQ=255) gCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGcc > 1:829789/1‑127 (MQ=255) gCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGcc < 2:829789/127‑1 (MQ=255) tggcCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCggt < 1:1752736‑M2/51‑1 (MQ=255) tggcCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGCCTTGAGCCGCGCATGCACGAACATGc < 1:723931‑M2/146‑1 (MQ=255) gcCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGCCTTGAGCCGCGCATGCACGAACATGCCt < 2:526815‑M2/148‑1 (MQ=255) cCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGCCTTGAGCCGCGCa > 2:202320‑M2/2‑134 (MQ=255) cTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCggtgggt > 1:2414802/1‑55 (MQ=255) cTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCggtgggt < 2:2414802/55‑1 (MQ=255) cTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCg < 1:828343/89‑1 (MQ=255) cTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCg > 2:828343/1‑89 (MQ=255) | AGGACCGGCCGGCTTCTTGACGTTGGTGGCATCGCTGACCTTCACCTCGACGCCTGGGCGCACGTACTGCAGCCCTTCGGTGATCAGGCGGTCACCCGGGTTGAGGCCTTCCTCGATCAGCCAGTCGCTACCCAAGGT‑GCGGCTGGCCTTGAGCTGGCGCAGTTCGACCTTGTTCTCCTGGTTGACCACCAGGGCGGTGGGTGCGCCCTTGAGGTCGCGGGTCACGCCTTGTTGCGGTGCCAGGATGGCGTTGGCGTTGACCCCGGCCTTGAGCCGCGCATGCACGAACATGCCT > NC_002947/1581484‑1581778 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |