| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | = 1768942 | 93 (0.810) | 5 (0.050) | 5/232 | NT | 5.1% | coding (25/381 nt) | PP_5475 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 1768952 | 97 (0.890) | coding (35/381 nt) | PP_5475 | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TCCGTTACGGCTGCCCAGGTCTCGGTGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGAAGAGATGATCCAGA > NC_002947/1768808‑1769101 | tCCGTTACGGCTGCCCAGGTCTCGGTGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCCATGCCCGCGACCTCAACGTAGTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGGCGCCTACGTcgagg > 1:2675147‑M2/1‑145 (MQ=255)tCCGTTACGGCTGCCCAGGTCTCGGTGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGGCGCCTACGTcgagg > 1:1245272‑M2/1‑145 (MQ=255) ggTTACGGCTGCCCAGGTCTCGGTGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGGCCCCTACGTCGAGggc > 2:2107594/2‑150 (MQ=255) gTTACGGCTGCCCAGGTCTCGGTGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGggcg < 2:73089/150‑1 (MQ=255) aCGGCTGCCCAGGTCTCGGTGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGcc < 1:603215/150‑1 (MQ=255) ggCTGCCCAGGTCTCGGTGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGa < 2:2742560/150‑1 (MQ=255) ggCTGCCCAGGTCTCGGTGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCCCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGa > 1:424059/1‑150 (MQ=255) cccAGGTCTCGGTGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACtgtg < 2:1454017/150‑1 (MQ=255) cAGGTCTCGGTGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGc < 2:2356741/150‑1 (MQ=255) cAGGTCTCGGTGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCGATGAACATCGATAAATACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGc < 1:2679687/150‑1 (MQ=255) tGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGACGTAGGCGCcgagggtgtatttatcgatgttcata > 1:1394642‑M2/1‑120 (MQ=255) taCCGCCTGCGACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAGCCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGTCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGAc < 1:2930030/149‑1 (MQ=255) cgccgGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGc > 2:382825/1‑150 (MQ=255) 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(MQ=255) tAAATACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGAt < 1:2313376/123‑1 (MQ=255) tAAATACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGAt > 2:2313376/1‑123 (MQ=255) aTACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGa > 2:2241466/1‑72 (MQ=255) aTACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGa < 1:2241466/72‑1 (MQ=255) aTACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTgg < 1:268099/112‑1 (MQ=255) aTACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTgg > 2:268099/1‑112 (MQ=255) aTACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGcgcg < 1:933092/147‑1 (MQ=255) aTACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGcgcg > 2:933092/1‑147 (MQ=255) acCCTCGGCGCCTACGTcgagggtgtatttatcgatgttcataggtagcgcagccctgggaattcgttgaggttgtacgtattgcgtggccaccgggtatcgagcaggtcgaagtagccggcggtcaccgagacctgggcagccgtaacg < 2:1973258‑M2/150‑134 (MQ=255) acCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGc > 1:2605877/1‑150 (MQ=255) ccTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGa > 2:1233877/1‑150 (MQ=255) cTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGTGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGaa > 1:2226715/1‑150 (MQ=255) ccGGCCCCTACGTCGAGGGCGGCCGCCTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGTCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGAag < 2:1358465/149‑1 (MQ=255) cGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGTGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGAaga < 2:2226715/150‑1 (MQ=255) ccTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGGTGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGAAGAgatga < 1:663355/150‑1 (MQ=255) cTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTg < 2:2155399/96‑1 (MQ=255) cTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTg > 1:2155399/1‑96 (MQ=255) taagTCGAAGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGATACGGGCGGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGAAGCGCGAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGGAGAGATGATc > 2:507360/4‑150 (MQ=255) tACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGAAGAGATGATc > 1:1611084/1‑150 (MQ=255) tACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGAAGAGATGATc < 2:873700/150‑1 (MQ=255) cGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGAAGAGATGATCCa < 1:1043407/150‑1 (MQ=255) gTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGAAGAGATGATCCAg > 1:50629/1‑150 (MQ=255) tCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGAAGAGATGATCCAGa < 1:327739/150‑1 (MQ=255) tCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGAGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGAAGAGATGATCCAGa > 2:727035/1‑150 (MQ=255) | TCCGTTACGGCTGCCCAGGTCTCGGTGACCGCCGGCTACTTCGACCTGCTCGATACCCGGTGGCCACGCAATACGTACAACCTCAACGAATTCCCAGGGCTGCGCTACCTATGAACATCGATAAATACACCCTCGGCGCCTACGTCGAGGGCGGCCGACTGTGGCCGCATGTCGACTGCTACGGGCTGGTGCTGGAGGTTCGGCGCGACCTGGGCTTGCCGGACTGGCCGGAGTGGGCAGAGATGCGCAAGGCGGATGGCGGCTTTGCGCGGGCCTGCGAAGAGATGATCCAGA > NC_002947/1768808‑1769101 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |