| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 2262205 = | 82 (0.720) | 7 (0.070) | 6/228 | NT | 8.9% | intergenic (+14/‑124) | fimV/truA | motility protein FimV/tRNA pseudouridine (38‑40)synthase |
| ? | NC_002947 | 2262242 = | 66 (0.620) | intergenic (+51/‑87) | fimV/truA | motility protein FimV/tRNA pseudouridine (38‑40)synthase | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGAAGGCTACTCCCGCAT > NC_002947/2262098‑2262390 | ccAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCa > 1:1276608/1‑150 (MQ=255) cAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCAt > 2:1911396/1‑150 (MQ=255) caagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcaagcaggtcaGGCCTCTTGGCTGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTgc > 2:1814912‑M1/100‑150 (MQ=255) gcgcgACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTgcg > 1:1074200/1‑150 (MQ=255) gcgcgACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTgcg > 1:2826269/1‑150 (MQ=255) gtccaagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgggcctcttggcgggctgaccgcgcccgcgaagaggccCG‑‑C‑GCATGCa > 1:2848127‑M2/137‑146 (MQ=255) gtccaagagcatgaaacctgtggggtgtacggaatggcggggattataacgacaacggcagcctcgtagggctgccgctgattgcgcactgcatgcgcgggcctcttggcgggctgaccgcgcccgcgaagaggccCG‑‑C‑GCATGCa < 2:2848127‑M2/10‑1 (MQ=255) gccATACTCGACGCAGTGGTCACGCATTGCGTCGACAGCTAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCACTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCGCTTGGCGGGCTGACCT‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAAt < 2:662885/148‑1 (MQ=255) ccTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTgc < 2:66385/140‑1 (MQ=255) ccTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTgc > 1:66385/1‑140 (MQ=255) cTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCgg < 1:1627782/150‑1 (MQ=255) cTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCgg > 1:1183074/1‑150 (MQ=255) cgacgaAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGAAAGCAGGTCAGGCCTCCTTGCTGGCTGACGG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCa < 1:1911396/150‑1 (MQ=255) ggTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGa < 2:1074200/150‑1 (MQ=255) aaGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGa > 1:1610936/1‑146 (MQ=255) aaGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGa < 2:1610936/146‑1 (MQ=255) aaGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCt > 1:135569/1‑150 (MQ=255) ggATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGc > 2:412692/1‑131 (MQ=255) ggATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGc < 1:412692/131‑1 (MQ=255) ggATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAg > 2:2498881/1‑145 (MQ=255) ggATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAg < 1:2498881/145‑1 (MQ=255) ggCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGtt < 2:1276608/150‑1 (MQ=255) cgacAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGt < 2:2714068/150‑1 (MQ=255) gacAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGtt > 1:149196/1‑150 (MQ=255) agccagcGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTtata < 2:149196/150‑1 (MQ=255) ccagcGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAAt > 2:1907751/1‑150 (MQ=255) gcGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATccc < 2:2324552/150‑1 (MQ=255) cttCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATcccc < 2:2996125/148‑1 (MQ=255) gAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCAtt > 1:1689167/1‑150 (MQ=255) gCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCg < 1:154228/150‑1 (MQ=255) ccGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGt > 1:1417614/1‑150 (MQ=255) ccGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGt > 1:2342460/1‑150 (MQ=255) cGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTa < 2:1183074/150‑1 (MQ=255) aCATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACAccc > 1:2015742/1‑150 (MQ=255) aTGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGcc < 2:2431942/114‑1 (MQ=255) aTGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGcc > 1:2431942/1‑114 (MQ=255) aTGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCca > 2:1432491/1‑150 (MQ=255) aTGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCca > 2:1501599/1‑150 (MQ=255) tctcCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTTCGTACACCCCACAgg > 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ccGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTc < 2:2826269/150‑1 (MQ=255) cGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GGCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCa < 1:504901/150‑1 (MQ=255) tGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACATGTTTCATGct > 2:1405947/1‑150 (MQ=255) gTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGctct > 1:2418067/1‑150 (MQ=255) gTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTCTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGctct < 2:1207232/150‑1 (MQ=255) 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tcttcgcgggcgcggtcagcccgccaagaggccCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTc > 2:1922117‑M2/34‑82 (MQ=255) tcttcgcgggcgcggtcagcccgccaagaggccCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTc < 1:1922117‑M2/49‑1 (MQ=255) tcttcgcgggcgcggtcagcccgccaagaggccCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCg < 1:1534051‑M2/112‑1 (MQ=255) tcttcgcgggcgcggtcagcccgccaagaggccCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCg > 2:1534051‑M2/34‑145 (MQ=255) TTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTc > 2:2077426‑M1/1‑99 (MQ=255) TTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTc < 1:2077426‑M1/99‑1 (MQ=255) TGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTAccgcc > 2:2790610‑M1/1‑150 (MQ=255) gggCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAAt > 1:866578/1‑150 (MQ=255) cTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCcg < 1:1109560/150‑1 (MQ=255) tGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCcgc > 2:2269177/1‑150 (MQ=255) gcCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGaa < 1:609053/150‑1 (MQ=255) gcCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGaa < 1:2269177/150‑1 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGaa < 2:2133717/148‑1 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGaa > 1:2133717/1‑148 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGAAgg > 2:1196469/1‑150 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGAAg < 1:621933/149‑1 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGAAg > 2:621933/1‑149 (MQ=255) ccGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCAAACTCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGAAgg < 1:2860703/150‑1 (MQ=255) agaggccCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCcgcg > 2:144953‑M2/8‑136 (MQ=255) agaggccCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCcgcg < 1:144953‑M2/129‑1 (MQ=255) ggccCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGAAGGCTACTCCCg < 2:2070633‑M2/146‑1 (MQ=255) gccCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCGCAGGTTTCATGCTCTTGGACatcatc < 2:2580869‑M2/105‑1 (MQ=255) gccCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCGCAGGTTTCATGCTCTTGGACatcatc > 1:2580869‑M2/4‑108 (MQ=255) gccCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGAAGGCTACTccc > 1:60226‑M2/4‑148 (MQ=255) gccCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGAAGGCTACTccc < 2:60226‑M2/145‑1 (MQ=255) cCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACatcatc > 1:872283‑M2/2‑106 (MQ=255) cCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACatcatc < 2:872283‑M2/105‑1 (MQ=255) cCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGAAGGCTACTCCCGCAt > 1:2669619‑M2/2‑150 (MQ=255) | CCAGGGCGCGCGCGACATCCTCGACGAAGTGGTCAAGGATGGCGACGACAGCCAGCGTCAGGAAGCCGAGGACATGCTCTCCCGGCTGGTCTGATGCAAGCAGGTCAGGCCTCTTGGCGGGCTGACCG‑C‑GCCCGCGAAGAGGCCCG‑‑C‑GCATGCAGTGCGCAATCAGCGGCAGCCCTACGAGGCTGCCGTTGTCGTTATAATCCCCGCCATTCCGTACACCCCACAGGTTTCATGCTCTTGGACATCATCGACACCGCTACCGCCGAATCCGCGGCCGAAGGCTACTCCCGCAT > NC_002947/2262098‑2262390 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |