New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_002947 | 2423036 = | 90 (0.820) | coding (1183/1248 nt) | PP_2124 | glycosyl transferase |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
CTGGGCGGAGGGCCTGGTGGAAGTGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTGCCATTCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAATGCCAGTTGATCACCGT > NC_002947/2422889‑2423185 | cTGGGCGGAGGGCCTGGTGGAAGTGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTGCCATTCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCa > 1:945176/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGGAGGGCCTGGTGGAAGTGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTGCCATTCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCa > 2:169470/1‑150 (MQ=255) tGGGCGGAGGGCCTGGTGGAAGTGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTGCCATTCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAg < 2:537338/150‑1 (MQ=255) ggCGGAGGGCCTGGTGGAAGTGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTGCCATTCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGc < 1:637223/150‑1 (MQ=255) ggCGGAGGGCCTGGTGGAAGTGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTGCCATTCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGc < 1:2427860/150‑1 (MQ=255) ggAGGGCCTGGTGGAAGTGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTGCCATTCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTa < 2:2070916/150‑1 (MQ=255) ggAGGGCCTGGTGGAAGTGCGTGAAGGCAGCACGACGAAGCAGGACGACATCGTGCCATTCATCACCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGGCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTa > 1:454271/1‑150 (MQ=255) ggAGGGCCTGGTGGAAGGGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTGACATTCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCAAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTa < 2:1034824/150‑1 (MQ=255) cgatcTGGTGGAAGTGCGCCAACGCAGCACACAGAAGCAGGGCGACATCGTGCCATTCACCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTAtgt < 2:1352197/146‑1 (MQ=255) gCCTGGTGGAAGTGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTGCCATTCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGc < 2:802773/150‑1 (MQ=255) gCCTGGTGGAAGTGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTGCCATTCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGc < 2:2890025/150‑1 (MQ=255) ccTGGTGGAAGTGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTGCCATTCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGca > 1:2952353/1‑150 (MQ=255) gtggAAGTGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTTCCATCCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGCCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACAtt < 2:85556/150‑1 (MQ=255) 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cAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTgg < 2:402348/64‑1 (MQ=255) cAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGagcag < 1:1748891/150‑1 (MQ=255) ggcgcggcCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTgg < 2:670901/150‑1 (MQ=255) ggcgcggcCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTgg < 1:2018591/150‑1 (MQ=255) ggcgcggcCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGCCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTgg < 1:692796/150‑1 (MQ=255) ggcgcggcCTCGTCAGGTGCTGCGTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTgg < 1:1242700/150‑1 (MQ=255) cgcggcCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGt < 2:120761/150‑1 (MQ=255) ggcCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGAt < 1:1502417/150‑1 (MQ=255) gcCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATc > 2:419971/1‑150 (MQ=255) cTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAg < 1:1365162/150‑1 (MQ=255) gTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGc < 2:2567244/110‑1 (MQ=255) gTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGc > 1:2567244/1‑110 (MQ=255) tCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAAt < 2:1393974/150‑1 (MQ=255) tCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAAt < 1:240880/150‑1 (MQ=255) cgaggccgcgTGGGTCCGGAGTATGTGCACCATCCCCAGCTGTTGGGCAGCCACGAACCAGTCGTGGCGCCGGCAGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAATGc < 2:2172793/146‑1 (MQ=255) cGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAATGc > 1:1603481/1‑150 (MQ=255) tGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTAATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAATGCCAg < 2:2921836/150‑1 (MQ=255) gccgccTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAATGCCAGt < 2:1603481/150‑1 (MQ=255) ccgccTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTTGGTGATCAGCAATGCCAGtt > 2:715793/1‑150 (MQ=255) cgccTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAATGCCAGt > 2:2220980/1‑148 (MQ=255) cgccTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAATGCCAGt < 1:2220980/148‑1 (MQ=255) ccTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAATGCCAGTTGAt < 1:128872/150‑1 (MQ=255) gggTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTCGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAATGCCAGTTGATCAc < 1:426122‑M2/147‑1 (MQ=255) tCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCt < 2:73665/108‑1 (MQ=255) tCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCt > 1:73665/1‑108 (MQ=255) tCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAATGCCAGTTGATCACcgt > 1:2038745/1‑150 (MQ=255) | CTGGGCGGAGGGCCTGGTGGAAGTGCGTGAAGGCAGCACGCCGAAGCAGGGCGACATCGTGCCATTCATCCCCTTCAGCGAGCTACTTGGCTGAGCGGCCCAGCCAGGCACTGGCCAGCGGCGCGGCCTCGTCCGGTGCCGCCTGGGTCAGGCGTATGTGCACATTCTCCAGTTGTTGGGCAGCCACGCTCCAGTCGTGGCGCTGGCGGGCAAACTGGCGCCCGGCATCGCTCAACTGGCTCATGCGCCAGGGCTGATTGAGCAGCTGGGTGATCAGCAATGCCAGTTGATCACCGT > NC_002947/2422889‑2423185 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |