New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2577157 = | 100 (0.870) | 9 (0.090) | 8/222 | NT | 9.9% | coding (1281/1776 nt) | PP_2259 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
? | NC_002947 | 2577227 = | 73 (0.700) | coding (1211/1776 nt) | PP_2259 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCGGGATCGCCGCACAGTTT > NC_002947/2577078‑2577376 | gAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCa > 1:1033013/1‑150 (MQ=255) gAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCa > 1:340292/1‑150 (MQ=255) cgcccaccacaagggcaacccgggactgatccgcaaggccgaccacggcatcctgtttctggatgagattggcgacatGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCAt > 1:2302821‑M1/79‑150 (MQ=255) aGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGt > 2:1844818/1‑150 (MQ=255) gcCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTACAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGc > 1:2558649/1‑150 (MQ=255) cACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATc < 1:1682992/150‑1 (MQ=255) aCTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATcc < 1:267218/150‑1 (MQ=255) tcgGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAAc < 2:229813/150‑1 (MQ=255) cgGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACa < 1:2443052/150‑1 (MQ=255) tGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGt > 1:2909179/1‑150 (MQ=255) gATTGCTAGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGt > 1:2842016/1‑150 (MQ=255) aTTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTc < 2:2909179/150‑1 (MQ=255) ttGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCg > 2:2415051/1‑150 (MQ=255) cTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACGGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGAGGGCCTGGGCGGGCAAAGGCATGCCGGCAAGCTCATCCAGAAACAGGATGCCCTGGTCGGcc > 2:2199498/1‑150 (MQ=255) tCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCt > 2:124588/1‑150 (MQ=255) tCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCt > 1:1353988/1‑150 (MQ=255) gCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTg > 1:952485/1‑150 (MQ=255) ccGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc > 1:912668/1‑150 (MQ=255) ccGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc > 2:492061/1‑150 (MQ=255) acacCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGa < 2:2982702/150‑1 (MQ=255) caccacGCGGATACCCACCGGAACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCGCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCTGAt < 2:580682/150‑1 (MQ=255) cacGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATg > 2:527595/1‑127 (MQ=255) cacGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATg < 1:527595/127‑1 (MQ=255) acGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGt > 2:1626842/1‑150 (MQ=255) cgcgGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTc > 1:1498232/1‑150 (MQ=255) ggATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCg > 1:2134111/1‑150 (MQ=255) gATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCgg < 1:2429280/150‑1 (MQ=255) gATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGACTTGCGGATCAGTCCCgg < 2:1663548/150‑1 (MQ=255) atatCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCggg < 1:124588/150‑1 (MQ=255) atatCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTACAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCggg < 2:2558649/150‑1 (MQ=255) accggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc < 2:1538100/130‑1 (MQ=255) accggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc > 1:1538100/1‑130 (MQ=255) accggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGccc < 1:1554879/150‑1 (MQ=255) accggcaccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGccc > 2:733738/1‑150 (MQ=255) caccggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTtgtg < 1:733738/150‑1 (MQ=255) accggTTCGCCACTGCTCAGCGGCTGGATGCTGCGGG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGCCGGGCCTGGTTTGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCCGATCAGGCCCGGGAGGCCCATgtgg > 2:2437885/1‑150 (MQ=255) cgggccGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTgtggtg < 2:2473567/145‑1 (MQ=255) cggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTgtggtg > 2:2834181/1‑150 (MQ=255) cggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTgtggtg < 1:184980/150‑1 (MQ=255) ggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGtggtgg < 1:1432077/150‑1 (MQ=255) ggTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGtggtgg < 2:1353988/150‑1 (MQ=255) ttCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGgc < 1:2834181/150‑1 (MQ=255) ttCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGgc < 2:2942872/150‑1 (MQ=255) atgccactgcccacccaggcccgcctgctgcgcgtactgcagtcgcgcagcatccagccgctgggcagtggcATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGgcg > 1:2302821‑M2/73‑150 (MQ=255) GCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGcc < 2:622694‑M1/150‑1 (MQ=255) CCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCg > 1:622694‑M1/1‑150 (MQ=255) ccactgcccacccaggcccgcctgctgcgcgtactgcagtcgcgcagcatccagccgctgggcagtggcATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCg > 1:956225‑M2/70‑150 (MQ=255) ccactgcccacccaggcccgcctgctgcgcgtactgcagtcgcgcagcatccagccgctgggcagtggcATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCg > 2:1373495‑M2/70‑150 (MQ=255) CACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCa > 2:2477029‑M1/1‑83 (MQ=255) CACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCgg < 2:3063096‑M1/150‑1 (MQ=255) ACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCg < 2:1681866‑M1/148‑1 (MQ=255) ACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCg > 1:1681866‑M1/1‑148 (MQ=255) ACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGt < 1:588161‑M1/150‑1 (MQ=255) ACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGt < 1:1342872‑M1/150‑1 (MQ=255) actgcccacccaggcccgcctgctgcgcgtactgcagtcgcgcagcatccagccgctgggcagtggcATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGt > 1:1385818‑M2/68‑150 (MQ=255) CCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAAcg < 1:308063‑M1/150‑1 (MQ=255) AGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGAt < 1:574557‑M1/110‑1 (MQ=255) AGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGAt > 2:574557‑M1/1‑110 (MQ=255) acccaggcccgcctgctgcgcgtactgcagtcgcgcagcatccagccgctgggcagtggcATGTCGCCAATCTCATCCTTTGGTATGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAAcgcg > 1:1725684‑M2/61‑150 (MQ=255) cGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGcc < 1:1966645/150‑1 (MQ=255) gATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGTGGGCCTAAGAGGGCAGAGGAGCGGCACCAAGCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTc > 1:56326/1‑150 (MQ=255) 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cAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTc > 1:1293342/1‑150 (MQ=255) aGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCa > 1:1289259/1‑51 (MQ=255) aGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCa < 2:1289259/51‑1 (MQ=255) aGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTcc < 1:2752072/150‑1 (MQ=255) aGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTcc < 2:2125653/150‑1 (MQ=255) gtcgcgcagcatccagccgctgggcagtggcATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTc > 2:314564‑M2/32‑150 (MQ=255) gcgcAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGaa > 1:1265410/1‑138 (MQ=255) gcgcAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGaa < 2:1265410/138‑1 (MQ=255) gcagcaGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTcca > 2:708323/1‑150 (MQ=255) gcagcaGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTcca > 2:2237580/1‑150 (MQ=255) gcagcaGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTcc < 2:222150/149‑1 (MQ=255) gcagcaGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTcc > 1:222150/1‑149 (MQ=255) cagcagGCGGGCCTGGGTGGGGAGTGGCAGGTCGCAAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGAGCAGTCCCGGGTGGCCCGTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCGTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTccac < 2:340292/150‑1 (MQ=255) cagcagGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTccac < 1:1626842/150‑1 (MQ=255) cgcagcatccagccgctgggcagtggcATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATCGCCGAACAGTTCCGACTccacc < 2:1725684‑M2/123‑1 (MQ=255) cagGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAg > 2:1397513/1‑150 (MQ=255) gggCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCTCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCgg > 2:1391736/1‑150 (MQ=255) gggCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCgg > 2:2343187/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGtt > 2:522505/1‑128 (MQ=255) cTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCgg > 1:2301992/1‑150 (MQ=255) cTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGCCCgt < 2:3061201/150‑2 (MQ=255) ggtgggCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCgg < 2:1877082/147‑1 (MQ=255) gggcagtggcATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCGGGATcgc < 1:3063096‑M2/140‑1 (MQ=255) gcagtggcATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc < 2:1763297‑M2/46‑1 (MQ=255) gcagtggcATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGc > 1:1763297‑M2/9‑54 (MQ=255) agtggcATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCGGGATCGCCGca > 2:1705873‑M2/7‑150 (MQ=255) aTGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCGGGATCGCCGCACAGttt > 1:2399659/1‑150 (MQ=255) | GAAAGCGCCCGGCGCGCACTTCGTCGGCCAGGTTGCGATTGCTCGCCGACACCACGCGGATATCCACCGGCACCGGTTCGCCACTGCCCAGCGGCTGGATGCTGCGCG‑ACTGCAGTACGCGCAGCAGGCGGGCCTGGGTGGGCAGTGGCATGTCGCCAATCTCATCCAGAAACAGGATGCCGTGGTCGGCCTTGCGGATCAGTCCCGGGTTGCCCTTGTGGTGGGCGCCGGTGAACGCGCCTTTGTCATAGCCGAACAGTTCCGACTCCACCAGTTCGGCCGGGATCGCCGCACAGTTT > NC_002947/2577078‑2577376 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |